Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

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Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZNF56Q15929 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ZNF56Q15929 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF56Q15929 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ZNF56Q15929 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ZNF56Q15929 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF56Q15929 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF56Q15929 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF56Q15929 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ZNF56Q15929 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF56Q15929 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF56Q15929 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ZNF56Q15929 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF56Q15929 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF56Q15929 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF56Q15929 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ZNF56Q15929 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF56Q15929 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ZNF56Q15929 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF56Q15929 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ZNF56Q15929 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF56Q15929 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ZNF56Q15929 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF56Q15929 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNF56Q15929 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF56Q15929 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF56Q15929 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF56Q15929 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF56Q15929 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNF56Q15929 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF56Q15929 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF56Q15929 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNF56Q15929 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF56Q15929 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ZNF56Q15929 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF56Q15929 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF56Q15929 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ZNF56Q15929 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ZNF56Q15929 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZNF56Q15929 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZNF56Q15929 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZNF56Q15929 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ZNF56Q15929 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZNF56Q15929 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ZNF56Q15929 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZNF56Q15929 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZNF56Q15929 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZNF56Q15929 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ZNF56Q15929 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZNF56Q15929 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZNF56Q15929 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZNF56Q15929 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZNF56Q15929 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ZNF56Q15929 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZNF56Q15929 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZNF56Q15929 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZNF56Q15929 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
ZNF56Q15929 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
ZNF56Q15929 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ZNF56Q15929 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ZNF56Q15929 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNF56Q15929 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNF56Q15929 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ZNF56Q15929 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF56Q15929 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF56Q15929 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZNF56Q15929 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF56Q15929 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZNF56Q15929 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF56Q15929 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF56Q15929 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF56Q15929 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZNF56Q15929 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZNF56Q15929 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZNF56Q15929 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF56Q15929 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ZNF56Q15929 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF56Q15929 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZNF56Q15929 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF56Q15929 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF56Q15929 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF56Q15929 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF56Q15929 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZNF56Q15929 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF56Q15929 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF56Q15929 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF56Q15929 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF56Q15929 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZNF56Q15929 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF56Q15929 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF56Q15929 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF56Q15929 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ZNF56Q15929 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZNF56Q15929 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ZNF56Q15929 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ZNF56Q15929 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ZNF56Q15929 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF56Q15929 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF56Q15929 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ZNF56Q15929 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
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