Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

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Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF56Q15929 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF56Q15929 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF56Q15929 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF56Q15929 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF56Q15929 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF56Q15929 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF56Q15929 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF56Q15929 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF56Q15929 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF56Q15929 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF56Q15929 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF56Q15929 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF56Q15929 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF56Q15929 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF56Q15929 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF56Q15929 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF56Q15929 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF56Q15929 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF56Q15929 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF56Q15929 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF56Q15929 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF56Q15929 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF56Q15929 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF56Q15929 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF56Q15929 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF56Q15929 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF56Q15929 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF56Q15929 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF56Q15929 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF56Q15929 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF56Q15929 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF56Q15929 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF56Q15929 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF56Q15929 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF56Q15929 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF56Q15929 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF56Q15929 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF56Q15929 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF56Q15929 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF56Q15929 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF56Q15929 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF56Q15929 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF56Q15929 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF56Q15929 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF56Q15929 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF56Q15929 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF56Q15929 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF56Q15929 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF56Q15929 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF56Q15929 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF56Q15929 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF56Q15929 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF56Q15929 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF56Q15929 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF56Q15929 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF56Q15929 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF56Q15929 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF56Q15929 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF56Q15929 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF56Q15929 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF56Q15929 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF56Q15929 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF56Q15929 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF56Q15929 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF56Q15929 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF56Q15929 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF56Q15929 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF56Q15929 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF56Q15929 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF56Q15929 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF56Q15929 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF56Q15929 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZNF56Q15929 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF56Q15929 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF56Q15929 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF56Q15929 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF56Q15929 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF56Q15929 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF56Q15929 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF56Q15929 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF56Q15929 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF56Q15929 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF56Q15929 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF56Q15929 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZNF56Q15929 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ZNF56Q15929 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNF56Q15929 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF56Q15929 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNF56Q15929 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNF56Q15929 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNF56Q15929 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF56Q15929 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF56Q15929 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF56Q15929 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF56Q15929 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF56Q15929 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF56Q15929 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZNF56Q15929 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
ZNF56Q15929 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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