Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KRT9P35527 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KRT9P35527 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KRT9P35527 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
KRT9P35527 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
KRT9P35527 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KRT9P35527 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KRT9P35527 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KRT9P35527 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KRT9P35527 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KRT9P35527 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KRT9P35527 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KRT9P35527 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KRT9P35527 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KRT9P35527 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KRT9P35527 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KRT9P35527 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KRT9P35527 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KRT9P35527 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KRT9P35527 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KRT9P35527 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
KRT9P35527 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KRT9P35527 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KRT9P35527 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KRT9P35527 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KRT9P35527 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KRT9P35527 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
KRT9P35527 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
KRT9P35527 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
KRT9P35527 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KRT9P35527 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KRT9P35527 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KRT9P35527 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KRT9P35527 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
KRT9P35527 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
KRT9P35527 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KRT9P35527 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KRT9P35527 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
KRT9P35527 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KRT9P35527 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KRT9P35527 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KRT9P35527 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
KRT9P35527 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KRT9P35527 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KRT9P35527 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KRT9P35527 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KRT9P35527 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KRT9P35527 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KRT9P35527 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KRT9P35527 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KRT9P35527 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KRT9P35527 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KRT9P35527 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KRT9P35527 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KRT9P35527 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
KRT9P35527 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KRT9P35527 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KRT9P35527 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KRT9P35527 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KRT9P35527 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KRT9P35527 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KRT9P35527 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KRT9P35527 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KRT9P35527 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KRT9P35527 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KRT9P35527 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KRT9P35527 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KRT9P35527 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KRT9P35527 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KRT9P35527 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KRT9P35527 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KRT9P35527 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KRT9P35527 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
KRT9P35527 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KRT9P35527 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KRT9P35527 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KRT9P35527 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KRT9P35527 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KRT9P35527 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
KRT9P35527 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KRT9P35527 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KRT9P35527 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KRT9P35527 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KRT9P35527 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
KRT9P35527 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KRT9P35527 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KRT9P35527 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KRT9P35527 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KRT9P35527 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KRT9P35527 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KRT9P35527 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KRT9P35527 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KRT9P35527 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KRT9P35527 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KRT9P35527 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
KRT9P35527 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KRT9P35527 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KRT9P35527 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KRT9P35527 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KRT9P35527 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms