Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPA3P35244 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPA3P35244 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPA3P35244 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPA3P35244 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPA3P35244 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPA3P35244 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPA3P35244 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPA3P35244 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPA3P35244 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPA3P35244 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPA3P35244 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RPA3P35244 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RPA3P35244 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPA3P35244 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPA3P35244 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPA3P35244 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPA3P35244 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPA3P35244 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPA3P35244 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPA3P35244 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPA3P35244 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RPA3P35244 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPA3P35244 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPA3P35244 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPA3P35244 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPA3P35244 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPA3P35244 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPA3P35244 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPA3P35244 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPA3P35244 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPA3P35244 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPA3P35244 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPA3P35244 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPA3P35244 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPA3P35244 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPA3P35244 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPA3P35244 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPA3P35244 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPA3P35244 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPA3P35244 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RPA3P35244 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RPA3P35244 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RPA3P35244 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RPA3P35244 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPA3P35244 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPA3P35244 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPA3P35244 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPA3P35244 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPA3P35244 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPA3P35244 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPA3P35244 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPA3P35244 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RPA3P35244 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPA3P35244 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RPA3P35244 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPA3P35244 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPA3P35244 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RPA3P35244 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPA3P35244 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPA3P35244 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPA3P35244 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPA3P35244 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPA3P35244 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPA3P35244 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPA3P35244 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPA3P35244 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPA3P35244 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPA3P35244 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPA3P35244 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPA3P35244 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPA3P35244 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPA3P35244 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPA3P35244 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPA3P35244 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RPA3P35244 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RPA3P35244 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RPA3P35244 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPA3P35244 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RPA3P35244 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPA3P35244 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPA3P35244 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPA3P35244 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPA3P35244 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPA3P35244 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPA3P35244 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RPA3P35244 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPA3P35244 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPA3P35244 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPA3P35244 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPA3P35244 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPA3P35244 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPA3P35244 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPA3P35244 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPA3P35244 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPA3P35244 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPA3P35244 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPA3P35244 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPA3P35244 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPA3P35244 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms