Protein–RNA interactions for Protein: P18846

ATF1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF1P18846 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATF1P18846 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATF1P18846 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ATF1P18846 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATF1P18846 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATF1P18846 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATF1P18846 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATF1P18846 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATF1P18846 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATF1P18846 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATF1P18846 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATF1P18846 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATF1P18846 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATF1P18846 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATF1P18846 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATF1P18846 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATF1P18846 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATF1P18846 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATF1P18846 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF1P18846 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF1P18846 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF1P18846 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF1P18846 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF1P18846 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATF1P18846 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATF1P18846 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATF1P18846 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATF1P18846 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATF1P18846 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATF1P18846 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATF1P18846 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATF1P18846 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF1P18846 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF1P18846 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATF1P18846 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATF1P18846 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ATF1P18846 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATF1P18846 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATF1P18846 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATF1P18846 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATF1P18846 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF1P18846 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF1P18846 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF1P18846 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF1P18846 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF1P18846 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF1P18846 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF1P18846 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF1P18846 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF1P18846 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF1P18846 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF1P18846 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF1P18846 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF1P18846 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF1P18846 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF1P18846 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATF1P18846 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF1P18846 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF1P18846 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF1P18846 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATF1P18846 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF1P18846 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATF1P18846 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF1P18846 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF1P18846 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATF1P18846 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF1P18846 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF1P18846 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF1P18846 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF1P18846 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF1P18846 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF1P18846 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF1P18846 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF1P18846 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF1P18846 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF1P18846 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF1P18846 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF1P18846 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF1P18846 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF1P18846 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF1P18846 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF1P18846 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF1P18846 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF1P18846 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF1P18846 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF1P18846 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF1P18846 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF1P18846 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATF1P18846 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATF1P18846 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATF1P18846 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF1P18846 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF1P18846 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF1P18846 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF1P18846 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATF1P18846 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF1P18846 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF1P18846 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF1P18846 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATF1P18846 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms