Protein–RNA interactions for Protein: P0CG47

UBB, Polyubiquitin-B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBBP0CG47 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBBP0CG47 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBBP0CG47 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBBP0CG47 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBBP0CG47 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBBP0CG47 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBBP0CG47 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
UBBP0CG47 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBBP0CG47 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBBP0CG47 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBBP0CG47 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
UBBP0CG47 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBBP0CG47 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBBP0CG47 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBBP0CG47 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBBP0CG47 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBBP0CG47 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBBP0CG47 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBBP0CG47 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBBP0CG47 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBBP0CG47 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBBP0CG47 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBBP0CG47 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBBP0CG47 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBBP0CG47 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBBP0CG47 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
UBBP0CG47 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBBP0CG47 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBBP0CG47 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBBP0CG47 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBBP0CG47 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBBP0CG47 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBBP0CG47 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBBP0CG47 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBBP0CG47 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBBP0CG47 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBBP0CG47 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBBP0CG47 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBBP0CG47 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBBP0CG47 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBBP0CG47 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBBP0CG47 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBBP0CG47 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBBP0CG47 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBBP0CG47 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBBP0CG47 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBBP0CG47 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBBP0CG47 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBBP0CG47 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBBP0CG47 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBBP0CG47 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBBP0CG47 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBBP0CG47 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBBP0CG47 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBBP0CG47 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBBP0CG47 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBBP0CG47 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBBP0CG47 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBBP0CG47 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBBP0CG47 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBBP0CG47 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBBP0CG47 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBBP0CG47 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBBP0CG47 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBBP0CG47 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
UBBP0CG47 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBBP0CG47 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBBP0CG47 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBBP0CG47 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBBP0CG47 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBBP0CG47 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBBP0CG47 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBBP0CG47 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBBP0CG47 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBBP0CG47 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
UBBP0CG47 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBBP0CG47 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBBP0CG47 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBBP0CG47 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBBP0CG47 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBBP0CG47 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBBP0CG47 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBBP0CG47 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBBP0CG47 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBBP0CG47 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBBP0CG47 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBBP0CG47 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBBP0CG47 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBBP0CG47 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBBP0CG47 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBBP0CG47 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBBP0CG47 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBBP0CG47 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBBP0CG47 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBBP0CG47 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
UBBP0CG47 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBBP0CG47 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBBP0CG47 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBBP0CG47 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBBP0CG47 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms