Protein–RNA interactions for Protein: P0C2S0

CTXN2, Cortexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN2P0C2S0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTXN2P0C2S0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTXN2P0C2S0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTXN2P0C2S0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTXN2P0C2S0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTXN2P0C2S0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTXN2P0C2S0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTXN2P0C2S0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTXN2P0C2S0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTXN2P0C2S0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTXN2P0C2S0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTXN2P0C2S0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTXN2P0C2S0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTXN2P0C2S0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTXN2P0C2S0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTXN2P0C2S0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTXN2P0C2S0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTXN2P0C2S0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTXN2P0C2S0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTXN2P0C2S0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTXN2P0C2S0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTXN2P0C2S0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTXN2P0C2S0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTXN2P0C2S0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CTXN2P0C2S0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTXN2P0C2S0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTXN2P0C2S0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTXN2P0C2S0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTXN2P0C2S0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTXN2P0C2S0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTXN2P0C2S0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTXN2P0C2S0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTXN2P0C2S0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTXN2P0C2S0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTXN2P0C2S0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTXN2P0C2S0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTXN2P0C2S0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTXN2P0C2S0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CTXN2P0C2S0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTXN2P0C2S0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTXN2P0C2S0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTXN2P0C2S0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTXN2P0C2S0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTXN2P0C2S0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTXN2P0C2S0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTXN2P0C2S0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTXN2P0C2S0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTXN2P0C2S0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTXN2P0C2S0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTXN2P0C2S0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTXN2P0C2S0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTXN2P0C2S0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTXN2P0C2S0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTXN2P0C2S0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTXN2P0C2S0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTXN2P0C2S0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTXN2P0C2S0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTXN2P0C2S0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTXN2P0C2S0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTXN2P0C2S0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTXN2P0C2S0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTXN2P0C2S0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTXN2P0C2S0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CTXN2P0C2S0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CTXN2P0C2S0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CTXN2P0C2S0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTXN2P0C2S0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTXN2P0C2S0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTXN2P0C2S0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTXN2P0C2S0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTXN2P0C2S0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CTXN2P0C2S0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTXN2P0C2S0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTXN2P0C2S0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTXN2P0C2S0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTXN2P0C2S0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTXN2P0C2S0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTXN2P0C2S0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTXN2P0C2S0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTXN2P0C2S0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTXN2P0C2S0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTXN2P0C2S0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTXN2P0C2S0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTXN2P0C2S0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTXN2P0C2S0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTXN2P0C2S0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTXN2P0C2S0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTXN2P0C2S0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTXN2P0C2S0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTXN2P0C2S0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTXN2P0C2S0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTXN2P0C2S0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTXN2P0C2S0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTXN2P0C2S0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTXN2P0C2S0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTXN2P0C2S0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTXN2P0C2S0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTXN2P0C2S0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTXN2P0C2S0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTXN2P0C2S0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms