Protein–RNA interactions for Protein: P06028

GYPB, Glycophorin-B, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYPBP06028 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GYPBP06028 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GYPBP06028 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GYPBP06028 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GYPBP06028 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GYPBP06028 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GYPBP06028 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GYPBP06028 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GYPBP06028 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GYPBP06028 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GYPBP06028 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GYPBP06028 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GYPBP06028 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GYPBP06028 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GYPBP06028 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GYPBP06028 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GYPBP06028 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GYPBP06028 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GYPBP06028 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GYPBP06028 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GYPBP06028 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GYPBP06028 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GYPBP06028 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GYPBP06028 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GYPBP06028 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GYPBP06028 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GYPBP06028 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GYPBP06028 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GYPBP06028 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GYPBP06028 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GYPBP06028 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GYPBP06028 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GYPBP06028 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GYPBP06028 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GYPBP06028 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GYPBP06028 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GYPBP06028 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GYPBP06028 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GYPBP06028 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GYPBP06028 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GYPBP06028 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GYPBP06028 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GYPBP06028 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GYPBP06028 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GYPBP06028 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GYPBP06028 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GYPBP06028 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GYPBP06028 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GYPBP06028 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GYPBP06028 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GYPBP06028 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GYPBP06028 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GYPBP06028 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GYPBP06028 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GYPBP06028 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GYPBP06028 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GYPBP06028 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GYPBP06028 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GYPBP06028 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GYPBP06028 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GYPBP06028 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GYPBP06028 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GYPBP06028 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GYPBP06028 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GYPBP06028 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GYPBP06028 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GYPBP06028 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GYPBP06028 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GYPBP06028 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GYPBP06028 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GYPBP06028 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GYPBP06028 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GYPBP06028 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GYPBP06028 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GYPBP06028 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GYPBP06028 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GYPBP06028 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GYPBP06028 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GYPBP06028 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GYPBP06028 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GYPBP06028 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GYPBP06028 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GYPBP06028 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GYPBP06028 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GYPBP06028 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GYPBP06028 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GYPBP06028 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GYPBP06028 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GYPBP06028 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GYPBP06028 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GYPBP06028 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GYPBP06028 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GYPBP06028 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GYPBP06028 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GYPBP06028 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GYPBP06028 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GYPBP06028 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GYPBP06028 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GYPBP06028 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GYPBP06028 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms