Protein–RNA interactions for Protein: P03897

MT-ND3, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-ND3P03897 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MT-ND3P03897 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MT-ND3P03897 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MT-ND3P03897 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MT-ND3P03897 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MT-ND3P03897 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MT-ND3P03897 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MT-ND3P03897 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MT-ND3P03897 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MT-ND3P03897 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MT-ND3P03897 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MT-ND3P03897 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MT-ND3P03897 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MT-ND3P03897 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MT-ND3P03897 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MT-ND3P03897 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MT-ND3P03897 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MT-ND3P03897 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MT-ND3P03897 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MT-ND3P03897 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
MT-ND3P03897 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MT-ND3P03897 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MT-ND3P03897 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MT-ND3P03897 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MT-ND3P03897 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MT-ND3P03897 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MT-ND3P03897 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MT-ND3P03897 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MT-ND3P03897 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MT-ND3P03897 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MT-ND3P03897 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MT-ND3P03897 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MT-ND3P03897 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MT-ND3P03897 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MT-ND3P03897 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MT-ND3P03897 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MT-ND3P03897 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MT-ND3P03897 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MT-ND3P03897 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MT-ND3P03897 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MT-ND3P03897 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MT-ND3P03897 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MT-ND3P03897 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MT-ND3P03897 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MT-ND3P03897 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MT-ND3P03897 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MT-ND3P03897 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MT-ND3P03897 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MT-ND3P03897 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MT-ND3P03897 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MT-ND3P03897 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MT-ND3P03897 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MT-ND3P03897 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
MT-ND3P03897 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MT-ND3P03897 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
MT-ND3P03897 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MT-ND3P03897 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MT-ND3P03897 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MT-ND3P03897 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MT-ND3P03897 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MT-ND3P03897 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MT-ND3P03897 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MT-ND3P03897 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MT-ND3P03897 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MT-ND3P03897 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MT-ND3P03897 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MT-ND3P03897 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MT-ND3P03897 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
MT-ND3P03897 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MT-ND3P03897 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MT-ND3P03897 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MT-ND3P03897 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MT-ND3P03897 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MT-ND3P03897 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MT-ND3P03897 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MT-ND3P03897 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MT-ND3P03897 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MT-ND3P03897 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MT-ND3P03897 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MT-ND3P03897 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MT-ND3P03897 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MT-ND3P03897 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MT-ND3P03897 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MT-ND3P03897 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MT-ND3P03897 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MT-ND3P03897 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MT-ND3P03897 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MT-ND3P03897 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MT-ND3P03897 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MT-ND3P03897 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MT-ND3P03897 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MT-ND3P03897 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MT-ND3P03897 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MT-ND3P03897 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MT-ND3P03897 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MT-ND3P03897 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MT-ND3P03897 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MT-ND3P03897 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MT-ND3P03897 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MT-ND3P03897 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms