Protein–RNA interactions for Protein: O75896

TUSC2, Tumor suppressor candidate 2, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUSC2O75896 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUSC2O75896 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TUSC2O75896 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TUSC2O75896 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUSC2O75896 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUSC2O75896 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUSC2O75896 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUSC2O75896 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUSC2O75896 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUSC2O75896 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUSC2O75896 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUSC2O75896 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUSC2O75896 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUSC2O75896 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUSC2O75896 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUSC2O75896 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUSC2O75896 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TUSC2O75896 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUSC2O75896 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUSC2O75896 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUSC2O75896 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUSC2O75896 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUSC2O75896 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUSC2O75896 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUSC2O75896 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUSC2O75896 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUSC2O75896 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUSC2O75896 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUSC2O75896 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUSC2O75896 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUSC2O75896 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUSC2O75896 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TUSC2O75896 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TUSC2O75896 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TUSC2O75896 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUSC2O75896 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUSC2O75896 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUSC2O75896 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUSC2O75896 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUSC2O75896 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUSC2O75896 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUSC2O75896 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUSC2O75896 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUSC2O75896 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUSC2O75896 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUSC2O75896 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUSC2O75896 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TUSC2O75896 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUSC2O75896 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUSC2O75896 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUSC2O75896 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUSC2O75896 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUSC2O75896 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUSC2O75896 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUSC2O75896 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUSC2O75896 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUSC2O75896 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUSC2O75896 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUSC2O75896 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUSC2O75896 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUSC2O75896 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TUSC2O75896 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUSC2O75896 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUSC2O75896 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUSC2O75896 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUSC2O75896 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TUSC2O75896 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUSC2O75896 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUSC2O75896 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUSC2O75896 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUSC2O75896 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TUSC2O75896 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUSC2O75896 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUSC2O75896 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUSC2O75896 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUSC2O75896 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TUSC2O75896 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUSC2O75896 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUSC2O75896 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUSC2O75896 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUSC2O75896 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TUSC2O75896 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUSC2O75896 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUSC2O75896 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUSC2O75896 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUSC2O75896 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUSC2O75896 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUSC2O75896 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUSC2O75896 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUSC2O75896 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUSC2O75896 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUSC2O75896 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUSC2O75896 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUSC2O75896 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TUSC2O75896 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUSC2O75896 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUSC2O75896 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUSC2O75896 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUSC2O75896 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUSC2O75896 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms