Protein–RNA interactions for Protein: O75367

H2AFY, Core histone macro-H2A.1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFYO75367 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
H2AFYO75367 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
H2AFYO75367 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
H2AFYO75367 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
H2AFYO75367 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
H2AFYO75367 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
H2AFYO75367 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
H2AFYO75367 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
H2AFYO75367 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
H2AFYO75367 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
H2AFYO75367 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
H2AFYO75367 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
H2AFYO75367 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
H2AFYO75367 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
H2AFYO75367 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
H2AFYO75367 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
H2AFYO75367 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
H2AFYO75367 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
H2AFYO75367 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
H2AFYO75367 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
H2AFYO75367 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
H2AFYO75367 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
H2AFYO75367 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
H2AFYO75367 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
H2AFYO75367 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
H2AFYO75367 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
H2AFYO75367 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
H2AFYO75367 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
H2AFYO75367 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
H2AFYO75367 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
H2AFYO75367 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
H2AFYO75367 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
H2AFYO75367 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
H2AFYO75367 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
H2AFYO75367 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
H2AFYO75367 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
H2AFYO75367 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
H2AFYO75367 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
H2AFYO75367 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
H2AFYO75367 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
H2AFYO75367 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
H2AFYO75367 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
H2AFYO75367 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
H2AFYO75367 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
H2AFYO75367 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
H2AFYO75367 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
H2AFYO75367 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
H2AFYO75367 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
H2AFYO75367 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
H2AFYO75367 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
H2AFYO75367 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
H2AFYO75367 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
H2AFYO75367 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
H2AFYO75367 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
H2AFYO75367 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
H2AFYO75367 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
H2AFYO75367 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
H2AFYO75367 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
H2AFYO75367 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
H2AFYO75367 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
H2AFYO75367 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
H2AFYO75367 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
H2AFYO75367 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
H2AFYO75367 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
H2AFYO75367 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
H2AFYO75367 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
H2AFYO75367 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
H2AFYO75367 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
H2AFYO75367 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
H2AFYO75367 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
H2AFYO75367 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
H2AFYO75367 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
H2AFYO75367 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
H2AFYO75367 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
H2AFYO75367 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
H2AFYO75367 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
H2AFYO75367 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
H2AFYO75367 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
H2AFYO75367 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
H2AFYO75367 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
H2AFYO75367 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
H2AFYO75367 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
H2AFYO75367 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
H2AFYO75367 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
H2AFYO75367 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
H2AFYO75367 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
H2AFYO75367 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
H2AFYO75367 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
H2AFYO75367 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
H2AFYO75367 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
H2AFYO75367 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
H2AFYO75367 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
H2AFYO75367 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
H2AFYO75367 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
H2AFYO75367 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
H2AFYO75367 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
H2AFYO75367 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
H2AFYO75367 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
H2AFYO75367 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
H2AFYO75367 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms