Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
IKBKBO14920 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
IKBKBO14920 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
IKBKBO14920 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
IKBKBO14920 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
IKBKBO14920 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
IKBKBO14920 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
IKBKBO14920 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
IKBKBO14920 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
IKBKBO14920 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
IKBKBO14920 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
IKBKBO14920 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
IKBKBO14920 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
IKBKBO14920 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
IKBKBO14920 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.45
IKBKBO14920 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
IKBKBO14920 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
IKBKBO14920 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
IKBKBO14920 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
IKBKBO14920 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
IKBKBO14920 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
IKBKBO14920 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
IKBKBO14920 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
IKBKBO14920 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
IKBKBO14920 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
IKBKBO14920 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
IKBKBO14920 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
IKBKBO14920 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
IKBKBO14920 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
IKBKBO14920 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
IKBKBO14920 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
IKBKBO14920 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
IKBKBO14920 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
IKBKBO14920 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
IKBKBO14920 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
IKBKBO14920 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
IKBKBO14920 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
IKBKBO14920 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
IKBKBO14920 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
IKBKBO14920 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
IKBKBO14920 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
IKBKBO14920 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
IKBKBO14920 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
IKBKBO14920 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
IKBKBO14920 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
IKBKBO14920 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
IKBKBO14920 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
IKBKBO14920 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
IKBKBO14920 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
IKBKBO14920 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
IKBKBO14920 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
IKBKBO14920 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
IKBKBO14920 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
IKBKBO14920 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
IKBKBO14920 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
IKBKBO14920 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
IKBKBO14920 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
IKBKBO14920 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
IKBKBO14920 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
IKBKBO14920 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
IKBKBO14920 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
IKBKBO14920 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
IKBKBO14920 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
IKBKBO14920 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
IKBKBO14920 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
IKBKBO14920 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
IKBKBO14920 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
IKBKBO14920 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
IKBKBO14920 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
IKBKBO14920 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
IKBKBO14920 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
IKBKBO14920 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
IKBKBO14920 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
IKBKBO14920 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
IKBKBO14920 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
IKBKBO14920 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
IKBKBO14920 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
IKBKBO14920 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
IKBKBO14920 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
IKBKBO14920 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
IKBKBO14920 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
IKBKBO14920 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
IKBKBO14920 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
IKBKBO14920 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
IKBKBO14920 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
IKBKBO14920 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
IKBKBO14920 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
IKBKBO14920 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
IKBKBO14920 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
IKBKBO14920 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
IKBKBO14920 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
IKBKBO14920 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
IKBKBO14920 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
IKBKBO14920 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
IKBKBO14920 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
IKBKBO14920 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
IKBKBO14920 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
IKBKBO14920 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
IKBKBO14920 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
IKBKBO14920 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms