Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
IKBKBO14920 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
IKBKBO14920 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.97■■■■□ 3.51
IKBKBO14920 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.76■■■■□ 3.48
IKBKBO14920 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
IKBKBO14920 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
IKBKBO14920 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
IKBKBO14920 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
IKBKBO14920 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
IKBKBO14920 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
IKBKBO14920 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
IKBKBO14920 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
IKBKBO14920 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
IKBKBO14920 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
IKBKBO14920 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.39■■■■□ 3.26
IKBKBO14920 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
IKBKBO14920 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
IKBKBO14920 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
IKBKBO14920 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
IKBKBO14920 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
IKBKBO14920 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
IKBKBO14920 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
IKBKBO14920 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
IKBKBO14920 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
IKBKBO14920 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
IKBKBO14920 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
IKBKBO14920 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
IKBKBO14920 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
IKBKBO14920 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
IKBKBO14920 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
IKBKBO14920 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
IKBKBO14920 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
IKBKBO14920 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
IKBKBO14920 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
IKBKBO14920 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
IKBKBO14920 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
IKBKBO14920 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
IKBKBO14920 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
IKBKBO14920 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
IKBKBO14920 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
IKBKBO14920 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
IKBKBO14920 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
IKBKBO14920 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
IKBKBO14920 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
IKBKBO14920 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
IKBKBO14920 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
IKBKBO14920 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
IKBKBO14920 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
IKBKBO14920 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
IKBKBO14920 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
IKBKBO14920 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
IKBKBO14920 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
IKBKBO14920 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
IKBKBO14920 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
IKBKBO14920 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
IKBKBO14920 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
IKBKBO14920 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
IKBKBO14920 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
IKBKBO14920 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
IKBKBO14920 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
IKBKBO14920 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
IKBKBO14920 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
IKBKBO14920 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
IKBKBO14920 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
IKBKBO14920 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
IKBKBO14920 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
IKBKBO14920 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
IKBKBO14920 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
IKBKBO14920 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
IKBKBO14920 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
IKBKBO14920 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
IKBKBO14920 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
IKBKBO14920 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
IKBKBO14920 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
IKBKBO14920 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
IKBKBO14920 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
IKBKBO14920 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
IKBKBO14920 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
IKBKBO14920 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
IKBKBO14920 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
IKBKBO14920 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
IKBKBO14920 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
IKBKBO14920 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
IKBKBO14920 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
IKBKBO14920 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
IKBKBO14920 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
IKBKBO14920 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
IKBKBO14920 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
IKBKBO14920 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
IKBKBO14920 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
IKBKBO14920 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
IKBKBO14920 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
IKBKBO14920 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
IKBKBO14920 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
IKBKBO14920 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
IKBKBO14920 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
IKBKBO14920 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
IKBKBO14920 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
IKBKBO14920 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
IKBKBO14920 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms