Protein–RNA interactions for Protein: A8MV23

SERPINE3, Serpin E3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINE3A8MV23 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SERPINE3A8MV23 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SERPINE3A8MV23 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SERPINE3A8MV23 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SERPINE3A8MV23 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SERPINE3A8MV23 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SERPINE3A8MV23 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SERPINE3A8MV23 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SERPINE3A8MV23 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SERPINE3A8MV23 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SERPINE3A8MV23 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SERPINE3A8MV23 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SERPINE3A8MV23 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SERPINE3A8MV23 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SERPINE3A8MV23 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SERPINE3A8MV23 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SERPINE3A8MV23 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SERPINE3A8MV23 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SERPINE3A8MV23 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SERPINE3A8MV23 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SERPINE3A8MV23 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SERPINE3A8MV23 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SERPINE3A8MV23 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SERPINE3A8MV23 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SERPINE3A8MV23 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SERPINE3A8MV23 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SERPINE3A8MV23 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SERPINE3A8MV23 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SERPINE3A8MV23 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SERPINE3A8MV23 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SERPINE3A8MV23 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SERPINE3A8MV23 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SERPINE3A8MV23 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SERPINE3A8MV23 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SERPINE3A8MV23 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SERPINE3A8MV23 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SERPINE3A8MV23 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SERPINE3A8MV23 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SERPINE3A8MV23 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERPINE3A8MV23 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERPINE3A8MV23 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERPINE3A8MV23 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERPINE3A8MV23 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERPINE3A8MV23 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERPINE3A8MV23 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERPINE3A8MV23 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERPINE3A8MV23 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERPINE3A8MV23 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERPINE3A8MV23 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPINE3A8MV23 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPINE3A8MV23 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPINE3A8MV23 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPINE3A8MV23 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPINE3A8MV23 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERPINE3A8MV23 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERPINE3A8MV23 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERPINE3A8MV23 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SERPINE3A8MV23 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERPINE3A8MV23 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERPINE3A8MV23 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERPINE3A8MV23 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERPINE3A8MV23 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SERPINE3A8MV23 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SERPINE3A8MV23 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SERPINE3A8MV23 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPINE3A8MV23 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPINE3A8MV23 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPINE3A8MV23 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPINE3A8MV23 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPINE3A8MV23 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINE3A8MV23 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINE3A8MV23 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINE3A8MV23 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINE3A8MV23 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERPINE3A8MV23 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERPINE3A8MV23 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERPINE3A8MV23 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SERPINE3A8MV23 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERPINE3A8MV23 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERPINE3A8MV23 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPINE3A8MV23 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPINE3A8MV23 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPINE3A8MV23 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERPINE3A8MV23 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERPINE3A8MV23 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERPINE3A8MV23 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERPINE3A8MV23 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERPINE3A8MV23 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERPINE3A8MV23 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERPINE3A8MV23 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERPINE3A8MV23 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SERPINE3A8MV23 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERPINE3A8MV23 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SERPINE3A8MV23 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERPINE3A8MV23 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SERPINE3A8MV23 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SERPINE3A8MV23 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SERPINE3A8MV23 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SERPINE3A8MV23 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SERPINE3A8MV23 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.3 ms