Protein–RNA interactions for Protein: A6NNX1

RIIAD1, RIIa domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIIAD1A6NNX1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIIAD1A6NNX1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIIAD1A6NNX1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIIAD1A6NNX1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RIIAD1A6NNX1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RIIAD1A6NNX1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIIAD1A6NNX1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIIAD1A6NNX1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIIAD1A6NNX1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RIIAD1A6NNX1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIIAD1A6NNX1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RIIAD1A6NNX1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIIAD1A6NNX1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIIAD1A6NNX1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIIAD1A6NNX1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIIAD1A6NNX1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIIAD1A6NNX1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIIAD1A6NNX1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIIAD1A6NNX1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIIAD1A6NNX1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIIAD1A6NNX1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIIAD1A6NNX1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIIAD1A6NNX1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIIAD1A6NNX1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIIAD1A6NNX1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIIAD1A6NNX1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RIIAD1A6NNX1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIIAD1A6NNX1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIIAD1A6NNX1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIIAD1A6NNX1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIIAD1A6NNX1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIIAD1A6NNX1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RIIAD1A6NNX1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIIAD1A6NNX1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIIAD1A6NNX1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIIAD1A6NNX1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIIAD1A6NNX1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIIAD1A6NNX1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIIAD1A6NNX1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIIAD1A6NNX1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIIAD1A6NNX1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIIAD1A6NNX1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIIAD1A6NNX1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIIAD1A6NNX1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIIAD1A6NNX1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIIAD1A6NNX1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIIAD1A6NNX1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIIAD1A6NNX1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIIAD1A6NNX1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RIIAD1A6NNX1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIIAD1A6NNX1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIIAD1A6NNX1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIIAD1A6NNX1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIIAD1A6NNX1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIIAD1A6NNX1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIIAD1A6NNX1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIIAD1A6NNX1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIIAD1A6NNX1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIIAD1A6NNX1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIIAD1A6NNX1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RIIAD1A6NNX1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIIAD1A6NNX1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIIAD1A6NNX1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIIAD1A6NNX1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIIAD1A6NNX1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIIAD1A6NNX1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIIAD1A6NNX1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIIAD1A6NNX1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIIAD1A6NNX1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIIAD1A6NNX1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIIAD1A6NNX1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RIIAD1A6NNX1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RIIAD1A6NNX1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RIIAD1A6NNX1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RIIAD1A6NNX1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIIAD1A6NNX1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIIAD1A6NNX1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIIAD1A6NNX1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIIAD1A6NNX1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIIAD1A6NNX1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RIIAD1A6NNX1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIIAD1A6NNX1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIIAD1A6NNX1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIIAD1A6NNX1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIIAD1A6NNX1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RIIAD1A6NNX1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIIAD1A6NNX1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIIAD1A6NNX1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIIAD1A6NNX1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIIAD1A6NNX1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIIAD1A6NNX1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIIAD1A6NNX1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RIIAD1A6NNX1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
RIIAD1A6NNX1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIIAD1A6NNX1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIIAD1A6NNX1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIIAD1A6NNX1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIIAD1A6NNX1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIIAD1A6NNX1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIIAD1A6NNX1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms