Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS04

TRBV6-7, T-cell receptor beta variable 6-7 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV6-7A0A0A0MS04 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRBV6-7A0A0A0MS04 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRBV6-7A0A0A0MS04 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRBV6-7A0A0A0MS04 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRBV6-7A0A0A0MS04 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRBV6-7A0A0A0MS04 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRBV6-7A0A0A0MS04 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRBV6-7A0A0A0MS04 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRBV6-7A0A0A0MS04 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRBV6-7A0A0A0MS04 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRBV6-7A0A0A0MS04 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRBV6-7A0A0A0MS04 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRBV6-7A0A0A0MS04 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRBV6-7A0A0A0MS04 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRBV6-7A0A0A0MS04 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRBV6-7A0A0A0MS04 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRBV6-7A0A0A0MS04 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRBV6-7A0A0A0MS04 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRBV6-7A0A0A0MS04 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRBV6-7A0A0A0MS04 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRBV6-7A0A0A0MS04 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRBV6-7A0A0A0MS04 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRBV6-7A0A0A0MS04 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRBV6-7A0A0A0MS04 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRBV6-7A0A0A0MS04 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRBV6-7A0A0A0MS04 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRBV6-7A0A0A0MS04 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRBV6-7A0A0A0MS04 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRBV6-7A0A0A0MS04 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRBV6-7A0A0A0MS04 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRBV6-7A0A0A0MS04 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRBV6-7A0A0A0MS04 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRBV6-7A0A0A0MS04 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRBV6-7A0A0A0MS04 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRBV6-7A0A0A0MS04 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRBV6-7A0A0A0MS04 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRBV6-7A0A0A0MS04 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRBV6-7A0A0A0MS04 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRBV6-7A0A0A0MS04 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRBV6-7A0A0A0MS04 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRBV6-7A0A0A0MS04 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRBV6-7A0A0A0MS04 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRBV6-7A0A0A0MS04 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRBV6-7A0A0A0MS04 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRBV6-7A0A0A0MS04 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRBV6-7A0A0A0MS04 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRBV6-7A0A0A0MS04 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRBV6-7A0A0A0MS04 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRBV6-7A0A0A0MS04 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRBV6-7A0A0A0MS04 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRBV6-7A0A0A0MS04 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRBV6-7A0A0A0MS04 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRBV6-7A0A0A0MS04 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRBV6-7A0A0A0MS04 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRBV6-7A0A0A0MS04 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRBV6-7A0A0A0MS04 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBV6-7A0A0A0MS04 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBV6-7A0A0A0MS04 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRBV6-7A0A0A0MS04 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRBV6-7A0A0A0MS04 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRBV6-7A0A0A0MS04 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRBV6-7A0A0A0MS04 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRBV6-7A0A0A0MS04 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRBV6-7A0A0A0MS04 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBV6-7A0A0A0MS04 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBV6-7A0A0A0MS04 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBV6-7A0A0A0MS04 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRBV6-7A0A0A0MS04 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRBV6-7A0A0A0MS04 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRBV6-7A0A0A0MS04 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRBV6-7A0A0A0MS04 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRBV6-7A0A0A0MS04 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRBV6-7A0A0A0MS04 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRBV6-7A0A0A0MS04 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRBV6-7A0A0A0MS04 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBV6-7A0A0A0MS04 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRBV6-7A0A0A0MS04 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRBV6-7A0A0A0MS04 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBV6-7A0A0A0MS04 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBV6-7A0A0A0MS04 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBV6-7A0A0A0MS04 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBV6-7A0A0A0MS04 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBV6-7A0A0A0MS04 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBV6-7A0A0A0MS04 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBV6-7A0A0A0MS04 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBV6-7A0A0A0MS04 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBV6-7A0A0A0MS04 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBV6-7A0A0A0MS04 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBV6-7A0A0A0MS04 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBV6-7A0A0A0MS04 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRBV6-7A0A0A0MS04 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRBV6-7A0A0A0MS04 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRBV6-7A0A0A0MS04 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRBV6-7A0A0A0MS04 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRBV6-7A0A0A0MS04 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRBV6-7A0A0A0MS04 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRBV6-7A0A0A0MS04 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
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