Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WW87

IGKV2-40, Immunoglobulin kappa variable 2-40, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV2-40A0A087WW87 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IGKV2-40A0A087WW87 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IGKV2-40A0A087WW87 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IGKV2-40A0A087WW87 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IGKV2-40A0A087WW87 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IGKV2-40A0A087WW87 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IGKV2-40A0A087WW87 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IGKV2-40A0A087WW87 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IGKV2-40A0A087WW87 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IGKV2-40A0A087WW87 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGKV2-40A0A087WW87 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGKV2-40A0A087WW87 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGKV2-40A0A087WW87 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGKV2-40A0A087WW87 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
IGKV2-40A0A087WW87 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGKV2-40A0A087WW87 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGKV2-40A0A087WW87 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
IGKV2-40A0A087WW87 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
IGKV2-40A0A087WW87 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IGKV2-40A0A087WW87 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IGKV2-40A0A087WW87 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IGKV2-40A0A087WW87 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
IGKV2-40A0A087WW87 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
IGKV2-40A0A087WW87 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IGKV2-40A0A087WW87 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IGKV2-40A0A087WW87 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IGKV2-40A0A087WW87 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IGKV2-40A0A087WW87 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IGKV2-40A0A087WW87 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IGKV2-40A0A087WW87 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
IGKV2-40A0A087WW87 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
IGKV2-40A0A087WW87 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IGKV2-40A0A087WW87 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IGKV2-40A0A087WW87 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IGKV2-40A0A087WW87 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
IGKV2-40A0A087WW87 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IGKV2-40A0A087WW87 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IGKV2-40A0A087WW87 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IGKV2-40A0A087WW87 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IGKV2-40A0A087WW87 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IGKV2-40A0A087WW87 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IGKV2-40A0A087WW87 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IGKV2-40A0A087WW87 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IGKV2-40A0A087WW87 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IGKV2-40A0A087WW87 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IGKV2-40A0A087WW87 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
IGKV2-40A0A087WW87 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IGKV2-40A0A087WW87 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IGKV2-40A0A087WW87 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IGKV2-40A0A087WW87 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IGKV2-40A0A087WW87 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IGKV2-40A0A087WW87 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGKV2-40A0A087WW87 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGKV2-40A0A087WW87 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGKV2-40A0A087WW87 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGKV2-40A0A087WW87 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGKV2-40A0A087WW87 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
IGKV2-40A0A087WW87 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IGKV2-40A0A087WW87 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IGKV2-40A0A087WW87 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGKV2-40A0A087WW87 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGKV2-40A0A087WW87 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGKV2-40A0A087WW87 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IGKV2-40A0A087WW87 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IGKV2-40A0A087WW87 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IGKV2-40A0A087WW87 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IGKV2-40A0A087WW87 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IGKV2-40A0A087WW87 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IGKV2-40A0A087WW87 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IGKV2-40A0A087WW87 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IGKV2-40A0A087WW87 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IGKV2-40A0A087WW87 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
IGKV2-40A0A087WW87 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IGKV2-40A0A087WW87 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IGKV2-40A0A087WW87 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IGKV2-40A0A087WW87 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
IGKV2-40A0A087WW87 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IGKV2-40A0A087WW87 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGKV2-40A0A087WW87 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IGKV2-40A0A087WW87 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGKV2-40A0A087WW87 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGKV2-40A0A087WW87 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGKV2-40A0A087WW87 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGKV2-40A0A087WW87 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGKV2-40A0A087WW87 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGKV2-40A0A087WW87 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGKV2-40A0A087WW87 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGKV2-40A0A087WW87 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGKV2-40A0A087WW87 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGKV2-40A0A087WW87 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGKV2-40A0A087WW87 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGKV2-40A0A087WW87 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGKV2-40A0A087WW87 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGKV2-40A0A087WW87 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGKV2-40A0A087WW87 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGKV2-40A0A087WW87 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGKV2-40A0A087WW87 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGKV2-40A0A087WW87 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGKV2-40A0A087WW87 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGKV2-40A0A087WW87 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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