Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WW87

IGKV2-40, Immunoglobulin kappa variable 2-40, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV2-40A0A087WW87 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGKV2-40A0A087WW87 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGKV2-40A0A087WW87 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IGKV2-40A0A087WW87 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IGKV2-40A0A087WW87 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IGKV2-40A0A087WW87 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IGKV2-40A0A087WW87 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
IGKV2-40A0A087WW87 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGKV2-40A0A087WW87 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGKV2-40A0A087WW87 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGKV2-40A0A087WW87 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IGKV2-40A0A087WW87 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGKV2-40A0A087WW87 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IGKV2-40A0A087WW87 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IGKV2-40A0A087WW87 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGKV2-40A0A087WW87 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGKV2-40A0A087WW87 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGKV2-40A0A087WW87 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IGKV2-40A0A087WW87 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGKV2-40A0A087WW87 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGKV2-40A0A087WW87 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGKV2-40A0A087WW87 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGKV2-40A0A087WW87 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IGKV2-40A0A087WW87 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGKV2-40A0A087WW87 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGKV2-40A0A087WW87 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGKV2-40A0A087WW87 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGKV2-40A0A087WW87 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGKV2-40A0A087WW87 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGKV2-40A0A087WW87 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGKV2-40A0A087WW87 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IGKV2-40A0A087WW87 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IGKV2-40A0A087WW87 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGKV2-40A0A087WW87 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGKV2-40A0A087WW87 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGKV2-40A0A087WW87 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGKV2-40A0A087WW87 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGKV2-40A0A087WW87 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGKV2-40A0A087WW87 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGKV2-40A0A087WW87 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGKV2-40A0A087WW87 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGKV2-40A0A087WW87 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGKV2-40A0A087WW87 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGKV2-40A0A087WW87 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGKV2-40A0A087WW87 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGKV2-40A0A087WW87 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IGKV2-40A0A087WW87 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGKV2-40A0A087WW87 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGKV2-40A0A087WW87 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGKV2-40A0A087WW87 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGKV2-40A0A087WW87 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGKV2-40A0A087WW87 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGKV2-40A0A087WW87 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGKV2-40A0A087WW87 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGKV2-40A0A087WW87 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGKV2-40A0A087WW87 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGKV2-40A0A087WW87 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGKV2-40A0A087WW87 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGKV2-40A0A087WW87 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGKV2-40A0A087WW87 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
IGKV2-40A0A087WW87 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGKV2-40A0A087WW87 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGKV2-40A0A087WW87 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGKV2-40A0A087WW87 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGKV2-40A0A087WW87 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGKV2-40A0A087WW87 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGKV2-40A0A087WW87 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGKV2-40A0A087WW87 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGKV2-40A0A087WW87 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGKV2-40A0A087WW87 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGKV2-40A0A087WW87 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGKV2-40A0A087WW87 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGKV2-40A0A087WW87 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGKV2-40A0A087WW87 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGKV2-40A0A087WW87 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGKV2-40A0A087WW87 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGKV2-40A0A087WW87 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGKV2-40A0A087WW87 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGKV2-40A0A087WW87 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGKV2-40A0A087WW87 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGKV2-40A0A087WW87 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGKV2-40A0A087WW87 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGKV2-40A0A087WW87 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IGKV2-40A0A087WW87 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IGKV2-40A0A087WW87 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
IGKV2-40A0A087WW87 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGKV2-40A0A087WW87 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGKV2-40A0A087WW87 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGKV2-40A0A087WW87 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGKV2-40A0A087WW87 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IGKV2-40A0A087WW87 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGKV2-40A0A087WW87 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGKV2-40A0A087WW87 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGKV2-40A0A087WW87 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGKV2-40A0A087WW87 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGKV2-40A0A087WW87 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGKV2-40A0A087WW87 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IGKV2-40A0A087WW87 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IGKV2-40A0A087WW87 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IGKV2-40A0A087WW87 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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