Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP1P28562 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP1P28562 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DUSP1P28562 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DUSP1P28562 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP1P28562 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP1P28562 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP1P28562 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP1P28562 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP1P28562 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP1P28562 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DUSP1P28562 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP1P28562 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP1P28562 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP1P28562 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP1P28562 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DUSP1P28562 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
DUSP1P28562 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
DUSP1P28562 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP1P28562 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP1P28562 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP1P28562 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP1P28562 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DUSP1P28562 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
DUSP1P28562 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUSP1P28562 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DUSP1P28562 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUSP1P28562 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
DUSP1P28562 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUSP1P28562 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUSP1P28562 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DUSP1P28562 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP1P28562 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP1P28562 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP1P28562 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DUSP1P28562 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUSP1P28562 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUSP1P28562 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUSP1P28562 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUSP1P28562 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUSP1P28562 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUSP1P28562 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
DUSP1P28562 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DUSP1P28562 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUSP1P28562 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUSP1P28562 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUSP1P28562 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUSP1P28562 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUSP1P28562 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUSP1P28562 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DUSP1P28562 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
DUSP1P28562 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DUSP1P28562 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DUSP1P28562 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DUSP1P28562 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DUSP1P28562 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
DUSP1P28562 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
DUSP1P28562 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DUSP1P28562 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DUSP1P28562 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DUSP1P28562 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DUSP1P28562 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DUSP1P28562 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DUSP1P28562 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DUSP1P28562 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DUSP1P28562 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DUSP1P28562 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DUSP1P28562 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DUSP1P28562 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DUSP1P28562 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DUSP1P28562 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DUSP1P28562 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DUSP1P28562 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUSP1P28562 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUSP1P28562 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUSP1P28562 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUSP1P28562 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUSP1P28562 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUSP1P28562 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUSP1P28562 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DUSP1P28562 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DUSP1P28562 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DUSP1P28562 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DUSP1P28562 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DUSP1P28562 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
DUSP1P28562 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
DUSP1P28562 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DUSP1P28562 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DUSP1P28562 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
DUSP1P28562 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
DUSP1P28562 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
DUSP1P28562 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
DUSP1P28562 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DUSP1P28562 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DUSP1P28562 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DUSP1P28562 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DUSP1P28562 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DUSP1P28562 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DUSP1P28562 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DUSP1P28562 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms