RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590551.1

U2AF2-206, Transcript of U2 small nuclear RNA auxiliary factor 2, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene U2AF2, Length 1,104 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF2-206ENST00000590551 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.71■■■■■ 7.95
U2AF2-206ENST00000590551 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa57.93■■■■■ 6.86
U2AF2-206ENST00000590551 ABCC9O60706 1549 aa57.87■■■■■ 6.85
U2AF2-206ENST00000590551 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.18■■■■■ 6.42
U2AF2-206ENST00000590551 NACADO15069 1562 aa54.87■■■■■ 6.37
U2AF2-206ENST00000590551 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.65■■■■■ 6.34
U2AF2-206ENST00000590551 DNAJC5BQ9UF47 199 aa54.23■■■■■ 6.27
U2AF2-206ENST00000590551 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.21■■■■■ 6.27
U2AF2-206ENST00000590551 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.97■■■■■ 6.232e-8■■□□□ 13
U2AF2-206ENST00000590551 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.64■■■■■ 6.18
U2AF2-206ENST00000590551 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.63■■■■■ 6.18
U2AF2-206ENST00000590551 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.52■■■■■ 6.16
U2AF2-206ENST00000590551 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.47■■■■■ 6.15
U2AF2-206ENST00000590551 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.97■■■■■ 6.07
U2AF2-206ENST00000590551 SCRIBQ14160 1630 aa52.75■■■■■ 6.03
U2AF2-206ENST00000590551 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa52.25■■■■■ 5.95
U2AF2-206ENST00000590551 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP52.2■■■■■ 5.95
U2AF2-206ENST00000590551 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.19■■■■■ 5.95
U2AF2-206ENST00000590551 NCAPD3P42695 1498 aa50.71■■■■■ 5.71
U2AF2-206ENST00000590551 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.51■■■■■ 5.68
U2AF2-206ENST00000590551 SMARCA2P51531 1590 aa50.38■■■■■ 5.66
U2AF2-206ENST00000590551 SMARCA4P51532 1647 aa50.37■■■■■ 5.65
U2AF2-206ENST00000590551 HMGXB3Q12766 1538 aa50.25■■■■■ 5.63
U2AF2-206ENST00000590551 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.23■■■■■ 5.63
U2AF2-206ENST00000590551 ERCC6Q03468 1493 aa50.04■■■■■ 5.6
U2AF2-206ENST00000590551 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.01■■■■■ 5.6
U2AF2-206ENST00000590551 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.96■■■■■ 5.59
U2AF2-206ENST00000590551 CUX2O14529 1486 aa49.95■■■■■ 5.59
U2AF2-206ENST00000590551 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa49.85■■■■■ 5.57
U2AF2-206ENST00000590551 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.81■■■■■ 5.56
U2AF2-206ENST00000590551 NESP48681 1621 aa49.71■■■■■ 5.55
U2AF2-206ENST00000590551 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.45■■■■■ 5.51
U2AF2-206ENST00000590551 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.29■■■■■ 5.48
U2AF2-206ENST00000590551 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.18■■■■■ 5.46
U2AF2-206ENST00000590551 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP49.14■■■■■ 5.46
U2AF2-206ENST00000590551 WIZO95785 1651 aa49.12■■■■■ 5.45
U2AF2-206ENST00000590551 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.94■■■■■ 5.42
U2AF2-206ENST00000590551 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.9■■■■■ 5.42
U2AF2-206ENST00000590551 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.77■■■■■ 5.4
U2AF2-206ENST00000590551 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.63■■■■■ 5.37
U2AF2-206ENST00000590551 CFTRP13569 1480 aa48.61■■■■■ 5.37
U2AF2-206ENST00000590551 WDR62O43379 1518 aa48.6■■■■■ 5.37
U2AF2-206ENST00000590551 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.6■■■■■ 5.37
U2AF2-206ENST00000590551 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.55■■■■■ 5.36
U2AF2-206ENST00000590551 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.1■■■■■ 5.29
U2AF2-206ENST00000590551 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.08■■■■■ 5.29
U2AF2-206ENST00000590551 PRDM2Q13029 1718 aa47.84■■■■■ 5.25
U2AF2-206ENST00000590551 OSCARQ8IYS5 282 aa47.78■■■■■ 5.24
U2AF2-206ENST00000590551 IFT140Q96RY7 1462 aa47.66■■■■■ 5.22
U2AF2-206ENST00000590551 ABCC8Q09428 1581 aa47.65■■■■■ 5.22
U2AF2-206ENST00000590551 TRIM41Q8WV44 630 aa47.63■■■■■ 5.22
U2AF2-206ENST00000590551 TOPBP1Q92547 1522 aa47.61■■■■■ 5.21
U2AF2-206ENST00000590551 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.47■■■■■ 5.19
U2AF2-206ENST00000590551 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.43■■■■■ 5.18
U2AF2-206ENST00000590551 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.15■■■■■ 5.14
U2AF2-206ENST00000590551 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.14■■■■■ 5.14
U2AF2-206ENST00000590551 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.11■■■■■ 5.13
U2AF2-206ENST00000590551 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.1■■■■■ 5.134e-9■■■■■ 31.4
U2AF2-206ENST00000590551 SOGA1O94964 1423 aa47■■■■■ 5.11
U2AF2-206ENST00000590551 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.94■■■■■ 5.1
U2AF2-206ENST00000590551 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.88■■■■■ 5.1
U2AF2-206ENST00000590551 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.88■■■■■ 5.1
U2AF2-206ENST00000590551 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.88■■■■■ 5.1
U2AF2-206ENST00000590551 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.86■■■■■ 5.09
U2AF2-206ENST00000590551 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.84■■■■■ 5.09
U2AF2-206ENST00000590551 FBLN2P98095 1184 aa46.84■■■■■ 5.09
U2AF2-206ENST00000590551 ARHGEF11O15085 1522 aa46.84■■■■■ 5.09
U2AF2-206ENST00000590551 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.83■■■■■ 5.09
U2AF2-206ENST00000590551 CUX1P39880 1505 aa46.79■■■■■ 5.08
U2AF2-206ENST00000590551 WDR97A6NE52 1622 aa46.75■■■■■ 5.07
U2AF2-206ENST00000590551 CHD1O14646 1710 aa46.68■■■■■ 5.06
U2AF2-206ENST00000590551 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.61■■■■■ 5.05
U2AF2-206ENST00000590551 CYB5RLQ6IPT4 315 aa46.59■■■■■ 5.05
U2AF2-206ENST00000590551 GRIN2BQ13224 1484 aa46.57■■■■■ 5.05
U2AF2-206ENST00000590551 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.57■■■■■ 5.05
U2AF2-206ENST00000590551 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.56■■■■■ 5.04
U2AF2-206ENST00000590551 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.4■■■■■ 5.02
U2AF2-206ENST00000590551 SYNJ2O15056 1496 aa46.39■■■■■ 5.02
U2AF2-206ENST00000590551 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.37■■■■■ 5.01
U2AF2-206ENST00000590551 ARAP1Q96P48 1450 aa46.37■■■■■ 5.01
U2AF2-206ENST00000590551 SYNJ1O43426 1573 aa46.34■■■■■ 5.01
U2AF2-206ENST00000590551 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.3■■■■■ 5
U2AF2-206ENST00000590551 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.28■■■■■ 5
U2AF2-206ENST00000590551 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.17■■■■■ 4.98
U2AF2-206ENST00000590551 PBRM1Q86U86 1689 aa46.15■■■■■ 4.98
U2AF2-206ENST00000590551 TOP2BQ02880 1626 aa46.07■■■■■ 4.97
U2AF2-206ENST00000590551 TRHP20396 242 aaPredicted RBP46.04■■■■■ 4.96
U2AF2-206ENST00000590551 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.02■■■■■ 4.96
U2AF2-206ENST00000590551 GRIN2AQ12879 1464 aa45.93■■■■■ 4.94
U2AF2-206ENST00000590551 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.86■■■■■ 4.93
U2AF2-206ENST00000590551 ADAMTS12P58397 1594 aa45.84■■■■■ 4.93
U2AF2-206ENST00000590551 NUP160Q12769 1436 aa45.8■■■■■ 4.92
U2AF2-206ENST00000590551 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.79■■■■■ 4.92
U2AF2-206ENST00000590551 CEP170Q5SW79 1584 aa45.66■■■■■ 4.9
U2AF2-206ENST00000590551 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.51■■■■■ 4.88
U2AF2-206ENST00000590551 SHROOM2Q13796 1616 aa45.47■■■■■ 4.87
U2AF2-206ENST00000590551 JPH4Q96JJ6 628 aa45.42■■■■■ 4.86
U2AF2-206ENST00000590551 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP45.35■■■■■ 4.85
U2AF2-206ENST00000590551 KIF27Q86VH2 1401 aa45.32■■■■■ 4.85
U2AF2-206ENST00000590551 IGF1RP08069 1367 aa45.29■■■■■ 4.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.7 ms