RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579310.5

SPATA33-209, Transcript of spermatogenesis associated 33, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene SPATA33, Length 1,490 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA33-209ENST00000579310 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.34■■■■■ 7.25
SPATA33-209ENST00000579310 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.43■■■■■ 6.14
SPATA33-209ENST00000579310 ABCC9O60706 1549 aa51.73■■■■■ 5.87
SPATA33-209ENST00000579310 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.39■■■■■ 5.66
SPATA33-209ENST00000579310 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.11■■■■■ 5.61
SPATA33-209ENST00000579310 NACADO15069 1562 aa50.05■■■■■ 5.6
SPATA33-209ENST00000579310 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.98■■■■■ 5.59
SPATA33-209ENST00000579310 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.92■■■■■ 5.58
SPATA33-209ENST00000579310 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.92■■■■■ 5.58
SPATA33-209ENST00000579310 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.02■■■■■ 5.44
SPATA33-209ENST00000579310 SCRIBQ14160 1630 aa48.82■■■■■ 5.41
SPATA33-209ENST00000579310 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.54■■■■■ 5.36
SPATA33-209ENST00000579310 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.41■■■■■ 5.34
SPATA33-209ENST00000579310 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.99■■■■■ 5.27
SPATA33-209ENST00000579310 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.16■■■■■ 5.14
SPATA33-209ENST00000579310 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.01■■■■■ 5.12
SPATA33-209ENST00000579310 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.98■■■■■ 5.11
SPATA33-209ENST00000579310 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.85■■■■■ 5.09
SPATA33-209ENST00000579310 SMARCA4P51532 1647 aa46.74■■■■■ 5.07
SPATA33-209ENST00000579310 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.71■■■■■ 5.07
SPATA33-209ENST00000579310 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.54■■■■■ 5.04
SPATA33-209ENST00000579310 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.3■■■■■ 5
SPATA33-209ENST00000579310 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.25■■■■■ 5
SPATA33-209ENST00000579310 SMARCA2P51531 1590 aa46.25■■■■■ 4.99
SPATA33-209ENST00000579310 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.17■■■■■ 4.98
SPATA33-209ENST00000579310 NCAPD3P42695 1498 aa46.17■■■■■ 4.98
SPATA33-209ENST00000579310 WIZO95785 1651 aa46.11■■■■■ 4.97
SPATA33-209ENST00000579310 HMGXB3Q12766 1538 aa46.02■■■■■ 4.96
SPATA33-209ENST00000579310 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.94■■■■■ 4.94
SPATA33-209ENST00000579310 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.59■■■■■ 4.89
SPATA33-209ENST00000579310 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.38■■■■■ 4.86
SPATA33-209ENST00000579310 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.05■■■■■ 4.8
SPATA33-209ENST00000579310 NESP48681 1621 aa44.97■■■■■ 4.79
SPATA33-209ENST00000579310 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.89■■■■■ 4.78
SPATA33-209ENST00000579310 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.84■■■■■ 4.77
SPATA33-209ENST00000579310 CFTRP13569 1480 aa44.71■■■■■ 4.75
SPATA33-209ENST00000579310 PRDM2Q13029 1718 aa44.53■■■■■ 4.72
SPATA33-209ENST00000579310 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.51■■■■■ 4.72
SPATA33-209ENST00000579310 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.5■■■■■ 4.71
SPATA33-209ENST00000579310 ERCC6Q03468 1493 aa44.49■■■■■ 4.71
SPATA33-209ENST00000579310 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.35■■■■■ 4.69
SPATA33-209ENST00000579310 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.24■■■■■ 4.67
SPATA33-209ENST00000579310 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.19■■■■■ 4.66
SPATA33-209ENST00000579310 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.06■■■■■ 4.64
SPATA33-209ENST00000579310 WDR62O43379 1518 aa43.93■■■■■ 4.62
SPATA33-209ENST00000579310 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.92■■■■■ 4.62
SPATA33-209ENST00000579310 CUX2O14529 1486 aa43.83■■■■■ 4.61
SPATA33-209ENST00000579310 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.73■■■■■ 4.59
SPATA33-209ENST00000579310 TOPBP1Q92547 1522 aa43.72■■■■■ 4.59
SPATA33-209ENST00000579310 ABCC8Q09428 1581 aa43.67■■■■■ 4.58
SPATA33-209ENST00000579310 CUX1P39880 1505 aa43.63■■■■■ 4.57
SPATA33-209ENST00000579310 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.5■■■■■ 4.55
SPATA33-209ENST00000579310 SYNJ1O43426 1573 aa43.44■■■■■ 4.54
SPATA33-209ENST00000579310 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.41■■■■■ 4.54
SPATA33-209ENST00000579310 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.4■■■■■ 4.54
SPATA33-209ENST00000579310 TOP2BQ02880 1626 aa43.39■■■■■ 4.54
SPATA33-209ENST00000579310 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.37■■■■■ 4.53
SPATA33-209ENST00000579310 IFT140Q96RY7 1462 aa43.27■■■■■ 4.52
SPATA33-209ENST00000579310 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.25■■■■■ 4.51
SPATA33-209ENST00000579310 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.21■■■■■ 4.51
SPATA33-209ENST00000579310 SOGA1O94964 1423 aa43.18■■■■■ 4.5
SPATA33-209ENST00000579310 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.09■■■■■ 4.49
SPATA33-209ENST00000579310 WDR97A6NE52 1622 aa43.07■■■■■ 4.48
SPATA33-209ENST00000579310 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.97■■■■■ 4.47
SPATA33-209ENST00000579310 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.96■■■■■ 4.47
SPATA33-209ENST00000579310 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.9■■■■■ 4.46
SPATA33-209ENST00000579310 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.89■■■■■ 4.46
SPATA33-209ENST00000579310 TRIM41Q8WV44 630 aa42.8■■■■■ 4.44
SPATA33-209ENST00000579310 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.8■■■■■ 4.44
SPATA33-209ENST00000579310 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.7■■■■■ 4.43
SPATA33-209ENST00000579310 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.69■■■■■ 4.42
SPATA33-209ENST00000579310 PBRM1Q86U86 1689 aa42.68■■■■■ 4.42
SPATA33-209ENST00000579310 GRIN2BQ13224 1484 aa42.61■■■■■ 4.41
SPATA33-209ENST00000579310 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.52■■■■■ 4.4
SPATA33-209ENST00000579310 KIF27Q86VH2 1401 aa42.51■■■■■ 4.4
SPATA33-209ENST00000579310 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.45■■■■■ 4.39
SPATA33-209ENST00000579310 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.45■■■■■ 4.39
SPATA33-209ENST00000579310 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.41■■■■■ 4.38
SPATA33-209ENST00000579310 CHD1O14646 1710 aa42.36■■■■■ 4.37
SPATA33-209ENST00000579310 ADAMTS12P58397 1594 aa42.34■■■■■ 4.37
SPATA33-209ENST00000579310 IGF1RP08069 1367 aa42.3■■■■■ 4.36
SPATA33-209ENST00000579310 SYNJ2O15056 1496 aa42.28■■■■■ 4.36
SPATA33-209ENST00000579310 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.21■■■■■ 4.35
SPATA33-209ENST00000579310 FBLN2P98095 1184 aa42.21■■■■■ 4.35
SPATA33-209ENST00000579310 CUL7Q14999 1698 aa42.2■■■■■ 4.35
SPATA33-209ENST00000579310 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.17■■■■■ 4.34
SPATA33-209ENST00000579310 GRIN2AQ12879 1464 aa42.09■■■■■ 4.33
SPATA33-209ENST00000579310 OSCARQ8IYS5 282 aa42.07■■■■■ 4.33
SPATA33-209ENST00000579310 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.05■■■■■ 4.32
SPATA33-209ENST00000579310 EEA1Q15075 1411 aa42.04■■■■■ 4.32
SPATA33-209ENST00000579310 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.94■■■■■ 4.3
SPATA33-209ENST00000579310 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.92■■■■■ 4.3
SPATA33-209ENST00000579310 CEP170Q5SW79 1584 aa41.92■■■■■ 4.3
SPATA33-209ENST00000579310 NUP160Q12769 1436 aa41.88■■■■■ 4.29
SPATA33-209ENST00000579310 PRXQ9BXM0 1461 aa41.88■■■■■ 4.29
SPATA33-209ENST00000579310 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.87■■■■■ 4.29
SPATA33-209ENST00000579310 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.86■■■■■ 4.29
SPATA33-209ENST00000579310 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.83■■■■■ 4.29
SPATA33-209ENST00000579310 KIF21BO75037 1637 aa41.66■■■■■ 4.26
SPATA33-209ENST00000579310 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.59■■■■■ 4.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms