RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272421.10

ANKRD53-201, Transcript of ankyrin repeat domain 53, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD53, Length 2,185 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53-201ENST00000272421 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.2■■■■■ 5.79
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ANKRD53-201ENST00000272421 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.33■■■■■ 4.53
ANKRD53-201ENST00000272421 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.99■■■■■ 4.47
ANKRD53-201ENST00000272421 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.24■■■■■ 4.35
ANKRD53-201ENST00000272421 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.04■■■■■ 4.32
ANKRD53-201ENST00000272421 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.88■■■■■ 4.29
ANKRD53-201ENST00000272421 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.15■■■■■ 4.18
ANKRD53-201ENST00000272421 CHIC1Q5VXU3 224 aa41■■■■■ 4.15
ANKRD53-201ENST00000272421 ABCC9O60706 1549 aa40.88■■■■■ 4.13
ANKRD53-201ENST00000272421 SCRIBQ14160 1630 aa40.72■■■■■ 4.11
ANKRD53-201ENST00000272421 NACADO15069 1562 aa40.55■■■■■ 4.08
ANKRD53-201ENST00000272421 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.34■■■■■ 4.05
ANKRD53-201ENST00000272421 HRCP23327 699 aa40.08■■■■■ 4.01
ANKRD53-201ENST00000272421 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.99■■■■□ 3.99
ANKRD53-201ENST00000272421 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.77■■■■□ 3.96
ANKRD53-201ENST00000272421 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.69■■■■□ 3.94
ANKRD53-201ENST00000272421 PCGF6Q9BYE7 350 aa39.64■■■■□ 3.94
ANKRD53-201ENST00000272421 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.56■■■■□ 3.92
ANKRD53-201ENST00000272421 WIZO95785 1651 aa39.47■■■■□ 3.91
ANKRD53-201ENST00000272421 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.39■■■■□ 3.9
ANKRD53-201ENST00000272421 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.38■■■■□ 3.9
ANKRD53-201ENST00000272421 TRIM41Q8WV44 630 aa39.33■■■■□ 3.89
ANKRD53-201ENST00000272421 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP39.1■■■■□ 3.85
ANKRD53-201ENST00000272421 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.08■■■■□ 3.85
ANKRD53-201ENST00000272421 SMARCA4P51532 1647 aa39.07■■■■□ 3.84
ANKRD53-201ENST00000272421 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39■■■■□ 3.83
ANKRD53-201ENST00000272421 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.88■■■■□ 3.81
ANKRD53-201ENST00000272421 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP38.83■■■■□ 3.81
ANKRD53-201ENST00000272421 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP38.77■■■■□ 3.8
ANKRD53-201ENST00000272421 SMARCA2P51531 1590 aa38.73■■■■□ 3.79
ANKRD53-201ENST00000272421 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.67■■■■□ 3.78
ANKRD53-201ENST00000272421 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.67■■■■□ 3.78
ANKRD53-201ENST00000272421 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.48■■■■□ 3.75
ANKRD53-201ENST00000272421 ABCC8Q09428 1581 aa38.42■■■■□ 3.74
ANKRD53-201ENST00000272421 EHMT2Q96KQ7 1210 aa38.25■■■■□ 3.71
ANKRD53-201ENST00000272421 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP38.21■■■■□ 3.71
ANKRD53-201ENST00000272421 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.04■■■■□ 3.68
ANKRD53-201ENST00000272421 EEA1Q15075 1411 aa38.04■■■■□ 3.68
ANKRD53-201ENST00000272421 SOGA1O94964 1423 aa37.99■■■■□ 3.67
ANKRD53-201ENST00000272421 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.9■■■■□ 3.66
ANKRD53-201ENST00000272421 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.89■■■■□ 3.66
ANKRD53-201ENST00000272421 TNIKQ9UKE5 1360 aa37.83■■■■□ 3.65
ANKRD53-201ENST00000272421 CEP162Q5TB80 1403 aa37.8■■■■□ 3.64
ANKRD53-201ENST00000272421 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.79■■■■□ 3.64
ANKRD53-201ENST00000272421 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.76■■■■□ 3.63
ANKRD53-201ENST00000272421 SYNJ1O43426 1573 aa37.76■■■■□ 3.63
ANKRD53-201ENST00000272421 GOLGA3Q08378 1498 aa37.67■■■■□ 3.62
ANKRD53-201ENST00000272421 KIF21BO75037 1637 aa37.55■■■■□ 3.6
ANKRD53-201ENST00000272421 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.5■■■■□ 3.59
ANKRD53-201ENST00000272421 HMGXB3Q12766 1538 aa37.49■■■■□ 3.59
ANKRD53-201ENST00000272421 NCAPD3P42695 1498 aa37.45■■■■□ 3.59
ANKRD53-201ENST00000272421 UBTFP17480 764 aaKnown RBP37.43■■■■□ 3.58
ANKRD53-201ENST00000272421 TOP2BQ02880 1626 aa37.41■■■■□ 3.58
ANKRD53-201ENST00000272421 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.35■■■■□ 3.57
ANKRD53-201ENST00000272421 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP37.22■■■■□ 3.55
ANKRD53-201ENST00000272421 CLIP1P30622 1438 aa37.13■■■■□ 3.54
ANKRD53-201ENST00000272421 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.13■■■■□ 3.53
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ANKRD53-201ENST00000272421 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP37.07■■■■□ 3.53
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ANKRD53-201ENST00000272421 VPS8Q8N3P4 1428 aa37.02■■■■□ 3.52
ANKRD53-201ENST00000272421 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP37.02■■■■□ 3.52
ANKRD53-201ENST00000272421 CUX1P39880 1505 aa37■■■■□ 3.51
ANKRD53-201ENST00000272421 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37■■■■□ 3.51
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ANKRD53-201ENST00000272421 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.82■■■■□ 3.49
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ANKRD53-201ENST00000272421 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP36.71■■■■□ 3.47
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ANKRD53-201ENST00000272421 ARAP1Q96P48 1450 aa36.64■■■■□ 3.46
ANKRD53-201ENST00000272421 APLP2Q06481 763 aa36.6■■■■□ 3.45
ANKRD53-201ENST00000272421 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.6■■■■□ 3.45
ANKRD53-201ENST00000272421 NEUROD1Q13562 356 aa36.6■■■■□ 3.45
ANKRD53-201ENST00000272421 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP36.49■■■■□ 3.43
ANKRD53-201ENST00000272421 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP36.4■■■■□ 3.42
ANKRD53-201ENST00000272421 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP36.4■■■■□ 3.42
ANKRD53-201ENST00000272421 CUX2O14529 1486 aa36.39■■■■□ 3.42
ANKRD53-201ENST00000272421 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.35■■■■□ 3.41
ANKRD53-201ENST00000272421 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36.34■■■■□ 3.41
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ANKRD53-201ENST00000272421 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa36.26■■■■□ 3.4
ANKRD53-201ENST00000272421 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP36.26■■■■□ 3.39
ANKRD53-201ENST00000272421 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.23■■■■□ 3.39
ANKRD53-201ENST00000272421 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP36.17■■■■□ 3.38
ANKRD53-201ENST00000272421 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP36.17■■■■□ 3.38
ANKRD53-201ENST00000272421 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.15■■■■□ 3.38
ANKRD53-201ENST00000272421 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.14■■■■□ 3.38
ANKRD53-201ENST00000272421 NESP48681 1621 aa36.09■■■■□ 3.37
ANKRD53-201ENST00000272421 MAP3K1Q13233 1512 aa36.06■■■■□ 3.36
ANKRD53-201ENST00000272421 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.02■■■■□ 3.36
ANKRD53-201ENST00000272421 CLSPNQ9HAW4 1339 aa36.01■■■■□ 3.36
ANKRD53-201ENST00000272421 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.01■■■■□ 3.35
ANKRD53-201ENST00000272421 TOPBP1Q92547 1522 aa36■■■■□ 3.35
ANKRD53-201ENST00000272421 TIAM1Q13009 1591 aa35.99■■■■□ 3.35
ANKRD53-201ENST00000272421 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.96■■■■□ 3.35
ANKRD53-201ENST00000272421 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP35.94■■■■□ 3.34
ANKRD53-201ENST00000272421 CCNB3Q8WWL7 1395 aa35.92■■■■□ 3.34
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