RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611636.4

WHAMMP3-201, Transcript of WAS protein homolog associated with actin, golgi membranes and microtubules pseudogene 3, humanhuman

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Gene WHAMMP3, Length 1,609 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WHAMMP3-201ENST00000611636 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.94■■■■■ 6.87
WHAMMP3-201ENST00000611636 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51■■■■■ 5.75
WHAMMP3-201ENST00000611636 ABCC9O60706 1549 aa49.38■■■■■ 5.5
WHAMMP3-201ENST00000611636 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.53■■■■■ 5.36
WHAMMP3-201ENST00000611636 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.98■■■■■ 5.27
WHAMMP3-201ENST00000611636 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.97■■■■■ 5.27
WHAMMP3-201ENST00000611636 NACADO15069 1562 aa47.71■■■■■ 5.23
WHAMMP3-201ENST00000611636 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.68■■■■■ 5.22
WHAMMP3-201ENST00000611636 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.68■■■■■ 5.22
WHAMMP3-201ENST00000611636 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.77■■■■■ 5.08
WHAMMP3-201ENST00000611636 SCRIBQ14160 1630 aa46.68■■■■■ 5.06
WHAMMP3-201ENST00000611636 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.63■■■■■ 5.05
WHAMMP3-201ENST00000611636 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.28■■■■■ 5
WHAMMP3-201ENST00000611636 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.18■■■■■ 4.98
WHAMMP3-201ENST00000611636 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.01■■■■■ 4.8
WHAMMP3-201ENST00000611636 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.99■■■■■ 4.79
WHAMMP3-201ENST00000611636 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.91■■■■■ 4.78
WHAMMP3-201ENST00000611636 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.84■■■■■ 4.77
WHAMMP3-201ENST00000611636 SMARCA4P51532 1647 aa44.73■■■■■ 4.75
WHAMMP3-201ENST00000611636 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.72■■■■■ 4.75
WHAMMP3-201ENST00000611636 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.7■■■■■ 4.75
WHAMMP3-201ENST00000611636 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.61■■■■■ 4.73
WHAMMP3-201ENST00000611636 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.51■■■■■ 4.72
WHAMMP3-201ENST00000611636 WIZO95785 1651 aa44.34■■■■■ 4.69
WHAMMP3-201ENST00000611636 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.23■■■■■ 4.67
WHAMMP3-201ENST00000611636 SMARCA2P51531 1590 aa44.16■■■■■ 4.66
WHAMMP3-201ENST00000611636 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.13■■■■■ 4.65
WHAMMP3-201ENST00000611636 NCAPD3P42695 1498 aa43.99■■■■■ 4.63
WHAMMP3-201ENST00000611636 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.89■■■■■ 4.62
WHAMMP3-201ENST00000611636 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.86■■■■■ 4.61
WHAMMP3-201ENST00000611636 HMGXB3Q12766 1538 aa43.86■■■■■ 4.61
WHAMMP3-201ENST00000611636 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.37■■■■■ 4.53
WHAMMP3-201ENST00000611636 NESP48681 1621 aa42.89■■■■■ 4.46
WHAMMP3-201ENST00000611636 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.8■■■■■ 4.44
WHAMMP3-201ENST00000611636 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.72■■■■■ 4.43
WHAMMP3-201ENST00000611636 CFTRP13569 1480 aa42.7■■■■■ 4.43
WHAMMP3-201ENST00000611636 PRDM2Q13029 1718 aa42.62■■■■■ 4.41
WHAMMP3-201ENST00000611636 ERCC6Q03468 1493 aa42.49■■■■■ 4.39
WHAMMP3-201ENST00000611636 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.46■■■■■ 4.39
WHAMMP3-201ENST00000611636 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.44■■■■■ 4.38
WHAMMP3-201ENST00000611636 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.27■■■■■ 4.36
WHAMMP3-201ENST00000611636 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.23■■■■■ 4.35
WHAMMP3-201ENST00000611636 ABCC8Q09428 1581 aa42.21■■■■■ 4.35
WHAMMP3-201ENST00000611636 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.18■■■■■ 4.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.17■■■■■ 4.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.04■■■■■ 4.32
WHAMMP3-201ENST00000611636 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.03■■■■■ 4.32
WHAMMP3-201ENST00000611636 TRIM41Q8WV44 630 aa41.95■■■■■ 4.31
WHAMMP3-201ENST00000611636 SYNJ1O43426 1573 aa41.91■■■■■ 4.3
WHAMMP3-201ENST00000611636 WDR62O43379 1518 aa41.9■■■■■ 4.3
WHAMMP3-201ENST00000611636 CUX2O14529 1486 aa41.87■■■■■ 4.29
WHAMMP3-201ENST00000611636 CUX1P39880 1505 aa41.87■■■■■ 4.29
WHAMMP3-201ENST00000611636 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.86■■■■■ 4.29
WHAMMP3-201ENST00000611636 TOP2BQ02880 1626 aa41.85■■■■■ 4.29
WHAMMP3-201ENST00000611636 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.85■■■■■ 4.29
WHAMMP3-201ENST00000611636 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.77■■■■■ 4.28
WHAMMP3-201ENST00000611636 TOPBP1Q92547 1522 aa41.7■■■■■ 4.27
WHAMMP3-201ENST00000611636 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.52■■■■■ 4.24
WHAMMP3-201ENST00000611636 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.43■■■■■ 4.22
WHAMMP3-201ENST00000611636 SOGA1O94964 1423 aa41.28■■■■■ 4.2
WHAMMP3-201ENST00000611636 IFT140Q96RY7 1462 aa41.26■■■■■ 4.2
WHAMMP3-201ENST00000611636 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.25■■■■■ 4.19
WHAMMP3-201ENST00000611636 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.22■■■■■ 4.19
WHAMMP3-201ENST00000611636 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.16■■■■■ 4.18
WHAMMP3-201ENST00000611636 WDR97A6NE52 1622 aa41.15■■■■■ 4.18
WHAMMP3-201ENST00000611636 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.12■■■■■ 4.17
WHAMMP3-201ENST00000611636 EEA1Q15075 1411 aa41.1■■■■■ 4.17
WHAMMP3-201ENST00000611636 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.1■■■■■ 4.17
WHAMMP3-201ENST00000611636 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.09■■■■■ 4.17
WHAMMP3-201ENST00000611636 KIF27Q86VH2 1401 aa41.07■■■■■ 4.16
WHAMMP3-201ENST00000611636 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.99■■■■■ 4.15
WHAMMP3-201ENST00000611636 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.93■■■■■ 4.14
WHAMMP3-201ENST00000611636 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.9■■■■■ 4.14
WHAMMP3-201ENST00000611636 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.89■■■■■ 4.14
WHAMMP3-201ENST00000611636 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.87■■■■■ 4.13
WHAMMP3-201ENST00000611636 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.83■■■■■ 4.13
WHAMMP3-201ENST00000611636 PBRM1Q86U86 1689 aa40.75■■■■■ 4.11
WHAMMP3-201ENST00000611636 IGF1RP08069 1367 aa40.73■■■■■ 4.11
WHAMMP3-201ENST00000611636 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.7■■■■■ 4.11
WHAMMP3-201ENST00000611636 GRIN2BQ13224 1484 aa40.64■■■■■ 4.1
WHAMMP3-201ENST00000611636 KIF21BO75037 1637 aa40.63■■■■■ 4.09
WHAMMP3-201ENST00000611636 CUL7Q14999 1698 aa40.62■■■■■ 4.09
WHAMMP3-201ENST00000611636 PRXQ9BXM0 1461 aa40.58■■■■■ 4.09
WHAMMP3-201ENST00000611636 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.54■■■■■ 4.08
WHAMMP3-201ENST00000611636 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.54■■■■■ 4.08
WHAMMP3-201ENST00000611636 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.52■■■■■ 4.08
WHAMMP3-201ENST00000611636 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.51■■■■■ 4.08
WHAMMP3-201ENST00000611636 GOLGA3Q08378 1498 aa40.48■■■■■ 4.07
WHAMMP3-201ENST00000611636 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.46■■■■■ 4.07
WHAMMP3-201ENST00000611636 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.45■■■■■ 4.07
WHAMMP3-201ENST00000611636 ADAMTS12P58397 1594 aa40.44■■■■■ 4.06
WHAMMP3-201ENST00000611636 CHD1O14646 1710 aa40.44■■■■■ 4.06
WHAMMP3-201ENST00000611636 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.38■■■■■ 4.05
WHAMMP3-201ENST00000611636 SYNJ2O15056 1496 aa40.31■■■■■ 4.04
WHAMMP3-201ENST00000611636 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.28■■■■■ 4.04
WHAMMP3-201ENST00000611636 FBLN2P98095 1184 aa40.27■■■■■ 4.04
WHAMMP3-201ENST00000611636 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.2■■■■■ 4.03
WHAMMP3-201ENST00000611636 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.18■■■■■ 4.02
WHAMMP3-201ENST00000611636 OSCARQ8IYS5 282 aa40.16■■■■■ 4.02
WHAMMP3-201ENST00000611636 GRIN2AQ12879 1464 aa40.13■■■■■ 4.01
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