RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409356.1

HES6-205, Transcript of hes family bHLH transcription factor 6, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HES6, Length 528 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES6-205ENST00000409356 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.45■■■■■ 7.59
HES6-205ENST00000409356 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa55.58■■■■■ 6.49
HES6-205ENST00000409356 ABCC9O60706 1549 aa54.86■■■■■ 6.37
HES6-205ENST00000409356 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.55■■■■■ 6
HES6-205ENST00000409356 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.51■■■■■ 6
HES6-205ENST00000409356 NACADO15069 1562 aa52.41■■■■■ 5.98
HES6-205ENST00000409356 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.96■■■■■ 5.91
HES6-205ENST00000409356 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.92■■■■■ 5.9
HES6-205ENST00000409356 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.62■■■■■ 5.85
HES6-205ENST00000409356 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.28■■■■■ 5.8
HES6-205ENST00000409356 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.27■■■■■ 5.8
HES6-205ENST00000409356 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.96■■■■■ 5.75
HES6-205ENST00000409356 SCRIBQ14160 1630 aa50.77■■■■■ 5.72
HES6-205ENST00000409356 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.71■■■■■ 5.71
HES6-205ENST00000409356 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.37■■■■■ 5.65
HES6-205ENST00000409356 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.66■■■■■ 5.54
HES6-205ENST00000409356 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.55■■■■■ 5.52
HES6-205ENST00000409356 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.32■■■■■ 5.49
HES6-205ENST00000409356 SMARCA4P51532 1647 aa48.5■■■■■ 5.36
HES6-205ENST00000409356 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.42■■■■■ 5.34
HES6-205ENST00000409356 NCAPD3P42695 1498 aa48.4■■■■■ 5.34
HES6-205ENST00000409356 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.37■■■■■ 5.33
HES6-205ENST00000409356 SMARCA2P51531 1590 aa48.27■■■■■ 5.32
HES6-205ENST00000409356 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.13■■■■■ 5.3
HES6-205ENST00000409356 HMGXB3Q12766 1538 aa48.07■■■■■ 5.29
HES6-205ENST00000409356 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.01■■■■■ 5.28
HES6-205ENST00000409356 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.97■■■■■ 5.27
HES6-205ENST00000409356 WIZO95785 1651 aa47.57■■■■■ 5.21
HES6-205ENST00000409356 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.49■■■■■ 5.19
HES6-205ENST00000409356 NESP48681 1621 aa47.35■■■■■ 5.17
HES6-205ENST00000409356 ERCC6Q03468 1493 aa47.32■■■■■ 5.17
HES6-205ENST00000409356 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.14■■■■■ 5.14
HES6-205ENST00000409356 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.05■■■■■ 5.12
HES6-205ENST00000409356 CADPSQ9ULU8 1353 aa47■■■■■ 5.12
HES6-205ENST00000409356 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.9■■■■■ 5.1
HES6-205ENST00000409356 CUX2O14529 1486 aa46.89■■■■■ 5.1
HES6-205ENST00000409356 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.71■■■■■ 5.07
HES6-205ENST00000409356 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.63■■■■■ 5.06
HES6-205ENST00000409356 CFTRP13569 1480 aa46.62■■■■■ 5.05
HES6-205ENST00000409356 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.55■■■■■ 5.04
HES6-205ENST00000409356 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.44■■■■■ 5.03
HES6-205ENST00000409356 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.41■■■■■ 5.02
HES6-205ENST00000409356 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.41■■■■■ 5.02
HES6-205ENST00000409356 WDR62O43379 1518 aa46.23■■■■■ 4.99
HES6-205ENST00000409356 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.15■■■■■ 4.98
HES6-205ENST00000409356 PRDM2Q13029 1718 aa46.1■■■■■ 4.97
HES6-205ENST00000409356 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.98■■■■■ 4.95
HES6-205ENST00000409356 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.94■■■■■ 4.94
HES6-205ENST00000409356 TOPBP1Q92547 1522 aa45.65■■■■■ 4.9
HES6-205ENST00000409356 ABCC8Q09428 1581 aa45.63■■■■■ 4.9
HES6-205ENST00000409356 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.54■■■■■ 4.88
HES6-205ENST00000409356 IFT140Q96RY7 1462 aa45.45■■■■■ 4.87
HES6-205ENST00000409356 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.29■■■■■ 4.84
HES6-205ENST00000409356 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.23■■■■■ 4.83
HES6-205ENST00000409356 CUX1P39880 1505 aa45.16■■■■■ 4.82
HES6-205ENST00000409356 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.13■■■■■ 4.82
HES6-205ENST00000409356 SOGA1O94964 1423 aa45.1■■■■■ 4.81
HES6-205ENST00000409356 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.09■■■■■ 4.81
HES6-205ENST00000409356 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.08■■■■■ 4.81
HES6-205ENST00000409356 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.03■■■■■ 4.8
HES6-205ENST00000409356 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.03■■■■■ 4.86e-12■□□□□ 9.6
HES6-205ENST00000409356 OSCARQ8IYS5 282 aa45■■■■■ 4.79
HES6-205ENST00000409356 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.91■■■■■ 4.78
HES6-205ENST00000409356 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.79■■■■■ 4.76
HES6-205ENST00000409356 WDR97A6NE52 1622 aa44.73■■■■■ 4.75
HES6-205ENST00000409356 TOP2BQ02880 1626 aa44.67■■■■■ 4.74
HES6-205ENST00000409356 SYNJ1O43426 1573 aa44.65■■■■■ 4.74
HES6-205ENST00000409356 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.64■■■■■ 4.74
HES6-205ENST00000409356 FBLN2P98095 1184 aa44.63■■■■■ 4.74
HES6-205ENST00000409356 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.61■■■■■ 4.73
HES6-205ENST00000409356 GRIN2BQ13224 1484 aa44.58■■■■■ 4.73
HES6-205ENST00000409356 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.56■■■■■ 4.72
HES6-205ENST00000409356 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.54■■■■■ 4.72
HES6-205ENST00000409356 CHD1O14646 1710 aa44.51■■■■■ 4.72
HES6-205ENST00000409356 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.47■■■■■ 4.71
HES6-205ENST00000409356 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.44■■■■■ 4.7
HES6-205ENST00000409356 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.42■■■■■ 4.7
HES6-205ENST00000409356 PBRM1Q86U86 1689 aa44.38■■■■■ 4.69
HES6-205ENST00000409356 TRIM41Q8WV44 630 aa44.34■■■■■ 4.69
HES6-205ENST00000409356 SYNJ2O15056 1496 aa44.32■■■■■ 4.69
HES6-205ENST00000409356 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.19■■■■■ 4.66
HES6-205ENST00000409356 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.19■■■■■ 4.66
HES6-205ENST00000409356 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.19■■■■■ 4.66
HES6-205ENST00000409356 ARHGEF11O15085 1522 aa44.17■■■■■ 4.66
HES6-205ENST00000409356 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.07■■■■■ 4.65
HES6-205ENST00000409356 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.04■■■■■ 4.64
HES6-205ENST00000409356 ADAMTS12P58397 1594 aa44.03■■■■■ 4.64
HES6-205ENST00000409356 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.02■■■■■ 4.64
HES6-205ENST00000409356 GRIN2AQ12879 1464 aa43.99■■■■■ 4.63
HES6-205ENST00000409356 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.9■■■■■ 4.62
HES6-205ENST00000409356 KIF27Q86VH2 1401 aa43.9■■■■■ 4.62
HES6-205ENST00000409356 NUP160Q12769 1436 aa43.81■■■■■ 4.6
HES6-205ENST00000409356 ARAP1Q96P48 1450 aa43.79■■■■■ 4.6
HES6-205ENST00000409356 IGF1RP08069 1367 aa43.78■■■■■ 4.6
HES6-205ENST00000409356 CEP170Q5SW79 1584 aa43.76■■■■■ 4.6
HES6-205ENST00000409356 CUL7Q14999 1698 aa43.57■■■■■ 4.57
HES6-205ENST00000409356 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.52■■■■■ 4.56
HES6-205ENST00000409356 SHROOM2Q13796 1616 aa43.45■■■■■ 4.55
HES6-205ENST00000409356 JPH4Q96JJ6 628 aa43.45■■■■■ 4.55
HES6-205ENST00000409356 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.45■■■■■ 4.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.6 ms