RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318622.8

RHBDD2-202, Transcript of rhomboid domain containing 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RHBDD2, Length 1,878 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2-202ENST00000318622 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.23■■■■■ 6.59
RHBDD2-202ENST00000318622 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.05■■■■■ 5.44
RHBDD2-202ENST00000318622 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.23■■■■■ 5.15
RHBDD2-202ENST00000318622 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.6■■■■■ 5.05
RHBDD2-202ENST00000318622 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.28■■■■■ 5
RHBDD2-202ENST00000318622 ABCC9O60706 1549 aa46.26■■■■■ 5
RHBDD2-202ENST00000318622 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.08■■■■■ 4.97
RHBDD2-202ENST00000318622 NACADO15069 1562 aa45.72■■■■■ 4.91
RHBDD2-202ENST00000318622 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.65■■■■■ 4.9
RHBDD2-202ENST00000318622 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.28■■■■■ 4.84
RHBDD2-202ENST00000318622 SCRIBQ14160 1630 aa44.96■■■■■ 4.79
RHBDD2-202ENST00000318622 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.28■■■■■ 4.68
RHBDD2-202ENST00000318622 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.97■■■■■ 4.63
RHBDD2-202ENST00000318622 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.89■■■■■ 4.62
RHBDD2-202ENST00000318622 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.62■■■■■ 4.57
RHBDD2-202ENST00000318622 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.61■■■■■ 4.57
RHBDD2-202ENST00000318622 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.6■■■■■ 4.57
RHBDD2-202ENST00000318622 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.43■■■■■ 4.54
RHBDD2-202ENST00000318622 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.38■■■■■ 4.54
RHBDD2-202ENST00000318622 SMARCA4P51532 1647 aa43.19■■■■■ 4.5
RHBDD2-202ENST00000318622 WIZO95785 1651 aa42.99■■■■■ 4.47
RHBDD2-202ENST00000318622 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.76■■■■■ 4.44
RHBDD2-202ENST00000318622 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.62■■■■■ 4.41
RHBDD2-202ENST00000318622 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.57■■■■■ 4.41
RHBDD2-202ENST00000318622 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.52■■■■■ 4.4
RHBDD2-202ENST00000318622 SMARCA2P51531 1590 aa42.51■■■■■ 4.4
RHBDD2-202ENST00000318622 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.24■■■■■ 4.35
RHBDD2-202ENST00000318622 NCAPD3P42695 1498 aa42.21■■■■■ 4.35
RHBDD2-202ENST00000318622 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.19■■■■■ 4.34
RHBDD2-202ENST00000318622 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.17■■■■■ 4.34
RHBDD2-202ENST00000318622 HMGXB3Q12766 1538 aa42.12■■■■■ 4.33
RHBDD2-202ENST00000318622 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.91■■■■■ 4.3
RHBDD2-202ENST00000318622 TRIM41Q8WV44 630 aa41.43■■■■■ 4.22
RHBDD2-202ENST00000318622 CFTRP13569 1480 aa41.25■■■■■ 4.19
RHBDD2-202ENST00000318622 ABCC8Q09428 1581 aa41.19■■■■■ 4.18
RHBDD2-202ENST00000318622 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.1■■■■■ 4.17
RHBDD2-202ENST00000318622 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.03■■■■■ 4.16
RHBDD2-202ENST00000318622 PRDM2Q13029 1718 aa40.98■■■■■ 4.15
RHBDD2-202ENST00000318622 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.82■■■■■ 4.13
RHBDD2-202ENST00000318622 SYNJ1O43426 1573 aa40.81■■■■■ 4.12
RHBDD2-202ENST00000318622 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.74■■■■■ 4.11
RHBDD2-202ENST00000318622 TOP2BQ02880 1626 aa40.71■■■■■ 4.11
RHBDD2-202ENST00000318622 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.66■■■■■ 4.1
RHBDD2-202ENST00000318622 NESP48681 1621 aa40.61■■■■■ 4.09
RHBDD2-202ENST00000318622 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.59■■■■■ 4.09
RHBDD2-202ENST00000318622 CUX1P39880 1505 aa40.57■■■■■ 4.09
RHBDD2-202ENST00000318622 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.53■■■■■ 4.08
RHBDD2-202ENST00000318622 EEA1Q15075 1411 aa40.53■■■■■ 4.08
RHBDD2-202ENST00000318622 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.49■■■■■ 4.07
RHBDD2-202ENST00000318622 SOGA1O94964 1423 aa40.47■■■■■ 4.07
RHBDD2-202ENST00000318622 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.44■■■■■ 4.06
RHBDD2-202ENST00000318622 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.33■■■■■ 4.05
RHBDD2-202ENST00000318622 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.29■■■■■ 4.04
RHBDD2-202ENST00000318622 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.24■■■■■ 4.03
RHBDD2-202ENST00000318622 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.24■■■■■ 4.03
RHBDD2-202ENST00000318622 TOPBP1Q92547 1522 aa40.15■■■■■ 4.02
RHBDD2-202ENST00000318622 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.13■■■■■ 4.01
RHBDD2-202ENST00000318622 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.12■■■■■ 4.01
RHBDD2-202ENST00000318622 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.07■■■■■ 4.01
RHBDD2-202ENST00000318622 KIF27Q86VH2 1401 aa40.02■■■■■ 4
RHBDD2-202ENST00000318622 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.96■■■■□ 3.99
RHBDD2-202ENST00000318622 KIF21BO75037 1637 aa39.92■■■■□ 3.98
RHBDD2-202ENST00000318622 GOLGA3Q08378 1498 aa39.88■■■■□ 3.97
RHBDD2-202ENST00000318622 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.87■■■■□ 3.97
RHBDD2-202ENST00000318622 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.86■■■■□ 3.97
RHBDD2-202ENST00000318622 CUX2O14529 1486 aa39.86■■■■□ 3.97
RHBDD2-202ENST00000318622 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.84■■■■□ 3.97
RHBDD2-202ENST00000318622 TNIKQ9UKE5 1360 aa39.79■■■■□ 3.96
RHBDD2-202ENST00000318622 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.77■■■■□ 3.96
RHBDD2-202ENST00000318622 PRXQ9BXM0 1461 aa39.76■■■■□ 3.96
RHBDD2-202ENST00000318622 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.69■■■■□ 3.94
RHBDD2-202ENST00000318622 ERCC6Q03468 1493 aa39.69■■■■□ 3.94
RHBDD2-202ENST00000318622 WDR62O43379 1518 aa39.68■■■■□ 3.94
RHBDD2-202ENST00000318622 IGF1RP08069 1367 aa39.67■■■■□ 3.94
RHBDD2-202ENST00000318622 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.65■■■■□ 3.94
RHBDD2-202ENST00000318622 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.65■■■■□ 3.94
RHBDD2-202ENST00000318622 WDR97A6NE52 1622 aa39.65■■■■□ 3.94
RHBDD2-202ENST00000318622 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.56■■■■□ 3.92
RHBDD2-202ENST00000318622 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.52■■■■□ 3.92
RHBDD2-202ENST00000318622 CEP162Q5TB80 1403 aa39.5■■■■□ 3.91
RHBDD2-202ENST00000318622 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.48■■■■□ 3.91
RHBDD2-202ENST00000318622 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.46■■■■□ 3.91
RHBDD2-202ENST00000318622 IFT140Q96RY7 1462 aa39.41■■■■□ 3.9
RHBDD2-202ENST00000318622 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.4■■■■□ 3.9
RHBDD2-202ENST00000318622 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.4■■■■□ 3.9
RHBDD2-202ENST00000318622 CUL7Q14999 1698 aa39.35■■■■□ 3.89
RHBDD2-202ENST00000318622 CLIP1P30622 1438 aa39.22■■■■□ 3.87
RHBDD2-202ENST00000318622 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.16■■■■□ 3.86
RHBDD2-202ENST00000318622 PBRM1Q86U86 1689 aa39.12■■■■□ 3.85
RHBDD2-202ENST00000318622 GRIN2BQ13224 1484 aa39.11■■■■□ 3.85
RHBDD2-202ENST00000318622 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.11■■■■□ 3.85
RHBDD2-202ENST00000318622 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.01■■■■□ 3.83
RHBDD2-202ENST00000318622 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.98■■■■□ 3.83
RHBDD2-202ENST00000318622 ADAMTS12P58397 1594 aa38.94■■■■□ 3.82
RHBDD2-202ENST00000318622 VPS8Q8N3P4 1428 aa38.9■■■■□ 3.82
RHBDD2-202ENST00000318622 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP38.86■■■■□ 3.81
RHBDD2-202ENST00000318622 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa38.86■■■■□ 3.81
RHBDD2-202ENST00000318622 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa38.84■■■■□ 3.81
RHBDD2-202ENST00000318622 ARAP1Q96P48 1450 aa38.82■■■■□ 3.81
RHBDD2-202ENST00000318622 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.8■■■■□ 3.8
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