RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560748.5

ANKRD9-205, Transcript of ankyrin repeat domain 9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ANKRD9, Length 1,413 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD9-205ENST00000560748 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.09■■■■■ 7.05
ANKRD9-205ENST00000560748 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.01■■■■■ 5.92
ANKRD9-205ENST00000560748 ABCC9O60706 1549 aa50.57■■■■■ 5.69
ANKRD9-205ENST00000560748 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.41■■■■■ 5.5
ANKRD9-205ENST00000560748 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.02■■■■■ 5.44
ANKRD9-205ENST00000560748 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.87■■■■■ 5.41
ANKRD9-205ENST00000560748 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.71■■■■■ 5.39
ANKRD9-205ENST00000560748 NACADO15069 1562 aa48.71■■■■■ 5.39
ANKRD9-205ENST00000560748 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.64■■■■■ 5.38
ANKRD9-205ENST00000560748 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.65■■■■■ 5.22
ANKRD9-205ENST00000560748 SCRIBQ14160 1630 aa47.63■■■■■ 5.22
ANKRD9-205ENST00000560748 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.39■■■■■ 5.18
ANKRD9-205ENST00000560748 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.32■■■■■ 5.17
ANKRD9-205ENST00000560748 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.22■■■■■ 5.15
ANKRD9-205ENST00000560748 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.28■■■■■ 5
ANKRD9-205ENST00000560748 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.03■■■■■ 4.96
ANKRD9-205ENST00000560748 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.93■■■■■ 4.94
ANKRD9-205ENST00000560748 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.68■■■■■ 4.9
ANKRD9-205ENST00000560748 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.66■■■■■ 4.9
ANKRD9-205ENST00000560748 SMARCA4P51532 1647 aa45.62■■■■■ 4.89
ANKRD9-205ENST00000560748 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.62■■■■■ 4.89
ANKRD9-205ENST00000560748 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.42■■■■■ 4.86
ANKRD9-205ENST00000560748 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.19■■■■■ 4.82
ANKRD9-205ENST00000560748 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.16■■■■■ 4.82
ANKRD9-205ENST00000560748 WIZO95785 1651 aa45.15■■■■■ 4.82
ANKRD9-205ENST00000560748 SMARCA2P51531 1590 aa45.07■■■■■ 4.81
ANKRD9-205ENST00000560748 NCAPD3P42695 1498 aa45.01■■■■■ 4.8
ANKRD9-205ENST00000560748 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.96■■■■■ 4.79
ANKRD9-205ENST00000560748 HMGXB3Q12766 1538 aa44.8■■■■■ 4.76
ANKRD9-205ENST00000560748 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.8■■■■■ 4.76
ANKRD9-205ENST00000560748 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.65■■■■■ 4.74
ANKRD9-205ENST00000560748 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.21■■■■■ 4.67
ANKRD9-205ENST00000560748 NESP48681 1621 aa43.79■■■■■ 4.6
ANKRD9-205ENST00000560748 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.74■■■■■ 4.59
ANKRD9-205ENST00000560748 CFTRP13569 1480 aa43.68■■■■■ 4.58
ANKRD9-205ENST00000560748 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.67■■■■■ 4.58
ANKRD9-205ENST00000560748 ERCC6Q03468 1493 aa43.57■■■■■ 4.57
ANKRD9-205ENST00000560748 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.39■■■■■ 4.54
ANKRD9-205ENST00000560748 PRDM2Q13029 1718 aa43.3■■■■■ 4.52
ANKRD9-205ENST00000560748 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.3■■■■■ 4.52
ANKRD9-205ENST00000560748 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.23■■■■■ 4.51
ANKRD9-205ENST00000560748 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.07■■■■■ 4.49
ANKRD9-205ENST00000560748 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.03■■■■■ 4.48
ANKRD9-205ENST00000560748 CUX2O14529 1486 aa42.92■■■■■ 4.46
ANKRD9-205ENST00000560748 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.91■■■■■ 4.46
ANKRD9-205ENST00000560748 ABCC8Q09428 1581 aa42.88■■■■■ 4.45
ANKRD9-205ENST00000560748 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.8■■■■■ 4.44
ANKRD9-205ENST00000560748 WDR62O43379 1518 aa42.78■■■■■ 4.44
ANKRD9-205ENST00000560748 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.73■■■■■ 4.43
ANKRD9-205ENST00000560748 CUX1P39880 1505 aa42.72■■■■■ 4.43
ANKRD9-205ENST00000560748 TOPBP1Q92547 1522 aa42.66■■■■■ 4.42
ANKRD9-205ENST00000560748 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.64■■■■■ 4.42
ANKRD9-205ENST00000560748 SYNJ1O43426 1573 aa42.63■■■■■ 4.41
ANKRD9-205ENST00000560748 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.56■■■■■ 4.4
ANKRD9-205ENST00000560748 TOP2BQ02880 1626 aa42.53■■■■■ 4.4
ANKRD9-205ENST00000560748 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.51■■■■■ 4.4
ANKRD9-205ENST00000560748 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.39■■■■■ 4.38
ANKRD9-205ENST00000560748 TRIM41Q8WV44 630 aa42.37■■■■■ 4.37
ANKRD9-205ENST00000560748 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.36■■■■■ 4.37
ANKRD9-205ENST00000560748 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.23■■■■■ 4.35
ANKRD9-205ENST00000560748 SOGA1O94964 1423 aa42.2■■■■■ 4.35
ANKRD9-205ENST00000560748 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.14■■■■■ 4.34
ANKRD9-205ENST00000560748 IFT140Q96RY7 1462 aa42.1■■■■■ 4.33
ANKRD9-205ENST00000560748 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.01■■■■■ 4.32
ANKRD9-205ENST00000560748 WDR97A6NE52 1622 aa41.97■■■■■ 4.31
ANKRD9-205ENST00000560748 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.96■■■■■ 4.31
ANKRD9-205ENST00000560748 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.9■■■■■ 4.3
ANKRD9-205ENST00000560748 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.83■■■■■ 4.292e-16■■■■■ 49.6
ANKRD9-205ENST00000560748 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.82■■■■■ 4.29
ANKRD9-205ENST00000560748 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.79■■■■■ 4.28
ANKRD9-205ENST00000560748 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.76■■■■■ 4.28
ANKRD9-205ENST00000560748 KIF27Q86VH2 1401 aa41.72■■■■■ 4.27
ANKRD9-205ENST00000560748 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.7■■■■■ 4.27
ANKRD9-205ENST00000560748 IGF1RP08069 1367 aa41.57■■■■■ 4.24
ANKRD9-205ENST00000560748 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.55■■■■■ 4.24
ANKRD9-205ENST00000560748 GRIN2BQ13224 1484 aa41.55■■■■■ 4.24
ANKRD9-205ENST00000560748 PBRM1Q86U86 1689 aa41.52■■■■■ 4.24
ANKRD9-205ENST00000560748 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.51■■■■■ 4.24
ANKRD9-205ENST00000560748 EEA1Q15075 1411 aa41.49■■■■■ 4.23
ANKRD9-205ENST00000560748 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.48■■■■■ 4.23
ANKRD9-205ENST00000560748 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.43■■■■■ 4.22
ANKRD9-205ENST00000560748 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.41■■■■■ 4.22
ANKRD9-205ENST00000560748 FBLN2P98095 1184 aa41.36■■■■■ 4.21
ANKRD9-205ENST00000560748 OSCARQ8IYS5 282 aa41.34■■■■■ 4.21
ANKRD9-205ENST00000560748 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.32■■■■■ 4.2
ANKRD9-205ENST00000560748 ADAMTS12P58397 1594 aa41.28■■■■■ 4.2
ANKRD9-205ENST00000560748 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.28■■■■■ 4.2
ANKRD9-205ENST00000560748 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.24■■■■■ 4.19
ANKRD9-205ENST00000560748 CUL7Q14999 1698 aa41.24■■■■■ 4.19
ANKRD9-205ENST00000560748 PRXQ9BXM0 1461 aa41.24■■■■■ 4.19
ANKRD9-205ENST00000560748 CHD1O14646 1710 aa41.23■■■■■ 4.19
ANKRD9-205ENST00000560748 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.21■■■■■ 4.19
ANKRD9-205ENST00000560748 SYNJ2O15056 1496 aa41.18■■■■■ 4.18
ANKRD9-205ENST00000560748 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.11■■■■■ 4.17
ANKRD9-205ENST00000560748 KIF21BO75037 1637 aa41.05■■■■■ 4.16
ANKRD9-205ENST00000560748 GRIN2AQ12879 1464 aa41.04■■■■■ 4.16
ANKRD9-205ENST00000560748 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.97■■■■■ 4.15
ANKRD9-205ENST00000560748 GOLGA3Q08378 1498 aa40.88■■■■■ 4.13
ANKRD9-205ENST00000560748 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.87■■■■■ 4.13
ANKRD9-205ENST00000560748 NUP160Q12769 1436 aa40.84■■■■■ 4.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms