RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371974.7

SURF1-201, Transcript of SURF1, cytochrome c oxidase assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SURF1, Length 1,093 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1-201ENST00000371974 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.46■■■■■ 7.43
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SURF1-201ENST00000371974 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.5■■■■■ 5.83
SURF1-201ENST00000371974 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.49■■■■■ 5.83
SURF1-201ENST00000371974 NACADO15069 1562 aa51.42■■■■■ 5.82
SURF1-201ENST00000371974 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.16■■■■■ 5.78
SURF1-201ENST00000371974 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.09■■■■■ 5.77
SURF1-201ENST00000371974 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.84■■■■■ 5.73
SURF1-201ENST00000371974 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.21■■■■■ 5.63
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SURF1-201ENST00000371974 SCRIBQ14160 1630 aa49.85■■■■■ 5.57
SURF1-201ENST00000371974 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.4■■■■■ 5.5
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SURF1-201ENST00000371974 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.41■■■■■ 5.34
SURF1-201ENST00000371974 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.13■■■■■ 5.3
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SURF1-201ENST00000371974 NCAPD3P42695 1498 aa47.46■■■■■ 5.19
SURF1-201ENST00000371974 SMARCA2P51531 1590 aa47.41■■■■■ 5.18
SURF1-201ENST00000371974 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.35■■■■■ 5.17
SURF1-201ENST00000371974 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.21■■■■■ 5.15
SURF1-201ENST00000371974 HMGXB3Q12766 1538 aa47.19■■■■■ 5.14
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SURF1-201ENST00000371974 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.09■■■■■ 4.97
SURF1-201ENST00000371974 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.94■■■■■ 4.95
SURF1-201ENST00000371974 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.82■■■■■ 4.93
SURF1-201ENST00000371974 CFTRP13569 1480 aa45.78■■■■■ 4.92
SURF1-201ENST00000371974 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.71■■■■■ 4.91
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SURF1-201ENST00000371974 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.49■■■■■ 4.87
SURF1-201ENST00000371974 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.43■■■■■ 4.86
SURF1-201ENST00000371974 PRDM2Q13029 1718 aa45.35■■■■■ 4.85
SURF1-201ENST00000371974 WDR62O43379 1518 aa45.25■■■■■ 4.83
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SURF1-201ENST00000371974 TOPBP1Q92547 1522 aa44.8■■■■■ 4.76
SURF1-201ENST00000371974 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.73■■■■■ 4.75
SURF1-201ENST00000371974 IFT140Q96RY7 1462 aa44.55■■■■■ 4.72
SURF1-201ENST00000371974 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.41■■■■■ 4.7
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SURF1-201ENST00000371974 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.3■■■■■ 4.68
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SURF1-201ENST00000371974 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.03■■■■■ 4.64
SURF1-201ENST00000371974 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44■■■■■ 4.63
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SURF1-201ENST00000371974 WDR97A6NE52 1622 aa43.95■■■■■ 4.63
SURF1-201ENST00000371974 OSCARQ8IYS5 282 aa43.88■■■■■ 4.62
SURF1-201ENST00000371974 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.88■■■■■ 4.61
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SURF1-201ENST00000371974 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.67■■■■■ 4.58
SURF1-201ENST00000371974 FBLN2P98095 1184 aa43.66■■■■■ 4.58
SURF1-201ENST00000371974 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.66■■■■■ 4.58
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SURF1-201ENST00000371974 SYNJ2O15056 1496 aa43.46■■■■■ 4.55
SURF1-201ENST00000371974 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.35■■■■■ 4.53
SURF1-201ENST00000371974 KIF27Q86VH2 1401 aa43.27■■■■■ 4.52
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SURF1-201ENST00000371974 IGF1RP08069 1367 aa43.09■■■■■ 4.49
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SURF1-201ENST00000371974 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.8■■■■■ 4.44
SURF1-201ENST00000371974 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.76■■■■■ 4.44
SURF1-201ENST00000371974 ARAP1Q96P48 1450 aa42.7■■■■■ 4.43
SURF1-201ENST00000371974 SHROOM2Q13796 1616 aa42.61■■■■■ 4.41
SURF1-201ENST00000371974 JPH4Q96JJ6 628 aa42.61■■■■■ 4.41
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