RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541648.5

GSR-205, Transcript of glutathione-disulfide reductase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GSR, Length 1,410 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSR-205ENST00000541648 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.67■■■■■ 7.14
GSR-205ENST00000541648 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53■■■■■ 6.07
GSR-205ENST00000541648 ABCC9O60706 1549 aa51.86■■■■■ 5.89
GSR-205ENST00000541648 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.86■■■■■ 5.57
GSR-205ENST00000541648 NACADO15069 1562 aa49.83■■■■■ 5.57
GSR-205ENST00000541648 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.78■■■■■ 5.56
GSR-205ENST00000541648 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.74■■■■■ 5.55
GSR-205ENST00000541648 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.58■■■■■ 5.53
GSR-205ENST00000541648 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.38■■■■■ 5.5
GSR-205ENST00000541648 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.73■■■■■ 5.39
GSR-205ENST00000541648 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.46■■■■■ 5.353e-7■■■■□ 26.7
GSR-205ENST00000541648 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.43■■■■■ 5.34
GSR-205ENST00000541648 SCRIBQ14160 1630 aa48.36■■■■■ 5.33
GSR-205ENST00000541648 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.89■■■■■ 5.26
GSR-205ENST00000541648 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.64■■■■■ 5.22
GSR-205ENST00000541648 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.12■■■■■ 5.13
GSR-205ENST00000541648 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.91■■■■■ 5.1
GSR-205ENST00000541648 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.59■■■■■ 5.05
GSR-205ENST00000541648 SMARCA4P51532 1647 aa46.28■■■■■ 5
GSR-205ENST00000541648 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.22■■■■■ 4.99
GSR-205ENST00000541648 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.05■■■■■ 4.96
GSR-205ENST00000541648 NCAPD3P42695 1498 aa46.03■■■■■ 4.96
GSR-205ENST00000541648 MROH2BQ7Z745 1585 aa46■■■■■ 4.95
GSR-205ENST00000541648 SMARCA2P51531 1590 aa45.94■■■■■ 4.95
GSR-205ENST00000541648 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.86■■■■■ 4.93
GSR-205ENST00000541648 HMGXB3Q12766 1538 aa45.77■■■■■ 4.92
GSR-205ENST00000541648 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.66■■■■■ 4.9
GSR-205ENST00000541648 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.62■■■■■ 4.89
GSR-205ENST00000541648 WIZO95785 1651 aa45.47■■■■■ 4.87
GSR-205ENST00000541648 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.1■■■■■ 4.81
GSR-205ENST00000541648 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.03■■■■■ 4.8
GSR-205ENST00000541648 NESP48681 1621 aa44.9■■■■■ 4.78
GSR-205ENST00000541648 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.76■■■■■ 4.76
GSR-205ENST00000541648 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.66■■■■■ 4.74
GSR-205ENST00000541648 ERCC6Q03468 1493 aa44.64■■■■■ 4.74
GSR-205ENST00000541648 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.49■■■■■ 4.71
GSR-205ENST00000541648 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.45■■■■■ 4.71
GSR-205ENST00000541648 CFTRP13569 1480 aa44.42■■■■■ 4.7
GSR-205ENST00000541648 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.32■■■■■ 4.69
GSR-205ENST00000541648 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.22■■■■■ 4.67
GSR-205ENST00000541648 CUX2O14529 1486 aa44.21■■■■■ 4.67
GSR-205ENST00000541648 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.14■■■■■ 4.66
GSR-205ENST00000541648 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.07■■■■■ 4.65
GSR-205ENST00000541648 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.02■■■■■ 4.64
GSR-205ENST00000541648 PRDM2Q13029 1718 aa43.98■■■■■ 4.63
GSR-205ENST00000541648 WDR62O43379 1518 aa43.89■■■■■ 4.62
GSR-205ENST00000541648 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.73■■■■■ 4.59
GSR-205ENST00000541648 TOPBP1Q92547 1522 aa43.45■■■■■ 4.55
GSR-205ENST00000541648 ABCC8Q09428 1581 aa43.4■■■■■ 4.54
GSR-205ENST00000541648 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.39■■■■■ 4.54
GSR-205ENST00000541648 IFT140Q96RY7 1462 aa43.16■■■■■ 4.5
GSR-205ENST00000541648 CUX1P39880 1505 aa43.15■■■■■ 4.5
GSR-205ENST00000541648 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.09■■■■■ 4.49
GSR-205ENST00000541648 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.05■■■■■ 4.48
GSR-205ENST00000541648 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.99■■■■■ 4.47
GSR-205ENST00000541648 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.98■■■■■ 4.47
GSR-205ENST00000541648 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.98■■■■■ 4.47
GSR-205ENST00000541648 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.9■■■■■ 4.46
GSR-205ENST00000541648 SYNJ1O43426 1573 aa42.89■■■■■ 4.46
GSR-205ENST00000541648 SOGA1O94964 1423 aa42.89■■■■■ 4.46
GSR-205ENST00000541648 TOP2BQ02880 1626 aa42.87■■■■■ 4.45
GSR-205ENST00000541648 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.87■■■■■ 4.45
GSR-205ENST00000541648 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.84■■■■■ 4.45
GSR-205ENST00000541648 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.79■■■■■ 4.44
GSR-205ENST00000541648 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.74■■■■■ 4.431e-6■■■■□ 24.5
GSR-205ENST00000541648 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.65■■■■■ 4.42
GSR-205ENST00000541648 WDR97A6NE52 1622 aa42.62■■■■■ 4.41
GSR-205ENST00000541648 TRIM41Q8WV44 630 aa42.58■■■■■ 4.41
GSR-205ENST00000541648 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.57■■■■■ 4.41
GSR-205ENST00000541648 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.55■■■■■ 4.4
GSR-205ENST00000541648 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.4■■■■■ 4.38
GSR-205ENST00000541648 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.39■■■■■ 4.38
GSR-205ENST00000541648 GRIN2BQ13224 1484 aa42.38■■■■■ 4.38
GSR-205ENST00000541648 OSCARQ8IYS5 282 aa42.36■■■■■ 4.37
GSR-205ENST00000541648 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.33■■■■■ 4.37
GSR-205ENST00000541648 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.28■■■■■ 4.36
GSR-205ENST00000541648 PBRM1Q86U86 1689 aa42.27■■■■■ 4.36
GSR-205ENST00000541648 CHD1O14646 1710 aa42.21■■■■■ 4.35
GSR-205ENST00000541648 FBLN2P98095 1184 aa42.14■■■■■ 4.34
GSR-205ENST00000541648 SYNJ2O15056 1496 aa42.11■■■■■ 4.33
GSR-205ENST00000541648 KIF27Q86VH2 1401 aa42.09■■■■■ 4.33
GSR-205ENST00000541648 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.05■■■■■ 4.32
GSR-205ENST00000541648 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.04■■■■■ 4.32
GSR-205ENST00000541648 ADAMTS12P58397 1594 aa41.99■■■■■ 4.31
GSR-205ENST00000541648 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.92■■■■■ 4.3
GSR-205ENST00000541648 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.91■■■■■ 4.3
GSR-205ENST00000541648 GRIN2AQ12879 1464 aa41.85■■■■■ 4.29
GSR-205ENST00000541648 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.83■■■■■ 4.29
GSR-205ENST00000541648 EEA1Q15075 1411 aa41.82■■■■■ 4.29
GSR-205ENST00000541648 IGF1RP08069 1367 aa41.82■■■■■ 4.28
GSR-205ENST00000541648 ARHGEF11O15085 1522 aa41.7■■■■■ 4.27
GSR-205ENST00000541648 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.69■■■■■ 4.26
GSR-205ENST00000541648 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.69■■■■■ 4.26
GSR-205ENST00000541648 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.69■■■■■ 4.26
GSR-205ENST00000541648 NUP160Q12769 1436 aa41.69■■■■■ 4.26
GSR-205ENST00000541648 CUL7Q14999 1698 aa41.69■■■■■ 4.26
GSR-205ENST00000541648 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.67■■■■■ 4.26
GSR-205ENST00000541648 CEP170Q5SW79 1584 aa41.66■■■■■ 4.26
GSR-205ENST00000541648 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.62■■■■■ 4.25
GSR-205ENST00000541648 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.58■■■■■ 4.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.2 ms