RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318978.5

CTXN1-201, Transcript of cortexin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN1, Length 1,274 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1-201ENST00000318978 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.07■■■■■ 7.53
CTXN1-201ENST00000318978 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa55.33■■■■■ 6.45
CTXN1-201ENST00000318978 ABCC9O60706 1549 aa54.42■■■■■ 6.3
CTXN1-201ENST00000318978 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.21■■■■■ 5.95
CTXN1-201ENST00000318978 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.16■■■■■ 5.94
CTXN1-201ENST00000318978 NACADO15069 1562 aa52.05■■■■■ 5.92
CTXN1-201ENST00000318978 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.63■■■■■ 5.86
CTXN1-201ENST00000318978 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.57■■■■■ 5.85
CTXN1-201ENST00000318978 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.28■■■■■ 5.8
CTXN1-201ENST00000318978 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.08■■■■■ 5.77
CTXN1-201ENST00000318978 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.82■■■■■ 5.73
CTXN1-201ENST00000318978 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.58■■■■■ 5.69
CTXN1-201ENST00000318978 SCRIBQ14160 1630 aa50.54■■■■■ 5.68
CTXN1-201ENST00000318978 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.09■■■■■ 5.61
CTXN1-201ENST00000318978 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.99■■■■■ 5.59
CTXN1-201ENST00000318978 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.31■■■■■ 5.48
CTXN1-201ENST00000318978 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.2■■■■■ 5.47
CTXN1-201ENST00000318978 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.89■■■■■ 5.42
CTXN1-201ENST00000318978 SMARCA4P51532 1647 aa48.25■■■■■ 5.32
CTXN1-201ENST00000318978 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.15■■■■■ 5.3
CTXN1-201ENST00000318978 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48■■■■■ 5.27
CTXN1-201ENST00000318978 NCAPD3P42695 1498 aa47.98■■■■■ 5.27
CTXN1-201ENST00000318978 SMARCA2P51531 1590 aa47.98■■■■■ 5.27
CTXN1-201ENST00000318978 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.85■■■■■ 5.25
CTXN1-201ENST00000318978 HMGXB3Q12766 1538 aa47.76■■■■■ 5.24
CTXN1-201ENST00000318978 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.7■■■■■ 5.23
CTXN1-201ENST00000318978 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.66■■■■■ 5.22
CTXN1-201ENST00000318978 WIZO95785 1651 aa47.39■■■■■ 5.18
CTXN1-201ENST00000318978 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.19■■■■■ 5.14
CTXN1-201ENST00000318978 NESP48681 1621 aa47■■■■■ 5.11
CTXN1-201ENST00000318978 ERCC6Q03468 1493 aa46.97■■■■■ 5.11
CTXN1-201ENST00000318978 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.83■■■■■ 5.09
CTXN1-201ENST00000318978 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.81■■■■■ 5.08
CTXN1-201ENST00000318978 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.61■■■■■ 5.05
CTXN1-201ENST00000318978 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.54■■■■■ 5.04
CTXN1-201ENST00000318978 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.49■■■■■ 5.03
CTXN1-201ENST00000318978 CUX2O14529 1486 aa46.46■■■■■ 5.03
CTXN1-201ENST00000318978 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.31■■■■■ 5
CTXN1-201ENST00000318978 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.26■■■■■ 5
CTXN1-201ENST00000318978 CFTRP13569 1480 aa46.26■■■■■ 5
CTXN1-201ENST00000318978 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.12■■■■■ 4.97
CTXN1-201ENST00000318978 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.11■■■■■ 4.97
CTXN1-201ENST00000318978 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.06■■■■■ 4.96
CTXN1-201ENST00000318978 PRDM2Q13029 1718 aa46.03■■■■■ 4.96
CTXN1-201ENST00000318978 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.97■■■■■ 4.95
CTXN1-201ENST00000318978 WDR62O43379 1518 aa45.89■■■■■ 4.94
CTXN1-201ENST00000318978 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.65■■■■■ 4.9
CTXN1-201ENST00000318978 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.35■■■■■ 4.85
CTXN1-201ENST00000318978 TOPBP1Q92547 1522 aa45.34■■■■■ 4.85
CTXN1-201ENST00000318978 ABCC8Q09428 1581 aa45.33■■■■■ 4.85
CTXN1-201ENST00000318978 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.28■■■■■ 4.84
CTXN1-201ENST00000318978 IFT140Q96RY7 1462 aa45.11■■■■■ 4.81
CTXN1-201ENST00000318978 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.94■■■■■ 4.78
CTXN1-201ENST00000318978 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.93■■■■■ 4.78
CTXN1-201ENST00000318978 CUX1P39880 1505 aa44.91■■■■■ 4.78
CTXN1-201ENST00000318978 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.86■■■■■ 4.77
CTXN1-201ENST00000318978 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.81■■■■■ 4.76
CTXN1-201ENST00000318978 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.78■■■■■ 4.76
CTXN1-201ENST00000318978 SOGA1O94964 1423 aa44.78■■■■■ 4.76
CTXN1-201ENST00000318978 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.77■■■■■ 4.76
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CTXN1-201ENST00000318978 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.56■■■■■ 4.72
CTXN1-201ENST00000318978 OSCARQ8IYS5 282 aa44.55■■■■■ 4.72
CTXN1-201ENST00000318978 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.55■■■■■ 4.72
CTXN1-201ENST00000318978 WDR97A6NE52 1622 aa44.48■■■■■ 4.71
CTXN1-201ENST00000318978 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.48■■■■■ 4.71
CTXN1-201ENST00000318978 TOP2BQ02880 1626 aa44.47■■■■■ 4.71
CTXN1-201ENST00000318978 SYNJ1O43426 1573 aa44.45■■■■■ 4.71
CTXN1-201ENST00000318978 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.33■■■■■ 4.69
CTXN1-201ENST00000318978 CHD1O14646 1710 aa44.33■■■■■ 4.69
CTXN1-201ENST00000318978 FBLN2P98095 1184 aa44.3■■■■■ 4.68
CTXN1-201ENST00000318978 GRIN2BQ13224 1484 aa44.27■■■■■ 4.68
CTXN1-201ENST00000318978 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.27■■■■■ 4.68
CTXN1-201ENST00000318978 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.26■■■■■ 4.68
CTXN1-201ENST00000318978 PBRM1Q86U86 1689 aa44.25■■■■■ 4.67
CTXN1-201ENST00000318978 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.2■■■■■ 4.67
CTXN1-201ENST00000318978 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.16■■■■■ 4.66
CTXN1-201ENST00000318978 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.08■■■■■ 4.65
CTXN1-201ENST00000318978 SYNJ2O15056 1496 aa44.01■■■■■ 4.64
CTXN1-201ENST00000318978 TRIM41Q8WV44 630 aa43.87■■■■■ 4.61
CTXN1-201ENST00000318978 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.87■■■■■ 4.61
CTXN1-201ENST00000318978 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.87■■■■■ 4.61
CTXN1-201ENST00000318978 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.87■■■■■ 4.61
CTXN1-201ENST00000318978 ADAMTS12P58397 1594 aa43.81■■■■■ 4.6
CTXN1-201ENST00000318978 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.81■■■■■ 4.6
CTXN1-201ENST00000318978 ARHGEF11O15085 1522 aa43.79■■■■■ 4.6
CTXN1-201ENST00000318978 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.73■■■■■ 4.59
CTXN1-201ENST00000318978 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.71■■■■■ 4.59
CTXN1-201ENST00000318978 GRIN2AQ12879 1464 aa43.69■■■■■ 4.58
CTXN1-201ENST00000318978 KIF27Q86VH2 1401 aa43.65■■■■■ 4.58
CTXN1-201ENST00000318978 CEP170Q5SW79 1584 aa43.5■■■■■ 4.55
CTXN1-201ENST00000318978 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.47■■■■■ 4.55
CTXN1-201ENST00000318978 NUP160Q12769 1436 aa43.46■■■■■ 4.55
CTXN1-201ENST00000318978 IGF1RP08069 1367 aa43.44■■■■■ 4.54
CTXN1-201ENST00000318978 CUL7Q14999 1698 aa43.42■■■■■ 4.54
CTXN1-201ENST00000318978 ARAP1Q96P48 1450 aa43.41■■■■■ 4.54
CTXN1-201ENST00000318978 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.23■■■■■ 4.51
CTXN1-201ENST00000318978 SHROOM2Q13796 1616 aa43.19■■■■■ 4.51
CTXN1-201ENST00000318978 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.17■■■■■ 4.5
CTXN1-201ENST00000318978 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.14■■■■■ 4.5
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