RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540756.5

TTC3-225, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TTC3, Length 2,025 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC3-225ENST00000540756 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.75■■■■■ 6.51
TTC3-225ENST00000540756 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.49■■■■■ 5.35
TTC3-225ENST00000540756 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.81■■■■■ 5.08
TTC3-225ENST00000540756 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.29■■■■■ 5
TTC3-225ENST00000540756 ABCC9O60706 1549 aa46.16■■■■■ 4.98
TTC3-225ENST00000540756 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.94■■■■■ 4.94
TTC3-225ENST00000540756 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.72■■■■■ 4.91
TTC3-225ENST00000540756 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.37■■■■■ 4.85
TTC3-225ENST00000540756 NACADO15069 1562 aa45.2■■■■■ 4.83
TTC3-225ENST00000540756 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.84■■■■■ 4.77
TTC3-225ENST00000540756 SCRIBQ14160 1630 aa44.83■■■■■ 4.77
TTC3-225ENST00000540756 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.12■■■■■ 4.65
TTC3-225ENST00000540756 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.94■■■■■ 4.62
TTC3-225ENST00000540756 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.63■■■■■ 4.58
TTC3-225ENST00000540756 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.61■■■■■ 4.57
TTC3-225ENST00000540756 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.47■■■■■ 4.55
TTC3-225ENST00000540756 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.29■■■■■ 4.52
TTC3-225ENST00000540756 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.17■■■■■ 4.5
TTC3-225ENST00000540756 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.99■■■■■ 4.47
TTC3-225ENST00000540756 SMARCA4P51532 1647 aa42.87■■■■■ 4.45
TTC3-225ENST00000540756 WIZO95785 1651 aa42.83■■■■■ 4.45
TTC3-225ENST00000540756 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.28■■■■■ 4.36
TTC3-225ENST00000540756 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.26■■■■■ 4.36
TTC3-225ENST00000540756 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.24■■■■■ 4.35
TTC3-225ENST00000540756 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.19■■■■■ 4.34
TTC3-225ENST00000540756 SMARCA2P51531 1590 aa42.06■■■■■ 4.32
TTC3-225ENST00000540756 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.96■■■■■ 4.31
TTC3-225ENST00000540756 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.93■■■■■ 4.3
TTC3-225ENST00000540756 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.91■■■■■ 4.3
TTC3-225ENST00000540756 NCAPD3P42695 1498 aa41.77■■■■■ 4.28
TTC3-225ENST00000540756 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.7■■■■■ 4.27
TTC3-225ENST00000540756 HMGXB3Q12766 1538 aa41.66■■■■■ 4.26
TTC3-225ENST00000540756 TRIM41Q8WV44 630 aa41.19■■■■■ 4.18
TTC3-225ENST00000540756 ABCC8Q09428 1581 aa41.1■■■■■ 4.17
TTC3-225ENST00000540756 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.95■■■■■ 4.15
TTC3-225ENST00000540756 CFTRP13569 1480 aa40.86■■■■■ 4.13
TTC3-225ENST00000540756 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.74■■■■■ 4.11
TTC3-225ENST00000540756 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.71■■■■■ 4.11
TTC3-225ENST00000540756 SYNJ1O43426 1573 aa40.62■■■■■ 4.09
TTC3-225ENST00000540756 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.6■■■■■ 4.09
TTC3-225ENST00000540756 PRDM2Q13029 1718 aa40.6■■■■■ 4.09
TTC3-225ENST00000540756 NESP48681 1621 aa40.56■■■■■ 4.08
TTC3-225ENST00000540756 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.5■■■■■ 4.07
TTC3-225ENST00000540756 TOP2BQ02880 1626 aa40.36■■■■■ 4.05
TTC3-225ENST00000540756 CUX1P39880 1505 aa40.34■■■■■ 4.05
TTC3-225ENST00000540756 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.32■■■■■ 4.05
TTC3-225ENST00000540756 SOGA1O94964 1423 aa40.32■■■■■ 4.04
TTC3-225ENST00000540756 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.31■■■■■ 4.04
TTC3-225ENST00000540756 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.3■■■■■ 4.04
TTC3-225ENST00000540756 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.22■■■■■ 4.03
TTC3-225ENST00000540756 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.16■■■■■ 4.02
TTC3-225ENST00000540756 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.03■■■■■ 4
TTC3-225ENST00000540756 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.02■■■■■ 4
TTC3-225ENST00000540756 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.99■■■■□ 3.99
TTC3-225ENST00000540756 EEA1Q15075 1411 aa39.95■■■■□ 3.99
TTC3-225ENST00000540756 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.92■■■■□ 3.98
TTC3-225ENST00000540756 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.89■■■■□ 3.98
TTC3-225ENST00000540756 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.88■■■■□ 3.98
TTC3-225ENST00000540756 TOPBP1Q92547 1522 aa39.88■■■■□ 3.97
TTC3-225ENST00000540756 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.86■■■■□ 3.97
TTC3-225ENST00000540756 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.7■■■■□ 3.95
TTC3-225ENST00000540756 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.66■■■■□ 3.94
TTC3-225ENST00000540756 KIF27Q86VH2 1401 aa39.64■■■■□ 3.94
TTC3-225ENST00000540756 CUX2O14529 1486 aa39.63■■■■□ 3.93
TTC3-225ENST00000540756 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.54■■■■□ 3.92
TTC3-225ENST00000540756 KIF21BO75037 1637 aa39.53■■■■□ 3.92
TTC3-225ENST00000540756 GOLGA3Q08378 1498 aa39.51■■■■□ 3.92
TTC3-225ENST00000540756 ERCC6Q03468 1493 aa39.49■■■■□ 3.91
TTC3-225ENST00000540756 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.47■■■■□ 3.91
TTC3-225ENST00000540756 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.47■■■■□ 3.91
TTC3-225ENST00000540756 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.46■■■■□ 3.91
TTC3-225ENST00000540756 PRXQ9BXM0 1461 aa39.4■■■■□ 3.9
TTC3-225ENST00000540756 TNIKQ9UKE5 1360 aa39.39■■■■□ 3.9
TTC3-225ENST00000540756 IGF1RP08069 1367 aa39.38■■■■□ 3.89
TTC3-225ENST00000540756 WDR97A6NE52 1622 aa39.36■■■■□ 3.89
TTC3-225ENST00000540756 WDR62O43379 1518 aa39.34■■■■□ 3.89
TTC3-225ENST00000540756 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.28■■■■□ 3.88
TTC3-225ENST00000540756 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.27■■■■□ 3.88
TTC3-225ENST00000540756 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.27■■■■□ 3.88
TTC3-225ENST00000540756 CEP162Q5TB80 1403 aa39.25■■■■□ 3.87
TTC3-225ENST00000540756 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.24■■■■□ 3.87
TTC3-225ENST00000540756 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.17■■■■□ 3.86
TTC3-225ENST00000540756 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.15■■■■□ 3.86
TTC3-225ENST00000540756 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.1■■■■□ 3.85
TTC3-225ENST00000540756 IFT140Q96RY7 1462 aa39.03■■■■□ 3.84
TTC3-225ENST00000540756 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.03■■■■□ 3.842e-7■■□□□ 13.9
TTC3-225ENST00000540756 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP39.02■■■■□ 3.84
TTC3-225ENST00000540756 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.01■■■■□ 3.83
TTC3-225ENST00000540756 CUL7Q14999 1698 aa38.95■■■■□ 3.83
TTC3-225ENST00000540756 CLIP1P30622 1438 aa38.93■■■■□ 3.82
TTC3-225ENST00000540756 PBRM1Q86U86 1689 aa38.89■■■■□ 3.82
TTC3-225ENST00000540756 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.78■■■■□ 3.8
TTC3-225ENST00000540756 GRIN2BQ13224 1484 aa38.76■■■■□ 3.8
TTC3-225ENST00000540756 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP38.68■■■■□ 3.78
TTC3-225ENST00000540756 ADAMTS12P58397 1594 aa38.66■■■■□ 3.78
TTC3-225ENST00000540756 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.63■■■■□ 3.78
TTC3-225ENST00000540756 ARAP1Q96P48 1450 aa38.6■■■■□ 3.77
TTC3-225ENST00000540756 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.59■■■■□ 3.77
TTC3-225ENST00000540756 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa38.59■■■■□ 3.77
TTC3-225ENST00000540756 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa38.58■■■■□ 3.77
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