RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295685.14

ARPC2-201, Transcript of actin related protein 2/3 complex subunit 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ARPC2, Length 1,605 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytosol, Lamellipodium, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC2-201ENST00000295685 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.77■■■■■ 7
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ARPC2-201ENST00000295685 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.86■■■■■ 5.41
ARPC2-201ENST00000295685 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.54■■■■■ 5.36
ARPC2-201ENST00000295685 NACADO15069 1562 aa48.38■■■■■ 5.34
ARPC2-201ENST00000295685 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.32■■■■■ 5.33
ARPC2-201ENST00000295685 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.23■■■■■ 5.31
ARPC2-201ENST00000295685 SCRIBQ14160 1630 aa47.49■■■■■ 5.19
ARPC2-201ENST00000295685 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.37■■■■■ 5.17
ARPC2-201ENST00000295685 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.28■■■■■ 5.16
ARPC2-201ENST00000295685 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.86■■■■■ 5.09
ARPC2-201ENST00000295685 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.79■■■■■ 5.081e-8■□□□□ 9.4
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ARPC2-201ENST00000295685 SMARCA4P51532 1647 aa45.43■■■■■ 4.86
ARPC2-201ENST00000295685 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.41■■■■■ 4.86
ARPC2-201ENST00000295685 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.19■■■■■ 4.82
ARPC2-201ENST00000295685 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.1■■■■■ 4.81
ARPC2-201ENST00000295685 WIZO95785 1651 aa45.02■■■■■ 4.8
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ARPC2-201ENST00000295685 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.89■■■■■ 4.78
ARPC2-201ENST00000295685 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.87■■■■■ 4.77
ARPC2-201ENST00000295685 SMARCA2P51531 1590 aa44.81■■■■■ 4.76
ARPC2-201ENST00000295685 NCAPD3P42695 1498 aa44.65■■■■■ 4.74
ARPC2-201ENST00000295685 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.58■■■■■ 4.73
ARPC2-201ENST00000295685 HMGXB3Q12766 1538 aa44.52■■■■■ 4.72
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ARPC2-201ENST00000295685 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.99■■■■■ 4.63
ARPC2-201ENST00000295685 NESP48681 1621 aa43.48■■■■■ 4.55
ARPC2-201ENST00000295685 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.43■■■■■ 4.54
ARPC2-201ENST00000295685 CFTRP13569 1480 aa43.39■■■■■ 4.54
ARPC2-201ENST00000295685 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.32■■■■■ 4.53
ARPC2-201ENST00000295685 PRDM2Q13029 1718 aa43.21■■■■■ 4.51
ARPC2-201ENST00000295685 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.98■■■■■ 4.47
ARPC2-201ENST00000295685 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.98■■■■■ 4.47
ARPC2-201ENST00000295685 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.96■■■■■ 4.47
ARPC2-201ENST00000295685 ABCC8Q09428 1581 aa42.8■■■■■ 4.44
ARPC2-201ENST00000295685 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.8■■■■■ 4.44
ARPC2-201ENST00000295685 ERCC6Q03468 1493 aa42.8■■■■■ 4.44
ARPC2-201ENST00000295685 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.56■■■■■ 4.4
ARPC2-201ENST00000295685 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.54■■■■■ 4.4
ARPC2-201ENST00000295685 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.52■■■■■ 4.4
ARPC2-201ENST00000295685 CUX1P39880 1505 aa42.51■■■■■ 4.4
ARPC2-201ENST00000295685 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.51■■■■■ 4.4
ARPC2-201ENST00000295685 SYNJ1O43426 1573 aa42.5■■■■■ 4.39
ARPC2-201ENST00000295685 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.47■■■■■ 4.39
ARPC2-201ENST00000295685 TOPBP1Q92547 1522 aa42.42■■■■■ 4.38
ARPC2-201ENST00000295685 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.42■■■■■ 4.38
ARPC2-201ENST00000295685 TOP2BQ02880 1626 aa42.36■■■■■ 4.37
ARPC2-201ENST00000295685 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.36■■■■■ 4.37
ARPC2-201ENST00000295685 WDR62O43379 1518 aa42.36■■■■■ 4.37
ARPC2-201ENST00000295685 TRIM41Q8WV44 630 aa42.28■■■■■ 4.36
ARPC2-201ENST00000295685 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.2■■■■■ 4.35
ARPC2-201ENST00000295685 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.14■■■■■ 4.34
ARPC2-201ENST00000295685 CUX2O14529 1486 aa42.02■■■■■ 4.32
ARPC2-201ENST00000295685 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.02■■■■■ 4.32
ARPC2-201ENST00000295685 SOGA1O94964 1423 aa41.95■■■■■ 4.31
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ARPC2-201ENST00000295685 IFT140Q96RY7 1462 aa41.82■■■■■ 4.29
ARPC2-201ENST00000295685 WDR97A6NE52 1622 aa41.81■■■■■ 4.28
ARPC2-201ENST00000295685 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.76■■■■■ 4.28
ARPC2-201ENST00000295685 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.71■■■■■ 4.27
ARPC2-201ENST00000295685 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.69■■■■■ 4.27
ARPC2-201ENST00000295685 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.67■■■■■ 4.26
ARPC2-201ENST00000295685 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.59■■■■■ 4.252e-9■■■□□ 18.6
ARPC2-201ENST00000295685 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.56■■■■■ 4.24
ARPC2-201ENST00000295685 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.55■■■■■ 4.24
ARPC2-201ENST00000295685 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.55■■■■■ 4.24
ARPC2-201ENST00000295685 KIF27Q86VH2 1401 aa41.54■■■■■ 4.24
ARPC2-201ENST00000295685 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.49■■■■■ 4.23
ARPC2-201ENST00000295685 PBRM1Q86U86 1689 aa41.41■■■■■ 4.22
ARPC2-201ENST00000295685 EEA1Q15075 1411 aa41.33■■■■■ 4.21
ARPC2-201ENST00000295685 IGF1RP08069 1367 aa41.3■■■■■ 4.2
ARPC2-201ENST00000295685 GRIN2BQ13224 1484 aa41.3■■■■■ 4.2
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ARPC2-201ENST00000295685 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.26■■■■■ 4.19
ARPC2-201ENST00000295685 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.2■■■■■ 4.19
ARPC2-201ENST00000295685 CUL7Q14999 1698 aa41.1■■■■■ 4.17
ARPC2-201ENST00000295685 ADAMTS12P58397 1594 aa41.1■■■■■ 4.17
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ARPC2-201ENST00000295685 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.05■■■■■ 4.16
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ARPC2-201ENST00000295685 PRXQ9BXM0 1461 aa41.03■■■■■ 4.16
ARPC2-201ENST00000295685 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.99■■■■■ 4.15
ARPC2-201ENST00000295685 KIF21BO75037 1637 aa40.95■■■■■ 4.15
ARPC2-201ENST00000295685 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.93■■■■■ 4.14
ARPC2-201ENST00000295685 SYNJ2O15056 1496 aa40.92■■■■■ 4.14
ARPC2-201ENST00000295685 FBLN2P98095 1184 aa40.9■■■■■ 4.14
ARPC2-201ENST00000295685 CHD1O14646 1710 aa40.9■■■■■ 4.14
ARPC2-201ENST00000295685 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.85■■■■■ 4.13
ARPC2-201ENST00000295685 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.85■■■■■ 4.13
ARPC2-201ENST00000295685 GRIN2AQ12879 1464 aa40.82■■■■■ 4.12
ARPC2-201ENST00000295685 GOLGA3Q08378 1498 aa40.78■■■■■ 4.12
ARPC2-201ENST00000295685 CEP170Q5SW79 1584 aa40.64■■■■■ 4.1
ARPC2-201ENST00000295685 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.64■■■■■ 4.1
ARPC2-201ENST00000295685 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.56■■■■■ 4.08
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