RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253099.10

MRPL4-201, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MRPL4, Length 1,455 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL4-201ENST00000253099 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.43■■■■■ 7.1
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MRPL4-201ENST00000253099 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.64■■■■■ 5.54
MRPL4-201ENST00000253099 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.48■■■■■ 5.51
MRPL4-201ENST00000253099 NACADO15069 1562 aa49.19■■■■■ 5.47
MRPL4-201ENST00000253099 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.16■■■■■ 5.46
MRPL4-201ENST00000253099 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.09■■■■■ 5.45
MRPL4-201ENST00000253099 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.07■■■■■ 5.45
MRPL4-201ENST00000253099 SCRIBQ14160 1630 aa48.01■■■■■ 5.28
MRPL4-201ENST00000253099 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.01■■■■■ 5.28
MRPL4-201ENST00000253099 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.62■■■■■ 5.21
MRPL4-201ENST00000253099 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.62■■■■■ 5.21
MRPL4-201ENST00000253099 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.46■■■■■ 5.19
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MRPL4-201ENST00000253099 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.27■■■■■ 5
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MRPL4-201ENST00000253099 SMARCA4P51532 1647 aa45.96■■■■■ 4.95
MRPL4-201ENST00000253099 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.94■■■■■ 4.94
MRPL4-201ENST00000253099 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.84■■■■■ 4.93
MRPL4-201ENST00000253099 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.57■■■■■ 4.89
MRPL4-201ENST00000253099 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.55■■■■■ 4.88
MRPL4-201ENST00000253099 SMARCA2P51531 1590 aa45.5■■■■■ 4.87
MRPL4-201ENST00000253099 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.48■■■■■ 4.87
MRPL4-201ENST00000253099 NCAPD3P42695 1498 aa45.41■■■■■ 4.86
MRPL4-201ENST00000253099 WIZO95785 1651 aa45.38■■■■■ 4.86
MRPL4-201ENST00000253099 HMGXB3Q12766 1538 aa45.22■■■■■ 4.83
MRPL4-201ENST00000253099 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.21■■■■■ 4.83
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MRPL4-201ENST00000253099 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.42■■■■■ 4.7
MRPL4-201ENST00000253099 NESP48681 1621 aa44.17■■■■■ 4.66
MRPL4-201ENST00000253099 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.14■■■■■ 4.66
MRPL4-201ENST00000253099 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.07■■■■■ 4.65
MRPL4-201ENST00000253099 CFTRP13569 1480 aa44.02■■■■■ 4.64
MRPL4-201ENST00000253099 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.78■■■■■ 4.6
MRPL4-201ENST00000253099 ERCC6Q03468 1493 aa43.69■■■■■ 4.58
MRPL4-201ENST00000253099 PRDM2Q13029 1718 aa43.68■■■■■ 4.58
MRPL4-201ENST00000253099 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.64■■■■■ 4.58
MRPL4-201ENST00000253099 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.62■■■■■ 4.57
MRPL4-201ENST00000253099 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.49■■■■■ 4.55
MRPL4-201ENST00000253099 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.29■■■■■ 4.52
MRPL4-201ENST00000253099 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.28■■■■■ 4.52
MRPL4-201ENST00000253099 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.17■■■■■ 4.5
MRPL4-201ENST00000253099 WDR62O43379 1518 aa43.11■■■■■ 4.49
MRPL4-201ENST00000253099 ABCC8Q09428 1581 aa43.02■■■■■ 4.48
MRPL4-201ENST00000253099 TOPBP1Q92547 1522 aa43.01■■■■■ 4.48
MRPL4-201ENST00000253099 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.99■■■■■ 4.47
MRPL4-201ENST00000253099 CUX1P39880 1505 aa42.96■■■■■ 4.47
MRPL4-201ENST00000253099 CUX2O14529 1486 aa42.93■■■■■ 4.46
MRPL4-201ENST00000253099 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.93■■■■■ 4.46
MRPL4-201ENST00000253099 SYNJ1O43426 1573 aa42.8■■■■■ 4.44
MRPL4-201ENST00000253099 TOP2BQ02880 1626 aa42.74■■■■■ 4.43
MRPL4-201ENST00000253099 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.71■■■■■ 4.43
MRPL4-201ENST00000253099 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.7■■■■■ 4.43
MRPL4-201ENST00000253099 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.7■■■■■ 4.43
MRPL4-201ENST00000253099 SOGA1O94964 1423 aa42.55■■■■■ 4.4
MRPL4-201ENST00000253099 IFT140Q96RY7 1462 aa42.55■■■■■ 4.4
MRPL4-201ENST00000253099 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.54■■■■■ 4.4
MRPL4-201ENST00000253099 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.48■■■■■ 4.39
MRPL4-201ENST00000253099 TRIM41Q8WV44 630 aa42.43■■■■■ 4.38
MRPL4-201ENST00000253099 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.39■■■■■ 4.38
MRPL4-201ENST00000253099 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.35■■■■■ 4.37
MRPL4-201ENST00000253099 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.3■■■■■ 4.36
MRPL4-201ENST00000253099 WDR97A6NE52 1622 aa42.27■■■■■ 4.36
MRPL4-201ENST00000253099 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.25■■■■■ 4.35
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MRPL4-201ENST00000253099 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.06■■■■■ 4.32
MRPL4-201ENST00000253099 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.06■■■■■ 4.32
MRPL4-201ENST00000253099 KIF27Q86VH2 1401 aa41.97■■■■■ 4.31
MRPL4-201ENST00000253099 GRIN2BQ13224 1484 aa41.94■■■■■ 4.3
MRPL4-201ENST00000253099 PBRM1Q86U86 1689 aa41.89■■■■■ 4.3
MRPL4-201ENST00000253099 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.87■■■■■ 4.29
MRPL4-201ENST00000253099 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.81■■■■■ 4.28
MRPL4-201ENST00000253099 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.79■■■■■ 4.28
MRPL4-201ENST00000253099 IGF1RP08069 1367 aa41.76■■■■■ 4.28
MRPL4-201ENST00000253099 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.74■■■■■ 4.27
MRPL4-201ENST00000253099 ADAMTS12P58397 1594 aa41.61■■■■■ 4.25
MRPL4-201ENST00000253099 FBLN2P98095 1184 aa41.6■■■■■ 4.25
MRPL4-201ENST00000253099 EEA1Q15075 1411 aa41.59■■■■■ 4.25
MRPL4-201ENST00000253099 SYNJ2O15056 1496 aa41.59■■■■■ 4.25
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MRPL4-201ENST00000253099 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.56■■■■■ 4.24
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MRPL4-201ENST00000253099 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.51■■■■■ 4.24
MRPL4-201ENST00000253099 CHD1O14646 1710 aa41.51■■■■■ 4.24
MRPL4-201ENST00000253099 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.51■■■■■ 4.24
MRPL4-201ENST00000253099 GRIN2AQ12879 1464 aa41.41■■■■■ 4.22
MRPL4-201ENST00000253099 OSCARQ8IYS5 282 aa41.35■■■■■ 4.21
MRPL4-201ENST00000253099 PRXQ9BXM0 1461 aa41.35■■■■■ 4.21
MRPL4-201ENST00000253099 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.31■■■■■ 4.2
MRPL4-201ENST00000253099 NUP160Q12769 1436 aa41.19■■■■■ 4.18
MRPL4-201ENST00000253099 CEP170Q5SW79 1584 aa41.18■■■■■ 4.18
MRPL4-201ENST00000253099 KIF21BO75037 1637 aa41.12■■■■■ 4.17
MRPL4-201ENST00000253099 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.06■■■■■ 4.16
MRPL4-201ENST00000253099 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.03■■■■■ 4.16
MRPL4-201ENST00000253099 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa40.97■■■■■ 4.15
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