RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530225.5

RPS2-210, Transcript of ribosomal protein S2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RPS2, Length 765 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS2-210ENST00000530225 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.68■■■■■ 7.3
RPS2-210ENST00000530225 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.78■■■■■ 6.2
RPS2-210ENST00000530225 ABCC9O60706 1549 aa52.01■■■■■ 5.92
RPS2-210ENST00000530225 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.66■■■■■ 5.7
RPS2-210ENST00000530225 NACADO15069 1562 aa50.43■■■■■ 5.66
RPS2-210ENST00000530225 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.36■■■■■ 5.65
RPS2-210ENST00000530225 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.34■■■■■ 5.65
RPS2-210ENST00000530225 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.34■■■■■ 5.65
RPS2-210ENST00000530225 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.31■■■■■ 5.64
RPS2-210ENST00000530225 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.2■■■■■ 5.47
RPS2-210ENST00000530225 SCRIBQ14160 1630 aa49.01■■■■■ 5.44
RPS2-210ENST00000530225 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.79■■■■■ 5.4
RPS2-210ENST00000530225 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.66■■■■■ 5.38
RPS2-210ENST00000530225 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.42■■■■■ 5.34
RPS2-210ENST00000530225 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.03■■■■■ 5.28
RPS2-210ENST00000530225 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.46■■■■■ 5.19
RPS2-210ENST00000530225 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.16■■■■■ 5.14
RPS2-210ENST00000530225 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.12■■■■■ 5.13
RPS2-210ENST00000530225 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.01■■■■■ 5.12
RPS2-210ENST00000530225 SMARCA4P51532 1647 aa46.97■■■■■ 5.11
RPS2-210ENST00000530225 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.74■■■■■ 5.07
RPS2-210ENST00000530225 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.59■■■■■ 5.05
RPS2-210ENST00000530225 SMARCA2P51531 1590 aa46.59■■■■■ 5.05
RPS2-210ENST00000530225 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.57■■■■■ 5.05
RPS2-210ENST00000530225 NCAPD3P42695 1498 aa46.52■■■■■ 5.04
RPS2-210ENST00000530225 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.4■■■■■ 5.02
RPS2-210ENST00000530225 HMGXB3Q12766 1538 aa46.35■■■■■ 5.01
RPS2-210ENST00000530225 WIZO95785 1651 aa46.25■■■■■ 4.99
RPS2-210ENST00000530225 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.23■■■■■ 4.99
RPS2-210ENST00000530225 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.83■■■■■ 4.93
RPS2-210ENST00000530225 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.48■■■■■ 4.87
RPS2-210ENST00000530225 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.27■■■■■ 4.84
RPS2-210ENST00000530225 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.21■■■■■ 4.83
RPS2-210ENST00000530225 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.17■■■■■ 4.82
RPS2-210ENST00000530225 NESP48681 1621 aa45.16■■■■■ 4.82
RPS2-210ENST00000530225 CFTRP13569 1480 aa45.03■■■■■ 4.8
RPS2-210ENST00000530225 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.88■■■■■ 4.78
RPS2-210ENST00000530225 ERCC6Q03468 1493 aa44.81■■■■■ 4.76
RPS2-210ENST00000530225 PRDM2Q13029 1718 aa44.75■■■■■ 4.75
RPS2-210ENST00000530225 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.68■■■■■ 4.74
RPS2-210ENST00000530225 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.63■■■■■ 4.73
RPS2-210ENST00000530225 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.53■■■■■ 4.72
RPS2-210ENST00000530225 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.43■■■■■ 4.7
RPS2-210ENST00000530225 CUX2O14529 1486 aa44.39■■■■■ 4.7
RPS2-210ENST00000530225 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.38■■■■■ 4.69
RPS2-210ENST00000530225 WDR62O43379 1518 aa44.24■■■■■ 4.67
RPS2-210ENST00000530225 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.15■■■■■ 4.66
RPS2-210ENST00000530225 ABCC8Q09428 1581 aa44.06■■■■■ 4.64
RPS2-210ENST00000530225 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44■■■■■ 4.63
RPS2-210ENST00000530225 TOPBP1Q92547 1522 aa43.99■■■■■ 4.63
RPS2-210ENST00000530225 CUX1P39880 1505 aa43.83■■■■■ 4.61
RPS2-210ENST00000530225 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.73■■■■■ 4.59not detected■■■■□ 25.1
RPS2-210ENST00000530225 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.72■■■■■ 4.59
RPS2-210ENST00000530225 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.64■■■■■ 4.58
RPS2-210ENST00000530225 TOP2BQ02880 1626 aa43.61■■■■■ 4.57
RPS2-210ENST00000530225 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.61■■■■■ 4.57
RPS2-210ENST00000530225 IFT140Q96RY7 1462 aa43.6■■■■■ 4.57
RPS2-210ENST00000530225 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.59■■■■■ 4.57
RPS2-210ENST00000530225 SYNJ1O43426 1573 aa43.58■■■■■ 4.57
RPS2-210ENST00000530225 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.48■■■■■ 4.55
RPS2-210ENST00000530225 SOGA1O94964 1423 aa43.46■■■■■ 4.55
RPS2-210ENST00000530225 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.4■■■■■ 4.54
RPS2-210ENST00000530225 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.31■■■■■ 4.52
RPS2-210ENST00000530225 WDR97A6NE52 1622 aa43.26■■■■■ 4.52
RPS2-210ENST00000530225 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.24■■■■■ 4.51
RPS2-210ENST00000530225 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.19■■■■■ 4.5
RPS2-210ENST00000530225 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.13■■■■■ 4.49not detected■■■■■ 31.4
RPS2-210ENST00000530225 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.12■■■■■ 4.49
RPS2-210ENST00000530225 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.02■■■■■ 4.48
RPS2-210ENST00000530225 TRIM41Q8WV44 630 aa43■■■■■ 4.47
RPS2-210ENST00000530225 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.98■■■■■ 4.47
RPS2-210ENST00000530225 GRIN2BQ13224 1484 aa42.92■■■■■ 4.46
RPS2-210ENST00000530225 PBRM1Q86U86 1689 aa42.86■■■■■ 4.45
RPS2-210ENST00000530225 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.8■■■■■ 4.44
RPS2-210ENST00000530225 KIF27Q86VH2 1401 aa42.8■■■■■ 4.44
RPS2-210ENST00000530225 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.77■■■■■ 4.44
RPS2-210ENST00000530225 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.75■■■■■ 4.43
RPS2-210ENST00000530225 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.74■■■■■ 4.43
RPS2-210ENST00000530225 SYNJ2O15056 1496 aa42.58■■■■■ 4.41
RPS2-210ENST00000530225 ADAMTS12P58397 1594 aa42.56■■■■■ 4.4
RPS2-210ENST00000530225 IGF1RP08069 1367 aa42.55■■■■■ 4.4
RPS2-210ENST00000530225 CHD1O14646 1710 aa42.54■■■■■ 4.4
RPS2-210ENST00000530225 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.52■■■■■ 4.4
RPS2-210ENST00000530225 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.49■■■■■ 4.39
RPS2-210ENST00000530225 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.47■■■■■ 4.39
RPS2-210ENST00000530225 OSCARQ8IYS5 282 aa42.46■■■■■ 4.39
RPS2-210ENST00000530225 FBLN2P98095 1184 aa42.45■■■■■ 4.39
RPS2-210ENST00000530225 CUL7Q14999 1698 aa42.44■■■■■ 4.39
RPS2-210ENST00000530225 GRIN2AQ12879 1464 aa42.36■■■■■ 4.37
RPS2-210ENST00000530225 EEA1Q15075 1411 aa42.35■■■■■ 4.37
RPS2-210ENST00000530225 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.3■■■■■ 4.36
RPS2-210ENST00000530225 NUP160Q12769 1436 aa42.18■■■■■ 4.34
RPS2-210ENST00000530225 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.15■■■■■ 4.34
RPS2-210ENST00000530225 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.13■■■■■ 4.33
RPS2-210ENST00000530225 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.12■■■■■ 4.33
RPS2-210ENST00000530225 PRXQ9BXM0 1461 aa42.11■■■■■ 4.33
RPS2-210ENST00000530225 CEP170Q5SW79 1584 aa42.11■■■■■ 4.33
RPS2-210ENST00000530225 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42■■■■■ 4.31
RPS2-210ENST00000530225 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.89■■■■■ 4.3
RPS2-210ENST00000530225 KIF21BO75037 1637 aa41.85■■■■■ 4.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms