RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000315717.9

ARPC2-202, Transcript of actin related protein 2/3 complex subunit 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ARPC2, Length 1,505 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytosol, Lamellipodium, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC2-202ENST00000315717 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.23■■■■■ 7.07
ARPC2-202ENST00000315717 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.34■■■■■ 5.97
ARPC2-202ENST00000315717 ABCC9O60706 1549 aa50.55■■■■■ 5.68
ARPC2-202ENST00000315717 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.48■■■■■ 5.51
ARPC2-202ENST00000315717 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.3■■■■■ 5.48
ARPC2-202ENST00000315717 NACADO15069 1562 aa48.99■■■■■ 5.43
ARPC2-202ENST00000315717 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.97■■■■■ 5.43
ARPC2-202ENST00000315717 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.91■■■■■ 5.42
ARPC2-202ENST00000315717 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.87■■■■■ 5.41
ARPC2-202ENST00000315717 SCRIBQ14160 1630 aa47.91■■■■■ 5.26
ARPC2-202ENST00000315717 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.9■■■■■ 5.26
ARPC2-202ENST00000315717 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.39■■■■■ 5.18
ARPC2-202ENST00000315717 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.37■■■■■ 5.17
ARPC2-202ENST00000315717 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.35■■■■■ 5.171e-8■□□□□ 9.4
ARPC2-202ENST00000315717 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.1■■■■■ 4.97
ARPC2-202ENST00000315717 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.08■■■■■ 4.97
ARPC2-202ENST00000315717 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.87■■■■■ 4.93
ARPC2-202ENST00000315717 SMARCA4P51532 1647 aa45.83■■■■■ 4.93
ARPC2-202ENST00000315717 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.74■■■■■ 4.91
ARPC2-202ENST00000315717 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.69■■■■■ 4.91
ARPC2-202ENST00000315717 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.64■■■■■ 4.9
ARPC2-202ENST00000315717 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.41■■■■■ 4.86
ARPC2-202ENST00000315717 SMARCA2P51531 1590 aa45.35■■■■■ 4.85
ARPC2-202ENST00000315717 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.34■■■■■ 4.85
ARPC2-202ENST00000315717 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.31■■■■■ 4.84
ARPC2-202ENST00000315717 WIZO95785 1651 aa45.29■■■■■ 4.84
ARPC2-202ENST00000315717 NCAPD3P42695 1498 aa45.17■■■■■ 4.82
ARPC2-202ENST00000315717 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.06■■■■■ 4.8
ARPC2-202ENST00000315717 HMGXB3Q12766 1538 aa45.05■■■■■ 4.8
ARPC2-202ENST00000315717 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.94■■■■■ 4.78
ARPC2-202ENST00000315717 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.79■■■■■ 4.76
ARPC2-202ENST00000315717 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.26■■■■■ 4.68
ARPC2-202ENST00000315717 NESP48681 1621 aa43.96■■■■■ 4.63
ARPC2-202ENST00000315717 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.92■■■■■ 4.62
ARPC2-202ENST00000315717 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.92■■■■■ 4.62
ARPC2-202ENST00000315717 CFTRP13569 1480 aa43.82■■■■■ 4.6
ARPC2-202ENST00000315717 PRDM2Q13029 1718 aa43.67■■■■■ 4.58
ARPC2-202ENST00000315717 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.58■■■■■ 4.57
ARPC2-202ENST00000315717 ERCC6Q03468 1493 aa43.51■■■■■ 4.56
ARPC2-202ENST00000315717 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.51■■■■■ 4.56
ARPC2-202ENST00000315717 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.46■■■■■ 4.55
ARPC2-202ENST00000315717 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.35■■■■■ 4.53
ARPC2-202ENST00000315717 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.11■■■■■ 4.49
ARPC2-202ENST00000315717 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.1■■■■■ 4.49
ARPC2-202ENST00000315717 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.97■■■■■ 4.47
ARPC2-202ENST00000315717 ABCC8Q09428 1581 aa42.95■■■■■ 4.47
ARPC2-202ENST00000315717 WDR62O43379 1518 aa42.93■■■■■ 4.46
ARPC2-202ENST00000315717 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.87■■■■■ 4.45
ARPC2-202ENST00000315717 TOPBP1Q92547 1522 aa42.85■■■■■ 4.45
ARPC2-202ENST00000315717 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.82■■■■■ 4.45
ARPC2-202ENST00000315717 CUX1P39880 1505 aa42.81■■■■■ 4.44
ARPC2-202ENST00000315717 SYNJ1O43426 1573 aa42.71■■■■■ 4.43
ARPC2-202ENST00000315717 CUX2O14529 1486 aa42.69■■■■■ 4.42
ARPC2-202ENST00000315717 TOP2BQ02880 1626 aa42.65■■■■■ 4.42
ARPC2-202ENST00000315717 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.65■■■■■ 4.42
ARPC2-202ENST00000315717 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.56■■■■■ 4.4
ARPC2-202ENST00000315717 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.53■■■■■ 4.4
ARPC2-202ENST00000315717 IFT140Q96RY7 1462 aa42.37■■■■■ 4.37
ARPC2-202ENST00000315717 TRIM41Q8WV44 630 aa42.37■■■■■ 4.37
ARPC2-202ENST00000315717 SOGA1O94964 1423 aa42.37■■■■■ 4.37
ARPC2-202ENST00000315717 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.36■■■■■ 4.37
ARPC2-202ENST00000315717 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.33■■■■■ 4.37
ARPC2-202ENST00000315717 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.3■■■■■ 4.36
ARPC2-202ENST00000315717 WDR97A6NE52 1622 aa42.19■■■■■ 4.34
ARPC2-202ENST00000315717 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.15■■■■■ 4.34
ARPC2-202ENST00000315717 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.14■■■■■ 4.34
ARPC2-202ENST00000315717 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.07■■■■■ 4.32
ARPC2-202ENST00000315717 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.05■■■■■ 4.32
ARPC2-202ENST00000315717 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.01■■■■■ 4.322e-9■■■□□ 18.6
ARPC2-202ENST00000315717 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.95■■■■■ 4.31
ARPC2-202ENST00000315717 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.91■■■■■ 4.3
ARPC2-202ENST00000315717 KIF27Q86VH2 1401 aa41.85■■■■■ 4.29
ARPC2-202ENST00000315717 PBRM1Q86U86 1689 aa41.84■■■■■ 4.29
ARPC2-202ENST00000315717 GRIN2BQ13224 1484 aa41.78■■■■■ 4.28
ARPC2-202ENST00000315717 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.75■■■■■ 4.27
ARPC2-202ENST00000315717 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.66■■■■■ 4.26
ARPC2-202ENST00000315717 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.65■■■■■ 4.26
ARPC2-202ENST00000315717 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.58■■■■■ 4.25
ARPC2-202ENST00000315717 IGF1RP08069 1367 aa41.56■■■■■ 4.24
ARPC2-202ENST00000315717 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.54■■■■■ 4.24
ARPC2-202ENST00000315717 EEA1Q15075 1411 aa41.52■■■■■ 4.24
ARPC2-202ENST00000315717 ADAMTS12P58397 1594 aa41.5■■■■■ 4.23
ARPC2-202ENST00000315717 CUL7Q14999 1698 aa41.48■■■■■ 4.23
ARPC2-202ENST00000315717 FBLN2P98095 1184 aa41.43■■■■■ 4.22
ARPC2-202ENST00000315717 CHD1O14646 1710 aa41.42■■■■■ 4.22
ARPC2-202ENST00000315717 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.42■■■■■ 4.22
ARPC2-202ENST00000315717 SYNJ2O15056 1496 aa41.42■■■■■ 4.22
ARPC2-202ENST00000315717 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.39■■■■■ 4.22
ARPC2-202ENST00000315717 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.38■■■■■ 4.21
ARPC2-202ENST00000315717 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.35■■■■■ 4.21
ARPC2-202ENST00000315717 GRIN2AQ12879 1464 aa41.25■■■■■ 4.19
ARPC2-202ENST00000315717 PRXQ9BXM0 1461 aa41.21■■■■■ 4.19
ARPC2-202ENST00000315717 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.2■■■■■ 4.19
ARPC2-202ENST00000315717 KIF21BO75037 1637 aa41.09■■■■■ 4.17
ARPC2-202ENST00000315717 OSCARQ8IYS5 282 aa41.08■■■■■ 4.17
ARPC2-202ENST00000315717 CEP170Q5SW79 1584 aa41.04■■■■■ 4.16
ARPC2-202ENST00000315717 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.01■■■■■ 4.16
ARPC2-202ENST00000315717 NUP160Q12769 1436 aa40.99■■■■■ 4.15
ARPC2-202ENST00000315717 GOLGA3Q08378 1498 aa40.91■■■■■ 4.14
ARPC2-202ENST00000315717 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.88■■■■■ 4.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.2 ms