RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615505.4

SURF1-205, Transcript of SURF1, cytochrome c oxidase assembly factor, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SURF1, Length 991 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1-205ENST00000615505 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.46■■■■■ 7.43
SURF1-205ENST00000615505 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.62■■■■■ 6.34
SURF1-205ENST00000615505 ABCC9O60706 1549 aa53.55■■■■■ 6.16
SURF1-205ENST00000615505 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.5■■■■■ 5.83
SURF1-205ENST00000615505 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.49■■■■■ 5.83
SURF1-205ENST00000615505 NACADO15069 1562 aa51.42■■■■■ 5.82
SURF1-205ENST00000615505 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.16■■■■■ 5.78
SURF1-205ENST00000615505 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.09■■■■■ 5.77
SURF1-205ENST00000615505 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.84■■■■■ 5.73
SURF1-205ENST00000615505 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.21■■■■■ 5.63
SURF1-205ENST00000615505 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.07■■■■■ 5.61
SURF1-205ENST00000615505 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.87■■■■■ 5.57
SURF1-205ENST00000615505 SCRIBQ14160 1630 aa49.85■■■■■ 5.57
SURF1-205ENST00000615505 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.4■■■■■ 5.5
SURF1-205ENST00000615505 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.19■■■■■ 5.47
SURF1-205ENST00000615505 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.59■■■■■ 5.37
SURF1-205ENST00000615505 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.41■■■■■ 5.34
SURF1-205ENST00000615505 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.13■■■■■ 5.3
SURF1-205ENST00000615505 SMARCA4P51532 1647 aa47.67■■■■■ 5.22
SURF1-205ENST00000615505 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.65■■■■■ 5.22
SURF1-205ENST00000615505 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.46■■■■■ 5.19
SURF1-205ENST00000615505 NCAPD3P42695 1498 aa47.46■■■■■ 5.19
SURF1-205ENST00000615505 SMARCA2P51531 1590 aa47.41■■■■■ 5.18
SURF1-205ENST00000615505 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.35■■■■■ 5.17
SURF1-205ENST00000615505 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.21■■■■■ 5.15
SURF1-205ENST00000615505 HMGXB3Q12766 1538 aa47.19■■■■■ 5.14
SURF1-205ENST00000615505 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.08■■■■■ 5.13
SURF1-205ENST00000615505 WIZO95785 1651 aa46.82■■■■■ 5.09
SURF1-205ENST00000615505 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.81■■■■■ 5.08
SURF1-205ENST00000615505 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.34■■■■■ 5.01
SURF1-205ENST00000615505 NESP48681 1621 aa46.29■■■■■ 5
SURF1-205ENST00000615505 ERCC6Q03468 1493 aa46.19■■■■■ 4.99
SURF1-205ENST00000615505 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.19■■■■■ 4.99
SURF1-205ENST00000615505 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.09■■■■■ 4.97
SURF1-205ENST00000615505 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.94■■■■■ 4.95
SURF1-205ENST00000615505 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.82■■■■■ 4.93
SURF1-205ENST00000615505 CFTRP13569 1480 aa45.78■■■■■ 4.92
SURF1-205ENST00000615505 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.71■■■■■ 4.91
SURF1-205ENST00000615505 CUX2O14529 1486 aa45.7■■■■■ 4.91
SURF1-205ENST00000615505 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.68■■■■■ 4.9
SURF1-205ENST00000615505 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.57■■■■■ 4.89
SURF1-205ENST00000615505 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.55■■■■■ 4.88
SURF1-205ENST00000615505 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.49■■■■■ 4.87
SURF1-205ENST00000615505 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.43■■■■■ 4.86
SURF1-205ENST00000615505 PRDM2Q13029 1718 aa45.35■■■■■ 4.85
SURF1-205ENST00000615505 WDR62O43379 1518 aa45.25■■■■■ 4.83
SURF1-205ENST00000615505 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.06■■■■■ 4.8
SURF1-205ENST00000615505 ABCC8Q09428 1581 aa44.84■■■■■ 4.77
SURF1-205ENST00000615505 TOPBP1Q92547 1522 aa44.8■■■■■ 4.76
SURF1-205ENST00000615505 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.73■■■■■ 4.75
SURF1-205ENST00000615505 IFT140Q96RY7 1462 aa44.55■■■■■ 4.72
SURF1-205ENST00000615505 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.41■■■■■ 4.7
SURF1-205ENST00000615505 CUX1P39880 1505 aa44.41■■■■■ 4.7
SURF1-205ENST00000615505 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.4■■■■■ 4.7
SURF1-205ENST00000615505 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.31■■■■■ 4.68
SURF1-205ENST00000615505 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.3■■■■■ 4.68
SURF1-205ENST00000615505 SOGA1O94964 1423 aa44.28■■■■■ 4.68
SURF1-205ENST00000615505 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.28■■■■■ 4.68
SURF1-205ENST00000615505 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.22■■■■■ 4.67
SURF1-205ENST00000615505 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.16■■■■■ 4.66
SURF1-205ENST00000615505 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.11■■■■■ 4.65
SURF1-205ENST00000615505 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.09■■■■■ 4.65
SURF1-205ENST00000615505 TOP2BQ02880 1626 aa44.03■■■■■ 4.64
SURF1-205ENST00000615505 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.03■■■■■ 4.64
SURF1-205ENST00000615505 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44■■■■■ 4.63
SURF1-205ENST00000615505 SYNJ1O43426 1573 aa43.99■■■■■ 4.63
SURF1-205ENST00000615505 WDR97A6NE52 1622 aa43.95■■■■■ 4.63
SURF1-205ENST00000615505 OSCARQ8IYS5 282 aa43.88■■■■■ 4.62
SURF1-205ENST00000615505 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.88■■■■■ 4.61
SURF1-205ENST00000615505 GRIN2BQ13224 1484 aa43.75■■■■■ 4.59
SURF1-205ENST00000615505 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.75■■■■■ 4.59
SURF1-205ENST00000615505 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.67■■■■■ 4.58
SURF1-205ENST00000615505 FBLN2P98095 1184 aa43.66■■■■■ 4.58
SURF1-205ENST00000615505 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.66■■■■■ 4.58
SURF1-205ENST00000615505 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.63■■■■■ 4.57
SURF1-205ENST00000615505 PBRM1Q86U86 1689 aa43.58■■■■■ 4.57
SURF1-205ENST00000615505 CHD1O14646 1710 aa43.55■■■■■ 4.56
SURF1-205ENST00000615505 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.53■■■■■ 4.56
SURF1-205ENST00000615505 SYNJ2O15056 1496 aa43.46■■■■■ 4.55
SURF1-205ENST00000615505 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.35■■■■■ 4.53
SURF1-205ENST00000615505 KIF27Q86VH2 1401 aa43.27■■■■■ 4.52
SURF1-205ENST00000615505 ADAMTS12P58397 1594 aa43.24■■■■■ 4.51
SURF1-205ENST00000615505 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.24■■■■■ 4.51
SURF1-205ENST00000615505 TRIM41Q8WV44 630 aa43.17■■■■■ 4.5
SURF1-205ENST00000615505 GRIN2AQ12879 1464 aa43.17■■■■■ 4.5
SURF1-205ENST00000615505 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.1■■■■■ 4.49
SURF1-205ENST00000615505 IGF1RP08069 1367 aa43.09■■■■■ 4.49
SURF1-205ENST00000615505 ARHGEF11O15085 1522 aa43.07■■■■■ 4.49
SURF1-205ENST00000615505 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.06■■■■■ 4.48
SURF1-205ENST00000615505 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.06■■■■■ 4.48
SURF1-205ENST00000615505 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.06■■■■■ 4.48
SURF1-205ENST00000615505 NUP160Q12769 1436 aa42.97■■■■■ 4.47
SURF1-205ENST00000615505 CUL7Q14999 1698 aa42.93■■■■■ 4.46
SURF1-205ENST00000615505 CEP170Q5SW79 1584 aa42.91■■■■■ 4.46
SURF1-205ENST00000615505 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.85■■■■■ 4.45
SURF1-205ENST00000615505 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.8■■■■■ 4.44
SURF1-205ENST00000615505 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.76■■■■■ 4.44
SURF1-205ENST00000615505 ARAP1Q96P48 1450 aa42.7■■■■■ 4.43
SURF1-205ENST00000615505 SHROOM2Q13796 1616 aa42.61■■■■■ 4.41
SURF1-205ENST00000615505 JPH4Q96JJ6 628 aa42.61■■■■■ 4.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 979 ms