RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357360.4

LAGE3-201, Transcript of L antigen family member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LAGE3, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAGE3-201ENST00000357360 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.76■■■■■ 7.32
LAGE3-201ENST00000357360 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.92■■■■■ 6.22
LAGE3-201ENST00000357360 ABCC9O60706 1549 aa52.76■■■■■ 6.04
LAGE3-201ENST00000357360 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.97■■■■■ 5.75
LAGE3-201ENST00000357360 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.76■■■■■ 5.72
LAGE3-201ENST00000357360 NACADO15069 1562 aa50.68■■■■■ 5.7
LAGE3-201ENST00000357360 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.65■■■■■ 5.7
LAGE3-201ENST00000357360 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.32■■■■■ 5.65
LAGE3-201ENST00000357360 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.2■■■■■ 5.63
LAGE3-201ENST00000357360 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.48■■■■■ 5.51
LAGE3-201ENST00000357360 SCRIBQ14160 1630 aa49.37■■■■■ 5.49
LAGE3-201ENST00000357360 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.36■■■■■ 5.49
LAGE3-201ENST00000357360 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.11■■■■■ 5.45
LAGE3-201ENST00000357360 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.86■■■■■ 5.41
LAGE3-201ENST00000357360 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.62■■■■■ 5.37
LAGE3-201ENST00000357360 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.88■■■■■ 5.25
LAGE3-201ENST00000357360 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.65■■■■■ 5.22
LAGE3-201ENST00000357360 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.4■■■■■ 5.18
LAGE3-201ENST00000357360 SMARCA4P51532 1647 aa47.13■■■■■ 5.14
LAGE3-201ENST00000357360 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.12■■■■■ 5.13
LAGE3-201ENST00000357360 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.86■■■■■ 5.09
LAGE3-201ENST00000357360 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.83■■■■■ 5.09
LAGE3-201ENST00000357360 SMARCA2P51531 1590 aa46.81■■■■■ 5.08
LAGE3-201ENST00000357360 NCAPD3P42695 1498 aa46.73■■■■■ 5.07
LAGE3-201ENST00000357360 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.57■■■■■ 5.05
LAGE3-201ENST00000357360 HMGXB3Q12766 1538 aa46.55■■■■■ 5.04
LAGE3-201ENST00000357360 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.54■■■■■ 5.04
LAGE3-201ENST00000357360 WIZO95785 1651 aa46.37■■■■■ 5.01
LAGE3-201ENST00000357360 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.37■■■■■ 5.01
LAGE3-201ENST00000357360 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.9■■■■■ 4.94
LAGE3-201ENST00000357360 NESP48681 1621 aa45.66■■■■■ 4.9
LAGE3-201ENST00000357360 ERCC6Q03468 1493 aa45.55■■■■■ 4.88
LAGE3-201ENST00000357360 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.53■■■■■ 4.88
LAGE3-201ENST00000357360 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.52■■■■■ 4.88
LAGE3-201ENST00000357360 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.45■■■■■ 4.87
LAGE3-201ENST00000357360 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.35■■■■■ 4.85
LAGE3-201ENST00000357360 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.27■■■■■ 4.84
LAGE3-201ENST00000357360 CUX2O14529 1486 aa45.2■■■■■ 4.83
LAGE3-201ENST00000357360 CFTRP13569 1480 aa45.17■■■■■ 4.82
LAGE3-201ENST00000357360 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.09■■■■■ 4.81
LAGE3-201ENST00000357360 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.97■■■■■ 4.79
LAGE3-201ENST00000357360 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.92■■■■■ 4.78
LAGE3-201ENST00000357360 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.88■■■■■ 4.78
LAGE3-201ENST00000357360 PRDM2Q13029 1718 aa44.81■■■■■ 4.76
LAGE3-201ENST00000357360 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.8■■■■■ 4.76
LAGE3-201ENST00000357360 WDR62O43379 1518 aa44.59■■■■■ 4.73
LAGE3-201ENST00000357360 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.46■■■■■ 4.71
LAGE3-201ENST00000357360 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.45■■■■■ 4.71
LAGE3-201ENST00000357360 TOPBP1Q92547 1522 aa44.24■■■■■ 4.67
LAGE3-201ENST00000357360 ABCC8Q09428 1581 aa44.22■■■■■ 4.67
LAGE3-201ENST00000357360 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.21■■■■■ 4.67
LAGE3-201ENST00000357360 CUX1P39880 1505 aa43.95■■■■■ 4.63
LAGE3-201ENST00000357360 IFT140Q96RY7 1462 aa43.94■■■■■ 4.62
LAGE3-201ENST00000357360 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.88■■■■■ 4.61
LAGE3-201ENST00000357360 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.83■■■■■ 4.61
LAGE3-201ENST00000357360 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.79■■■■■ 4.6
LAGE3-201ENST00000357360 SOGA1O94964 1423 aa43.73■■■■■ 4.59
LAGE3-201ENST00000357360 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.72■■■■■ 4.59
LAGE3-201ENST00000357360 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.72■■■■■ 4.59
LAGE3-201ENST00000357360 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.67■■■■■ 4.58
LAGE3-201ENST00000357360 SYNJ1O43426 1573 aa43.63■■■■■ 4.58
LAGE3-201ENST00000357360 TOP2BQ02880 1626 aa43.6■■■■■ 4.57
LAGE3-201ENST00000357360 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.58■■■■■ 4.57
LAGE3-201ENST00000357360 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.57■■■■■ 4.57
LAGE3-201ENST00000357360 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.52■■■■■ 4.562e-6■■■■■ 26.9
LAGE3-201ENST00000357360 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.49■■■■■ 4.55
LAGE3-201ENST00000357360 WDR97A6NE52 1622 aa43.36■■■■■ 4.53
LAGE3-201ENST00000357360 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.35■■■■■ 4.53
LAGE3-201ENST00000357360 OSCARQ8IYS5 282 aa43.26■■■■■ 4.52
LAGE3-201ENST00000357360 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.22■■■■■ 4.51
LAGE3-201ENST00000357360 GRIN2BQ13224 1484 aa43.19■■■■■ 4.51
LAGE3-201ENST00000357360 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.15■■■■■ 4.5
LAGE3-201ENST00000357360 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.15■■■■■ 4.5
LAGE3-201ENST00000357360 FBLN2P98095 1184 aa43.13■■■■■ 4.49
LAGE3-201ENST00000357360 PBRM1Q86U86 1689 aa43.1■■■■■ 4.49
LAGE3-201ENST00000357360 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.04■■■■■ 4.48
LAGE3-201ENST00000357360 CHD1O14646 1710 aa42.97■■■■■ 4.47
LAGE3-201ENST00000357360 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.95■■■■■ 4.47
LAGE3-201ENST00000357360 TRIM41Q8WV44 630 aa42.95■■■■■ 4.47
LAGE3-201ENST00000357360 SYNJ2O15056 1496 aa42.88■■■■■ 4.46
LAGE3-201ENST00000357360 KIF27Q86VH2 1401 aa42.88■■■■■ 4.45
LAGE3-201ENST00000357360 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.84■■■■■ 4.45
LAGE3-201ENST00000357360 ADAMTS12P58397 1594 aa42.78■■■■■ 4.44
LAGE3-201ENST00000357360 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.72■■■■■ 4.43
LAGE3-201ENST00000357360 GRIN2AQ12879 1464 aa42.63■■■■■ 4.42
LAGE3-201ENST00000357360 IGF1RP08069 1367 aa42.59■■■■■ 4.41
LAGE3-201ENST00000357360 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.55■■■■■ 4.4
LAGE3-201ENST00000357360 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.55■■■■■ 4.4
LAGE3-201ENST00000357360 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.55■■■■■ 4.4
LAGE3-201ENST00000357360 CUL7Q14999 1698 aa42.51■■■■■ 4.4
LAGE3-201ENST00000357360 ARHGEF11O15085 1522 aa42.49■■■■■ 4.39
LAGE3-201ENST00000357360 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.48■■■■■ 4.39
LAGE3-201ENST00000357360 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.46■■■■■ 4.39
LAGE3-201ENST00000357360 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.44■■■■■ 4.38
LAGE3-201ENST00000357360 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.41■■■■■ 4.38
LAGE3-201ENST00000357360 CEP170Q5SW79 1584 aa42.39■■■■■ 4.38
LAGE3-201ENST00000357360 NUP160Q12769 1436 aa42.37■■■■■ 4.37
LAGE3-201ENST00000357360 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.18■■■■■ 4.34
LAGE3-201ENST00000357360 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.15■■■■■ 4.34
LAGE3-201ENST00000357360 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.14■■■■■ 4.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 6.5 ms