RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411545.2

ABHD17AP4-201, Transcript of abhydrolase domain containing 17A pseudogene P4, humanhuman

BASIC

Gene ABHD17AP4, Length 909 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABHD17AP4-201ENST00000411545 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.66■■■■■ 8.1
ABHD17AP4-201ENST00000411545 ABCC9O60706 1549 aa59.15■■■■■ 7.06
ABHD17AP4-201ENST00000411545 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa58.81■■■■■ 7
ABHD17AP4-201ENST00000411545 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa56.16■■■■■ 6.58
ABHD17AP4-201ENST00000411545 NACADO15069 1562 aa55.76■■■■■ 6.52
ABHD17AP4-201ENST00000411545 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.75■■■■■ 6.52
ABHD17AP4-201ENST00000411545 DNAJC5BQ9UF47 199 aa55.75■■■■■ 6.52
ABHD17AP4-201ENST00000411545 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP55.19■■■■■ 6.43
ABHD17AP4-201ENST00000411545 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.95■■■■■ 6.39
ABHD17AP4-201ENST00000411545 UNC13AQ9UPW8 1703 aa54.74■■■■■ 6.35
ABHD17AP4-201ENST00000411545 BICRAQ9NZM4 1560 aa54.51■■■■■ 6.32
ABHD17AP4-201ENST00000411545 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.32■■■■■ 6.29
ABHD17AP4-201ENST00000411545 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.19■■■■■ 6.26
ABHD17AP4-201ENST00000411545 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.74■■■■■ 6.19
ABHD17AP4-201ENST00000411545 SCRIBQ14160 1630 aa53.65■■■■■ 6.18
ABHD17AP4-201ENST00000411545 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa53.35■■■■■ 6.13
ABHD17AP4-201ENST00000411545 CECR2Q9BXF3 1484 aa53.3■■■■■ 6.12
ABHD17AP4-201ENST00000411545 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP53.2■■■■■ 6.11
ABHD17AP4-201ENST00000411545 NCAPD3P42695 1498 aa51.56■■■■■ 5.84
ABHD17AP4-201ENST00000411545 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.36■■■■■ 5.81
ABHD17AP4-201ENST00000411545 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa51.31■■■■■ 5.8
ABHD17AP4-201ENST00000411545 SMARCA4P51532 1647 aa51.16■■■■■ 5.78
ABHD17AP4-201ENST00000411545 SMARCA2P51531 1590 aa51.15■■■■■ 5.78
ABHD17AP4-201ENST00000411545 ERCC6Q03468 1493 aa51.08■■■■■ 5.77
ABHD17AP4-201ENST00000411545 HMGXB3Q12766 1538 aa51.03■■■■■ 5.76
ABHD17AP4-201ENST00000411545 CUX2O14529 1486 aa50.99■■■■■ 5.75
ABHD17AP4-201ENST00000411545 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.94■■■■■ 5.74
ABHD17AP4-201ENST00000411545 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.83■■■■■ 5.73
ABHD17AP4-201ENST00000411545 NESP48681 1621 aa50.76■■■■■ 5.72
ABHD17AP4-201ENST00000411545 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.68■■■■■ 5.7
ABHD17AP4-201ENST00000411545 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.59■■■■■ 5.69
ABHD17AP4-201ENST00000411545 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa50.31■■■■■ 5.64
ABHD17AP4-201ENST00000411545 PDS5BQ9NTI5 1447 aa50.15■■■■■ 5.62
ABHD17AP4-201ENST00000411545 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP50.13■■■■■ 5.61
ABHD17AP4-201ENST00000411545 CADPSQ9ULU8 1353 aa50.03■■■■■ 5.6
ABHD17AP4-201ENST00000411545 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.96■■■■■ 5.59
ABHD17AP4-201ENST00000411545 WIZO95785 1651 aa49.92■■■■■ 5.58
ABHD17AP4-201ENST00000411545 MRC2Q9UBG0 1479 aa49.65■■■■■ 5.54
ABHD17AP4-201ENST00000411545 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.55■■■■■ 5.52
ABHD17AP4-201ENST00000411545 WDR62O43379 1518 aa49.48■■■■■ 5.51
ABHD17AP4-201ENST00000411545 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.42■■■■■ 5.5
ABHD17AP4-201ENST00000411545 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.39■■■■■ 5.5
ABHD17AP4-201ENST00000411545 CFTRP13569 1480 aa49.37■■■■■ 5.49
ABHD17AP4-201ENST00000411545 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.28■■■■■ 5.48
ABHD17AP4-201ENST00000411545 TRIM41Q8WV44 630 aa49■■■■■ 5.43
ABHD17AP4-201ENST00000411545 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.96■■■■■ 5.43
ABHD17AP4-201ENST00000411545 OSCARQ8IYS5 282 aa48.85■■■■■ 5.41
ABHD17AP4-201ENST00000411545 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.83■■■■■ 5.41
ABHD17AP4-201ENST00000411545 PRDM2Q13029 1718 aa48.61■■■■■ 5.37
ABHD17AP4-201ENST00000411545 IFT140Q96RY7 1462 aa48.48■■■■■ 5.35
ABHD17AP4-201ENST00000411545 TOPBP1Q92547 1522 aa48.42■■■■■ 5.34
ABHD17AP4-201ENST00000411545 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP48.42■■■■■ 5.34
ABHD17AP4-201ENST00000411545 ABCC8Q09428 1581 aa48.34■■■■■ 5.33
ABHD17AP4-201ENST00000411545 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.17■■■■■ 5.3
ABHD17AP4-201ENST00000411545 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP48.02■■■■■ 5.28
ABHD17AP4-201ENST00000411545 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP48■■■■■ 5.28
ABHD17AP4-201ENST00000411545 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa47.97■■■■■ 5.27
ABHD17AP4-201ENST00000411545 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa47.97■■■■■ 5.27
ABHD17AP4-201ENST00000411545 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa47.97■■■■■ 5.27
ABHD17AP4-201ENST00000411545 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.93■■■■■ 5.26
ABHD17AP4-201ENST00000411545 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.91■■■■■ 5.26
ABHD17AP4-201ENST00000411545 ARHGEF11O15085 1522 aa47.86■■■■■ 5.25
ABHD17AP4-201ENST00000411545 FBLN2P98095 1184 aa47.84■■■■■ 5.25
ABHD17AP4-201ENST00000411545 SOGA1O94964 1423 aa47.8■■■■■ 5.24
ABHD17AP4-201ENST00000411545 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.79■■■■■ 5.24
ABHD17AP4-201ENST00000411545 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.74■■■■■ 5.23
ABHD17AP4-201ENST00000411545 CYB5RLQ6IPT4 315 aa47.72■■■■■ 5.23
ABHD17AP4-201ENST00000411545 CHD1O14646 1710 aa47.65■■■■■ 5.22
ABHD17AP4-201ENST00000411545 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.59■■■■■ 5.21
ABHD17AP4-201ENST00000411545 CUX1P39880 1505 aa47.51■■■■■ 5.2
ABHD17AP4-201ENST00000411545 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP47.46■■■■■ 5.19
ABHD17AP4-201ENST00000411545 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.44■■■■■ 5.18
ABHD17AP4-201ENST00000411545 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.41■■■■■ 5.18
ABHD17AP4-201ENST00000411545 WDR97A6NE52 1622 aa47.4■■■■■ 5.18
ABHD17AP4-201ENST00000411545 ARAP1Q96P48 1450 aa47.38■■■■■ 5.17
ABHD17AP4-201ENST00000411545 GRIN2BQ13224 1484 aa47.33■■■■■ 5.17
ABHD17AP4-201ENST00000411545 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.3■■■■■ 5.16
ABHD17AP4-201ENST00000411545 TRHP20396 242 aaPredicted RBP47.23■■■■■ 5.15
ABHD17AP4-201ENST00000411545 SYNJ2O15056 1496 aa47.17■■■■■ 5.14
ABHD17AP4-201ENST00000411545 CLASP1Q7Z460 1538 aa47.16■■■■■ 5.14
ABHD17AP4-201ENST00000411545 SYNJ1O43426 1573 aa47.15■■■■■ 5.14
ABHD17AP4-201ENST00000411545 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.15■■■■■ 5.14
ABHD17AP4-201ENST00000411545 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.05■■■■■ 5.12
ABHD17AP4-201ENST00000411545 PBRM1Q86U86 1689 aa46.95■■■■■ 5.11
ABHD17AP4-201ENST00000411545 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.9■■■■■ 5.1
ABHD17AP4-201ENST00000411545 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.89■■■■■ 5.1
ABHD17AP4-201ENST00000411545 GRIN2AQ12879 1464 aa46.69■■■■■ 5.06
ABHD17AP4-201ENST00000411545 TOP2BQ02880 1626 aa46.68■■■■■ 5.06
ABHD17AP4-201ENST00000411545 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.63■■■■■ 5.06
ABHD17AP4-201ENST00000411545 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.56■■■■■ 5.04
ABHD17AP4-201ENST00000411545 NUP160Q12769 1436 aa46.55■■■■■ 5.04
ABHD17AP4-201ENST00000411545 ADAMTS12P58397 1594 aa46.55■■■■■ 5.04
ABHD17AP4-201ENST00000411545 CEP170Q5SW79 1584 aa46.47■■■■■ 5.03
ABHD17AP4-201ENST00000411545 ERCC6L2Q5T890 1561 aa46.46■■■■■ 5.03
ABHD17AP4-201ENST00000411545 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.44■■■■■ 5.02
ABHD17AP4-201ENST00000411545 SHROOM2Q13796 1616 aa46.25■■■■■ 4.99
ABHD17AP4-201ENST00000411545 JPH4Q96JJ6 628 aa46.25■■■■■ 4.99
ABHD17AP4-201ENST00000411545 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP46.18■■■■■ 4.98
ABHD17AP4-201ENST00000411545 IGF1RP08069 1367 aa45.96■■■■■ 4.95
ABHD17AP4-201ENST00000411545 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP45.96■■■■■ 4.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12 ms