RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542156.5

MTMR1-214, Transcript of myotubularin related protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MTMR1, Length 1,227 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR1-214ENST00000542156 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.85■■■■■ 7.97
MTMR1-214ENST00000542156 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa58.15■■■■■ 6.9
MTMR1-214ENST00000542156 ABCC9O60706 1549 aa58.04■■■■■ 6.88
MTMR1-214ENST00000542156 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.26■■■■■ 6.44
MTMR1-214ENST00000542156 NACADO15069 1562 aa54.89■■■■■ 6.38
MTMR1-214ENST00000542156 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.65■■■■■ 6.34
MTMR1-214ENST00000542156 DNAJC5BQ9UF47 199 aa54.31■■■■■ 6.28
MTMR1-214ENST00000542156 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.15■■■■■ 6.26
MTMR1-214ENST00000542156 UNC13AQ9UPW8 1703 aa54.11■■■■■ 6.25
MTMR1-214ENST00000542156 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP54.04■■■■■ 6.24
MTMR1-214ENST00000542156 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.8■■■■■ 6.2
MTMR1-214ENST00000542156 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.71■■■■■ 6.19
MTMR1-214ENST00000542156 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.53■■■■■ 6.16
MTMR1-214ENST00000542156 SCRIBQ14160 1630 aa53.06■■■■■ 6.08
MTMR1-214ENST00000542156 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.88■■■■■ 6.06
MTMR1-214ENST00000542156 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa52.44■■■■■ 5.98
MTMR1-214ENST00000542156 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP52.35■■■■■ 5.97
MTMR1-214ENST00000542156 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.24■■■■■ 5.95
MTMR1-214ENST00000542156 NCAPD3P42695 1498 aa50.67■■■■■ 5.7
MTMR1-214ENST00000542156 SMARCA4P51532 1647 aa50.59■■■■■ 5.69
MTMR1-214ENST00000542156 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.57■■■■■ 5.69
MTMR1-214ENST00000542156 SMARCA2P51531 1590 aa50.41■■■■■ 5.66
MTMR1-214ENST00000542156 HMGXB3Q12766 1538 aa50.34■■■■■ 5.65
MTMR1-214ENST00000542156 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.32■■■■■ 5.65
MTMR1-214ENST00000542156 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.09■■■■■ 5.61
MTMR1-214ENST00000542156 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.06■■■■■ 5.6
MTMR1-214ENST00000542156 ERCC6Q03468 1493 aa50.06■■■■■ 5.6
MTMR1-214ENST00000542156 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.01■■■■■ 5.6
MTMR1-214ENST00000542156 NESP48681 1621 aa49.93■■■■■ 5.58
MTMR1-214ENST00000542156 CUX2O14529 1486 aa49.89■■■■■ 5.58
MTMR1-214ENST00000542156 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa49.68■■■■■ 5.54
MTMR1-214ENST00000542156 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.53■■■■■ 5.52
MTMR1-214ENST00000542156 WIZO95785 1651 aa49.45■■■■■ 5.51
MTMR1-214ENST00000542156 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP49.39■■■■■ 5.5
MTMR1-214ENST00000542156 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.31■■■■■ 5.48
MTMR1-214ENST00000542156 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.19■■■■■ 5.47
MTMR1-214ENST00000542156 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.13■■■■■ 5.45
MTMR1-214ENST00000542156 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49■■■■■ 5.43
MTMR1-214ENST00000542156 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.82■■■■■ 5.41
MTMR1-214ENST00000542156 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.79■■■■■ 5.4
MTMR1-214ENST00000542156 WDR62O43379 1518 aa48.71■■■■■ 5.39
MTMR1-214ENST00000542156 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.65■■■■■ 5.38
MTMR1-214ENST00000542156 CFTRP13569 1480 aa48.62■■■■■ 5.37
MTMR1-214ENST00000542156 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.61■■■■■ 5.37
MTMR1-214ENST00000542156 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.24■■■■■ 5.31
MTMR1-214ENST00000542156 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.23■■■■■ 5.31
MTMR1-214ENST00000542156 PRDM2Q13029 1718 aa48.21■■■■■ 5.31
MTMR1-214ENST00000542156 TOPBP1Q92547 1522 aa47.72■■■■■ 5.23
MTMR1-214ENST00000542156 IFT140Q96RY7 1462 aa47.65■■■■■ 5.22
MTMR1-214ENST00000542156 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.63■■■■■ 5.22
MTMR1-214ENST00000542156 TRIM41Q8WV44 630 aa47.63■■■■■ 5.22
MTMR1-214ENST00000542156 OSCARQ8IYS5 282 aa47.6■■■■■ 5.21
MTMR1-214ENST00000542156 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.56■■■■■ 5.2
MTMR1-214ENST00000542156 ABCC8Q09428 1581 aa47.54■■■■■ 5.2
MTMR1-214ENST00000542156 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.4■■■■■ 5.18
MTMR1-214ENST00000542156 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.31■■■■■ 5.16
MTMR1-214ENST00000542156 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.26■■■■■ 5.16
MTMR1-214ENST00000542156 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.2■■■■■ 5.153e-7■■■■■ 30.5
MTMR1-214ENST00000542156 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.1■■■■■ 5.13
MTMR1-214ENST00000542156 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa47.08■■■■■ 5.13
MTMR1-214ENST00000542156 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa47.08■■■■■ 5.13
MTMR1-214ENST00000542156 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa47.08■■■■■ 5.13
MTMR1-214ENST00000542156 CHD1O14646 1710 aa47.03■■■■■ 5.12
MTMR1-214ENST00000542156 SOGA1O94964 1423 aa46.99■■■■■ 5.11
MTMR1-214ENST00000542156 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.99■■■■■ 5.11
MTMR1-214ENST00000542156 CUX1P39880 1505 aa46.98■■■■■ 5.11
MTMR1-214ENST00000542156 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.94■■■■■ 5.1
MTMR1-214ENST00000542156 ARHGEF11O15085 1522 aa46.93■■■■■ 5.1
MTMR1-214ENST00000542156 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.91■■■■■ 5.1
MTMR1-214ENST00000542156 FBLN2P98095 1184 aa46.82■■■■■ 5.09
MTMR1-214ENST00000542156 WDR97A6NE52 1622 aa46.77■■■■■ 5.08
MTMR1-214ENST00000542156 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.73■■■■■ 5.07
MTMR1-214ENST00000542156 GRIN2BQ13224 1484 aa46.57■■■■■ 5.05
MTMR1-214ENST00000542156 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.56■■■■■ 5.04
MTMR1-214ENST00000542156 CYB5RLQ6IPT4 315 aa46.52■■■■■ 5.04
MTMR1-214ENST00000542156 PBRM1Q86U86 1689 aa46.49■■■■■ 5.03
MTMR1-214ENST00000542156 ARAP1Q96P48 1450 aa46.49■■■■■ 5.03
MTMR1-214ENST00000542156 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.47■■■■■ 5.03
MTMR1-214ENST00000542156 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.45■■■■■ 5.03
MTMR1-214ENST00000542156 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.44■■■■■ 5.02
MTMR1-214ENST00000542156 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.43■■■■■ 5.02
MTMR1-214ENST00000542156 SYNJ2O15056 1496 aa46.42■■■■■ 5.02
MTMR1-214ENST00000542156 SYNJ1O43426 1573 aa46.4■■■■■ 5.02
MTMR1-214ENST00000542156 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.39■■■■■ 5.02
MTMR1-214ENST00000542156 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.27■■■■■ 5
MTMR1-214ENST00000542156 TOP2BQ02880 1626 aa46.25■■■■■ 4.99
MTMR1-214ENST00000542156 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.24■■■■■ 4.99
MTMR1-214ENST00000542156 ADAMTS12P58397 1594 aa46.04■■■■■ 4.96
MTMR1-214ENST00000542156 GRIN2AQ12879 1464 aa46■■■■■ 4.95
MTMR1-214ENST00000542156 TRHP20396 242 aaPredicted RBP45.96■■■■■ 4.95
MTMR1-214ENST00000542156 CEP170Q5SW79 1584 aa45.88■■■■■ 4.94
MTMR1-214ENST00000542156 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.84■■■■■ 4.93
MTMR1-214ENST00000542156 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.84■■■■■ 4.93
MTMR1-214ENST00000542156 NUP160Q12769 1436 aa45.83■■■■■ 4.93
MTMR1-214ENST00000542156 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.79■■■■■ 4.92
MTMR1-214ENST00000542156 SHROOM2Q13796 1616 aa45.65■■■■■ 4.9
MTMR1-214ENST00000542156 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.4■■■■■ 4.86
MTMR1-214ENST00000542156 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP45.39■■■■■ 4.86
MTMR1-214ENST00000542156 JPH4Q96JJ6 628 aa45.31■■■■■ 4.84
MTMR1-214ENST00000542156 KIF27Q86VH2 1401 aa45.29■■■■■ 4.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms