Protein–RNA interactions for Protein: A4D1B5

GSAP, Gamma-secretase-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSAPA4D1B5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GSAPA4D1B5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GSAPA4D1B5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GSAPA4D1B5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSAPA4D1B5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GSAPA4D1B5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSAPA4D1B5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSAPA4D1B5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSAPA4D1B5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GSAPA4D1B5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSAPA4D1B5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSAPA4D1B5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSAPA4D1B5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSAPA4D1B5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSAPA4D1B5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSAPA4D1B5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSAPA4D1B5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSAPA4D1B5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSAPA4D1B5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSAPA4D1B5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSAPA4D1B5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSAPA4D1B5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSAPA4D1B5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSAPA4D1B5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSAPA4D1B5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSAPA4D1B5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSAPA4D1B5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSAPA4D1B5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSAPA4D1B5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GSAPA4D1B5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSAPA4D1B5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSAPA4D1B5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSAPA4D1B5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSAPA4D1B5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSAPA4D1B5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSAPA4D1B5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSAPA4D1B5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSAPA4D1B5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GSAPA4D1B5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSAPA4D1B5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSAPA4D1B5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSAPA4D1B5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSAPA4D1B5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GSAPA4D1B5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSAPA4D1B5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSAPA4D1B5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSAPA4D1B5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSAPA4D1B5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSAPA4D1B5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSAPA4D1B5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSAPA4D1B5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSAPA4D1B5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSAPA4D1B5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GSAPA4D1B5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GSAPA4D1B5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GSAPA4D1B5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GSAPA4D1B5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GSAPA4D1B5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GSAPA4D1B5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GSAPA4D1B5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GSAPA4D1B5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GSAPA4D1B5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GSAPA4D1B5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GSAPA4D1B5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GSAPA4D1B5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GSAPA4D1B5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GSAPA4D1B5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GSAPA4D1B5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GSAPA4D1B5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GSAPA4D1B5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GSAPA4D1B5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GSAPA4D1B5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GSAPA4D1B5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GSAPA4D1B5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GSAPA4D1B5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GSAPA4D1B5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GSAPA4D1B5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GSAPA4D1B5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GSAPA4D1B5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GSAPA4D1B5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GSAPA4D1B5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GSAPA4D1B5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GSAPA4D1B5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GSAPA4D1B5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GSAPA4D1B5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GSAPA4D1B5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GSAPA4D1B5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GSAPA4D1B5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GSAPA4D1B5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GSAPA4D1B5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GSAPA4D1B5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GSAPA4D1B5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GSAPA4D1B5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GSAPA4D1B5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GSAPA4D1B5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GSAPA4D1B5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GSAPA4D1B5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GSAPA4D1B5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GSAPA4D1B5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GSAPA4D1B5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms