RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592991.1

LDLRAD4-218, Transcript of low density lipoprotein receptor class A domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LDLRAD4, Length 1,640 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD4-218ENST00000592991 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.39■■■■■ 7.1
LDLRAD4-218ENST00000592991 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.06■■■■■ 5.92
LDLRAD4-218ENST00000592991 ABCC9O60706 1549 aa49.84■■■■■ 5.57
LDLRAD4-218ENST00000592991 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.78■■■■■ 5.56
LDLRAD4-218ENST00000592991 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.26■■■■■ 5.48
LDLRAD4-218ENST00000592991 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.02■■■■■ 5.44
LDLRAD4-218ENST00000592991 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.64■■■■■ 5.38
LDLRAD4-218ENST00000592991 NACADO15069 1562 aa48.59■■■■■ 5.37
LDLRAD4-218ENST00000592991 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.34■■■■■ 5.33
LDLRAD4-218ENST00000592991 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.14■■■■■ 5.3
LDLRAD4-218ENST00000592991 SCRIBQ14160 1630 aa47.9■■■■■ 5.26
LDLRAD4-218ENST00000592991 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.47■■■■■ 5.19
LDLRAD4-218ENST00000592991 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.96■■■■■ 5.11
LDLRAD4-218ENST00000592991 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.87■■■■■ 5.09
LDLRAD4-218ENST00000592991 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.26■■■■■ 5
LDLRAD4-218ENST00000592991 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.95■■■■■ 4.95
LDLRAD4-218ENST00000592991 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.91■■■■■ 4.94
LDLRAD4-218ENST00000592991 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.88■■■■■ 4.93
LDLRAD4-218ENST00000592991 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.84■■■■■ 4.93
LDLRAD4-218ENST00000592991 SMARCA4P51532 1647 aa45.82■■■■■ 4.93
LDLRAD4-218ENST00000592991 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.57■■■■■ 4.89
LDLRAD4-218ENST00000592991 WIZO95785 1651 aa45.54■■■■■ 4.88
LDLRAD4-218ENST00000592991 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.22■■■■■ 4.83
LDLRAD4-218ENST00000592991 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.18■■■■■ 4.82
LDLRAD4-218ENST00000592991 SMARCA2P51531 1590 aa45.1■■■■■ 4.81
LDLRAD4-218ENST00000592991 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.07■■■■■ 4.81
LDLRAD4-218ENST00000592991 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.99■■■■■ 4.79
LDLRAD4-218ENST00000592991 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.89■■■■■ 4.78
LDLRAD4-218ENST00000592991 NCAPD3P42695 1498 aa44.83■■■■■ 4.77
LDLRAD4-218ENST00000592991 HMGXB3Q12766 1538 aa44.76■■■■■ 4.76
LDLRAD4-218ENST00000592991 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.52■■■■■ 4.72
LDLRAD4-218ENST00000592991 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.49■■■■■ 4.71
LDLRAD4-218ENST00000592991 CFTRP13569 1480 aa43.7■■■■■ 4.59
LDLRAD4-218ENST00000592991 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.66■■■■■ 4.58
LDLRAD4-218ENST00000592991 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.63■■■■■ 4.58
LDLRAD4-218ENST00000592991 NESP48681 1621 aa43.59■■■■■ 4.57
LDLRAD4-218ENST00000592991 PRDM2Q13029 1718 aa43.52■■■■■ 4.56
LDLRAD4-218ENST00000592991 ABCC8Q09428 1581 aa43.47■■■■■ 4.55
LDLRAD4-218ENST00000592991 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.44■■■■■ 4.54
LDLRAD4-218ENST00000592991 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.22■■■■■ 4.51
LDLRAD4-218ENST00000592991 TRIM41Q8WV44 630 aa43.18■■■■■ 4.5
LDLRAD4-218ENST00000592991 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.16■■■■■ 4.5
LDLRAD4-218ENST00000592991 SYNJ1O43426 1573 aa43.09■■■■■ 4.49
LDLRAD4-218ENST00000592991 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.08■■■■■ 4.49
LDLRAD4-218ENST00000592991 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.08■■■■■ 4.49
LDLRAD4-218ENST00000592991 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.01■■■■■ 4.48
LDLRAD4-218ENST00000592991 CUX1P39880 1505 aa42.97■■■■■ 4.47
LDLRAD4-218ENST00000592991 TOP2BQ02880 1626 aa42.9■■■■■ 4.46
LDLRAD4-218ENST00000592991 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.88■■■■■ 4.46
LDLRAD4-218ENST00000592991 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.76■■■■■ 4.44
LDLRAD4-218ENST00000592991 ERCC6Q03468 1493 aa42.75■■■■■ 4.43
LDLRAD4-218ENST00000592991 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.73■■■■■ 4.43
LDLRAD4-218ENST00000592991 TOPBP1Q92547 1522 aa42.7■■■■■ 4.43
LDLRAD4-218ENST00000592991 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.63■■■■■ 4.41
LDLRAD4-218ENST00000592991 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.58■■■■■ 4.41
LDLRAD4-218ENST00000592991 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.5■■■■■ 4.39
LDLRAD4-218ENST00000592991 SOGA1O94964 1423 aa42.48■■■■■ 4.39
LDLRAD4-218ENST00000592991 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.48■■■■■ 4.39
LDLRAD4-218ENST00000592991 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.46■■■■■ 4.39
LDLRAD4-218ENST00000592991 WDR62O43379 1518 aa42.44■■■■■ 4.38
LDLRAD4-218ENST00000592991 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.4■■■■■ 4.38
LDLRAD4-218ENST00000592991 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.35■■■■■ 4.37
LDLRAD4-218ENST00000592991 CUX2O14529 1486 aa42.19■■■■■ 4.34
LDLRAD4-218ENST00000592991 WDR97A6NE52 1622 aa42.15■■■■■ 4.34
LDLRAD4-218ENST00000592991 EEA1Q15075 1411 aa42.14■■■■■ 4.34
LDLRAD4-218ENST00000592991 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.14■■■■■ 4.34
LDLRAD4-218ENST00000592991 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.13■■■■■ 4.33
LDLRAD4-218ENST00000592991 KIF27Q86VH2 1401 aa42.09■■■■■ 4.33
LDLRAD4-218ENST00000592991 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.01■■■■■ 4.32
LDLRAD4-218ENST00000592991 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa42■■■■■ 4.31
LDLRAD4-218ENST00000592991 IFT140Q96RY7 1462 aa41.98■■■■■ 4.31
LDLRAD4-218ENST00000592991 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.98■■■■■ 4.31
LDLRAD4-218ENST00000592991 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.95■■■■■ 4.31
LDLRAD4-218ENST00000592991 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.91■■■■■ 4.3
LDLRAD4-218ENST00000592991 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.87■■■■■ 4.29
LDLRAD4-218ENST00000592991 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.81■■■■■ 4.28
LDLRAD4-218ENST00000592991 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.79■■■■■ 4.28
LDLRAD4-218ENST00000592991 IGF1RP08069 1367 aa41.79■■■■■ 4.28
LDLRAD4-218ENST00000592991 KIF21BO75037 1637 aa41.72■■■■■ 4.27
LDLRAD4-218ENST00000592991 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.72■■■■■ 4.27
LDLRAD4-218ENST00000592991 PBRM1Q86U86 1689 aa41.69■■■■■ 4.26
LDLRAD4-218ENST00000592991 PRXQ9BXM0 1461 aa41.68■■■■■ 4.26
LDLRAD4-218ENST00000592991 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.65■■■■■ 4.26
LDLRAD4-218ENST00000592991 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.62■■■■■ 4.25
LDLRAD4-218ENST00000592991 GOLGA3Q08378 1498 aa41.62■■■■■ 4.25
LDLRAD4-218ENST00000592991 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.57■■■■■ 4.25
LDLRAD4-218ENST00000592991 GRIN2BQ13224 1484 aa41.56■■■■■ 4.24
LDLRAD4-218ENST00000592991 CUL7Q14999 1698 aa41.55■■■■■ 4.24
LDLRAD4-218ENST00000592991 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.45■■■■■ 4.23
LDLRAD4-218ENST00000592991 ADAMTS12P58397 1594 aa41.41■■■■■ 4.22
LDLRAD4-218ENST00000592991 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.41■■■■■ 4.22
LDLRAD4-218ENST00000592991 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.33■■■■■ 4.21
LDLRAD4-218ENST00000592991 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.32■■■■■ 4.21
LDLRAD4-218ENST00000592991 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.26■■■■■ 4.2
LDLRAD4-218ENST00000592991 CEP162Q5TB80 1403 aa41.13■■■■■ 4.18
LDLRAD4-218ENST00000592991 SYNJ2O15056 1496 aa41.12■■■■■ 4.17
LDLRAD4-218ENST00000592991 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.07■■■■■ 4.17
LDLRAD4-218ENST00000592991 GRIN2AQ12879 1464 aa41.07■■■■■ 4.17
LDLRAD4-218ENST00000592991 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.06■■■■■ 4.16
LDLRAD4-218ENST00000592991 FBLN2P98095 1184 aa41.05■■■■■ 4.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms