RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558617.1

AC027237.3-202, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene AC027237.3, Length 1,778 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC027237.3-202ENST00000558617 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.73■■■■■ 7.15
AC027237.3-202ENST00000558617 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.47■■■■■ 5.99
AC027237.3-202ENST00000558617 ABCC9O60706 1549 aa50.32■■■■■ 5.65
AC027237.3-202ENST00000558617 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.03■■■■■ 5.6
AC027237.3-202ENST00000558617 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.56■■■■■ 5.52
AC027237.3-202ENST00000558617 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.34■■■■■ 5.49
AC027237.3-202ENST00000558617 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.04■■■■■ 5.44
AC027237.3-202ENST00000558617 NACADO15069 1562 aa49.01■■■■■ 5.44
AC027237.3-202ENST00000558617 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.79■■■■■ 5.4
AC027237.3-202ENST00000558617 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.2■■■■■ 5.31
AC027237.3-202ENST00000558617 SCRIBQ14160 1630 aa48.18■■■■■ 5.3
AC027237.3-202ENST00000558617 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.88■■■■■ 5.26
AC027237.3-202ENST00000558617 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.39■■■■■ 5.18
AC027237.3-202ENST00000558617 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.28■■■■■ 5.16
AC027237.3-202ENST00000558617 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.51■■■■■ 5.04
AC027237.3-202ENST00000558617 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.17■■■■■ 4.98
AC027237.3-202ENST00000558617 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.14■■■■■ 4.98
AC027237.3-202ENST00000558617 SMARCA4P51532 1647 aa46.11■■■■■ 4.97
AC027237.3-202ENST00000558617 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.02■■■■■ 4.96
AC027237.3-202ENST00000558617 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.01■■■■■ 4.96
AC027237.3-202ENST00000558617 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.95■■■■■ 4.95
AC027237.3-202ENST00000558617 WIZO95785 1651 aa45.75■■■■■ 4.91
AC027237.3-202ENST00000558617 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.55■■■■■ 4.88
AC027237.3-202ENST00000558617 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.53■■■■■ 4.88
AC027237.3-202ENST00000558617 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.51■■■■■ 4.88
AC027237.3-202ENST00000558617 SMARCA2P51531 1590 aa45.45■■■■■ 4.87
AC027237.3-202ENST00000558617 NCAPD3P42695 1498 aa45.22■■■■■ 4.83
AC027237.3-202ENST00000558617 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.21■■■■■ 4.83
AC027237.3-202ENST00000558617 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.21■■■■■ 4.83
AC027237.3-202ENST00000558617 HMGXB3Q12766 1538 aa45.13■■■■■ 4.81
AC027237.3-202ENST00000558617 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.09■■■■■ 4.81
AC027237.3-202ENST00000558617 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.73■■■■■ 4.75
AC027237.3-202ENST00000558617 CFTRP13569 1480 aa44.02■■■■■ 4.64
AC027237.3-202ENST00000558617 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.01■■■■■ 4.64
AC027237.3-202ENST00000558617 NESP48681 1621 aa43.95■■■■■ 4.63
AC027237.3-202ENST00000558617 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.85■■■■■ 4.61
AC027237.3-202ENST00000558617 PRDM2Q13029 1718 aa43.82■■■■■ 4.61
AC027237.3-202ENST00000558617 ABCC8Q09428 1581 aa43.59■■■■■ 4.57
AC027237.3-202ENST00000558617 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.55■■■■■ 4.56
AC027237.3-202ENST00000558617 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.55■■■■■ 4.56
AC027237.3-202ENST00000558617 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.49■■■■■ 4.55
AC027237.3-202ENST00000558617 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.45■■■■■ 4.55
AC027237.3-202ENST00000558617 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.36■■■■■ 4.53
AC027237.3-202ENST00000558617 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.34■■■■■ 4.53
AC027237.3-202ENST00000558617 SYNJ1O43426 1573 aa43.26■■■■■ 4.52
AC027237.3-202ENST00000558617 TRIM41Q8WV44 630 aa43.22■■■■■ 4.51
AC027237.3-202ENST00000558617 ERCC6Q03468 1493 aa43.2■■■■■ 4.51
AC027237.3-202ENST00000558617 CUX1P39880 1505 aa43.19■■■■■ 4.5
AC027237.3-202ENST00000558617 TOP2BQ02880 1626 aa43.11■■■■■ 4.49
AC027237.3-202ENST00000558617 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.09■■■■■ 4.49
AC027237.3-202ENST00000558617 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.08■■■■■ 4.49
AC027237.3-202ENST00000558617 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.03■■■■■ 4.48
AC027237.3-202ENST00000558617 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.01■■■■■ 4.48
AC027237.3-202ENST00000558617 TOPBP1Q92547 1522 aa43.01■■■■■ 4.48
AC027237.3-202ENST00000558617 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.93■■■■■ 4.46
AC027237.3-202ENST00000558617 WDR62O43379 1518 aa42.84■■■■■ 4.45
AC027237.3-202ENST00000558617 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.84■■■■■ 4.45
AC027237.3-202ENST00000558617 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.74■■■■■ 4.43
AC027237.3-202ENST00000558617 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.61■■■■■ 4.41
AC027237.3-202ENST00000558617 SOGA1O94964 1423 aa42.57■■■■■ 4.41
AC027237.3-202ENST00000558617 CUX2O14529 1486 aa42.53■■■■■ 4.4
AC027237.3-202ENST00000558617 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.5■■■■■ 4.39
AC027237.3-202ENST00000558617 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.47■■■■■ 4.39
AC027237.3-202ENST00000558617 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.45■■■■■ 4.39
AC027237.3-202ENST00000558617 WDR97A6NE52 1622 aa42.42■■■■■ 4.38
AC027237.3-202ENST00000558617 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.41■■■■■ 4.38
AC027237.3-202ENST00000558617 IFT140Q96RY7 1462 aa42.35■■■■■ 4.37
AC027237.3-202ENST00000558617 KIF27Q86VH2 1401 aa42.28■■■■■ 4.36
AC027237.3-202ENST00000558617 EEA1Q15075 1411 aa42.24■■■■■ 4.35
AC027237.3-202ENST00000558617 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.24■■■■■ 4.35
AC027237.3-202ENST00000558617 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.2■■■■■ 4.35
AC027237.3-202ENST00000558617 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.18■■■■■ 4.34
AC027237.3-202ENST00000558617 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.11■■■■■ 4.33
AC027237.3-202ENST00000558617 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.11■■■■■ 4.33
AC027237.3-202ENST00000558617 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.09■■■■■ 4.33
AC027237.3-202ENST00000558617 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.06■■■■■ 4.32
AC027237.3-202ENST00000558617 IGF1RP08069 1367 aa42■■■■■ 4.31
AC027237.3-202ENST00000558617 PBRM1Q86U86 1689 aa41.98■■■■■ 4.31
AC027237.3-202ENST00000558617 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.93■■■■■ 4.3
AC027237.3-202ENST00000558617 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.9■■■■■ 4.3
AC027237.3-202ENST00000558617 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.88■■■■■ 4.3
AC027237.3-202ENST00000558617 GRIN2BQ13224 1484 aa41.87■■■■■ 4.29
AC027237.3-202ENST00000558617 PRXQ9BXM0 1461 aa41.82■■■■■ 4.29
AC027237.3-202ENST00000558617 KIF21BO75037 1637 aa41.81■■■■■ 4.28
AC027237.3-202ENST00000558617 CUL7Q14999 1698 aa41.79■■■■■ 4.28
AC027237.3-202ENST00000558617 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.78■■■■■ 4.28
AC027237.3-202ENST00000558617 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.74■■■■■ 4.27
AC027237.3-202ENST00000558617 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.73■■■■■ 4.27
AC027237.3-202ENST00000558617 GOLGA3Q08378 1498 aa41.68■■■■■ 4.26
AC027237.3-202ENST00000558617 ADAMTS12P58397 1594 aa41.68■■■■■ 4.26
AC027237.3-202ENST00000558617 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.6■■■■■ 4.25
AC027237.3-202ENST00000558617 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.6■■■■■ 4.25
AC027237.3-202ENST00000558617 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.51■■■■■ 4.24
AC027237.3-202ENST00000558617 SYNJ2O15056 1496 aa41.46■■■■■ 4.23
AC027237.3-202ENST00000558617 FBLN2P98095 1184 aa41.38■■■■■ 4.22
AC027237.3-202ENST00000558617 GRIN2AQ12879 1464 aa41.38■■■■■ 4.21
AC027237.3-202ENST00000558617 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.37■■■■■ 4.21
AC027237.3-202ENST00000558617 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.36■■■■■ 4.21
AC027237.3-202ENST00000558617 CHD1O14646 1710 aa41.32■■■■■ 4.21
AC027237.3-202ENST00000558617 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.25■■■■■ 4.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms