RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389735.7

HMCES-202, Transcript of 5-hydroxymethylcytosine binding, ES cell specific, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HMCES, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMCES-202ENST00000389735 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.64■■■■■ 6.98
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HMCES-202ENST00000389735 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.03■■■■■ 5.44
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HMCES-202ENST00000389735 NACADO15069 1562 aa48.46■■■■■ 5.35
HMCES-202ENST00000389735 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.43■■■■■ 5.34
HMCES-202ENST00000389735 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.3■■■■■ 5.32
HMCES-202ENST00000389735 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.38■■■■■ 5.17
HMCES-202ENST00000389735 SCRIBQ14160 1630 aa47.32■■■■■ 5.17
HMCES-202ENST00000389735 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.31■■■■■ 5.16
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HMCES-202ENST00000389735 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.62■■■■■ 4.89
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HMCES-202ENST00000389735 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.48■■■■■ 4.87
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HMCES-202ENST00000389735 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.26■■■■■ 4.84
HMCES-202ENST00000389735 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.23■■■■■ 4.83
HMCES-202ENST00000389735 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.19■■■■■ 4.82
HMCES-202ENST00000389735 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.88■■■■■ 4.77
HMCES-202ENST00000389735 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.87■■■■■ 4.77
HMCES-202ENST00000389735 SMARCA2P51531 1590 aa44.83■■■■■ 4.77
HMCES-202ENST00000389735 WIZO95785 1651 aa44.79■■■■■ 4.76
HMCES-202ENST00000389735 NCAPD3P42695 1498 aa44.72■■■■■ 4.75
HMCES-202ENST00000389735 HMGXB3Q12766 1538 aa44.57■■■■■ 4.73
HMCES-202ENST00000389735 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.54■■■■■ 4.72
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HMCES-202ENST00000389735 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.45■■■■■ 4.55
HMCES-202ENST00000389735 NESP48681 1621 aa43.44■■■■■ 4.54
HMCES-202ENST00000389735 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.42■■■■■ 4.54
HMCES-202ENST00000389735 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.4■■■■■ 4.54
HMCES-202ENST00000389735 CFTRP13569 1480 aa43.38■■■■■ 4.54
HMCES-202ENST00000389735 ERCC6Q03468 1493 aa43.12■■■■■ 4.49
HMCES-202ENST00000389735 PRDM2Q13029 1718 aa43.12■■■■■ 4.49
HMCES-202ENST00000389735 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.06■■■■■ 4.48
HMCES-202ENST00000389735 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.96■■■■■ 4.47
HMCES-202ENST00000389735 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.94■■■■■ 4.47
HMCES-202ENST00000389735 TRIM41Q8WV44 630 aa42.83■■■■■ 4.45
HMCES-202ENST00000389735 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.82■■■■■ 4.45
HMCES-202ENST00000389735 ABCC8Q09428 1581 aa42.77■■■■■ 4.44
HMCES-202ENST00000389735 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.62■■■■■ 4.41
HMCES-202ENST00000389735 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.59■■■■■ 4.41
HMCES-202ENST00000389735 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.57■■■■■ 4.4
HMCES-202ENST00000389735 CUX2O14529 1486 aa42.54■■■■■ 4.4
HMCES-202ENST00000389735 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.51■■■■■ 4.4
HMCES-202ENST00000389735 WDR62O43379 1518 aa42.44■■■■■ 4.38
HMCES-202ENST00000389735 SYNJ1O43426 1573 aa42.39■■■■■ 4.38
HMCES-202ENST00000389735 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.38■■■■■ 4.38
HMCES-202ENST00000389735 CUX1P39880 1505 aa42.38■■■■■ 4.38
HMCES-202ENST00000389735 TOPBP1Q92547 1522 aa42.38■■■■■ 4.37
HMCES-202ENST00000389735 TOP2BQ02880 1626 aa42.29■■■■■ 4.36
HMCES-202ENST00000389735 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.26■■■■■ 4.36
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HMCES-202ENST00000389735 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.08■■■■■ 4.33
HMCES-202ENST00000389735 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.98■■■■■ 4.31
HMCES-202ENST00000389735 SOGA1O94964 1423 aa41.9■■■■■ 4.3
HMCES-202ENST00000389735 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.89■■■■■ 4.3
HMCES-202ENST00000389735 EEA1Q15075 1411 aa41.88■■■■■ 4.3
HMCES-202ENST00000389735 IFT140Q96RY7 1462 aa41.88■■■■■ 4.29
HMCES-202ENST00000389735 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.87■■■■■ 4.29
HMCES-202ENST00000389735 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.74■■■■■ 4.27
HMCES-202ENST00000389735 WDR97A6NE52 1622 aa41.72■■■■■ 4.27
HMCES-202ENST00000389735 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.72■■■■■ 4.27
HMCES-202ENST00000389735 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.71■■■■■ 4.27
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HMCES-202ENST00000389735 KIF27Q86VH2 1401 aa41.54■■■■■ 4.24
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HMCES-202ENST00000389735 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.43■■■■■ 4.22
HMCES-202ENST00000389735 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.35■■■■■ 4.21
HMCES-202ENST00000389735 KIF21BO75037 1637 aa41.35■■■■■ 4.21
HMCES-202ENST00000389735 PBRM1Q86U86 1689 aa41.31■■■■■ 4.2
HMCES-202ENST00000389735 GRIN2BQ13224 1484 aa41.3■■■■■ 4.2
HMCES-202ENST00000389735 GOLGA3Q08378 1498 aa41.26■■■■■ 4.2
HMCES-202ENST00000389735 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.22■■■■■ 4.19
HMCES-202ENST00000389735 IGF1RP08069 1367 aa41.18■■■■■ 4.18
HMCES-202ENST00000389735 PRXQ9BXM0 1461 aa41.16■■■■■ 4.18
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HMCES-202ENST00000389735 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.13■■■■■ 4.17
HMCES-202ENST00000389735 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.11■■■■■ 4.17
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HMCES-202ENST00000389735 CUL7Q14999 1698 aa41■■■■■ 4.15
HMCES-202ENST00000389735 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.97■■■■■ 4.15
HMCES-202ENST00000389735 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.96■■■■■ 4.15
HMCES-202ENST00000389735 SYNJ2O15056 1496 aa40.95■■■■■ 4.15
HMCES-202ENST00000389735 OSCARQ8IYS5 282 aa40.9■■■■■ 4.14
HMCES-202ENST00000389735 FBLN2P98095 1184 aa40.86■■■■■ 4.13
HMCES-202ENST00000389735 CHD1O14646 1710 aa40.86■■■■■ 4.13
HMCES-202ENST00000389735 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.84■■■■■ 4.13
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