RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541292.5

PEX7-203, Transcript of peroxisomal biogenesis factor 7, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PEX7, Length 945 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX7-203ENST00000541292 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.65■■■■■ 7.3
PEX7-203ENST00000541292 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.64■■■■■ 6.18
PEX7-203ENST00000541292 ABCC9O60706 1549 aa51.72■■■■■ 5.87
PEX7-203ENST00000541292 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.66■■■■■ 5.7
PEX7-203ENST00000541292 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.23■■■■■ 5.63
PEX7-203ENST00000541292 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.23■■■■■ 5.63
PEX7-203ENST00000541292 NACADO15069 1562 aa50.22■■■■■ 5.63
PEX7-203ENST00000541292 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.17■■■■■ 5.62
PEX7-203ENST00000541292 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.09■■■■■ 5.61
PEX7-203ENST00000541292 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.15■■■■■ 5.46
PEX7-203ENST00000541292 SCRIBQ14160 1630 aa48.94■■■■■ 5.43
PEX7-203ENST00000541292 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.65■■■■■ 5.38
PEX7-203ENST00000541292 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.43■■■■■ 5.34
PEX7-203ENST00000541292 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.24■■■■■ 5.31
PEX7-203ENST00000541292 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.24■■■■■ 5.15
PEX7-203ENST00000541292 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.18■■■■■ 5.14
PEX7-203ENST00000541292 SMARCA4P51532 1647 aa46.93■■■■■ 5.1
PEX7-203ENST00000541292 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.92■■■■■ 5.1
PEX7-203ENST00000541292 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.91■■■■■ 5.1
PEX7-203ENST00000541292 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.88■■■■■ 5.1
PEX7-203ENST00000541292 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.77■■■■■ 5.08
PEX7-203ENST00000541292 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.47■■■■■ 5.03
PEX7-203ENST00000541292 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.47■■■■■ 5.03
PEX7-203ENST00000541292 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.46■■■■■ 5.03
PEX7-203ENST00000541292 SMARCA2P51531 1590 aa46.42■■■■■ 5.02
PEX7-203ENST00000541292 NCAPD3P42695 1498 aa46.34■■■■■ 5.01
PEX7-203ENST00000541292 WIZO95785 1651 aa46.33■■■■■ 5.01
PEX7-203ENST00000541292 HMGXB3Q12766 1538 aa46.18■■■■■ 4.98
PEX7-203ENST00000541292 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.06■■■■■ 4.96
PEX7-203ENST00000541292 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.82■■■■■ 4.92
PEX7-203ENST00000541292 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.71■■■■■ 4.91
PEX7-203ENST00000541292 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.29■■■■■ 4.84
PEX7-203ENST00000541292 NESP48681 1621 aa45.02■■■■■ 4.8
PEX7-203ENST00000541292 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45■■■■■ 4.79
PEX7-203ENST00000541292 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.99■■■■■ 4.79
PEX7-203ENST00000541292 CFTRP13569 1480 aa44.9■■■■■ 4.78
PEX7-203ENST00000541292 PRDM2Q13029 1718 aa44.74■■■■■ 4.75
PEX7-203ENST00000541292 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.6■■■■■ 4.73
PEX7-203ENST00000541292 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.57■■■■■ 4.73
PEX7-203ENST00000541292 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.47■■■■■ 4.71
PEX7-203ENST00000541292 ERCC6Q03468 1493 aa44.45■■■■■ 4.71
PEX7-203ENST00000541292 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.33■■■■■ 4.69
PEX7-203ENST00000541292 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.22■■■■■ 4.67
PEX7-203ENST00000541292 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.13■■■■■ 4.65
PEX7-203ENST00000541292 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.03■■■■■ 4.64
PEX7-203ENST00000541292 WDR62O43379 1518 aa44■■■■■ 4.63
PEX7-203ENST00000541292 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.88■■■■■ 4.62
PEX7-203ENST00000541292 TOPBP1Q92547 1522 aa43.88■■■■■ 4.61
PEX7-203ENST00000541292 ABCC8Q09428 1581 aa43.87■■■■■ 4.61
PEX7-203ENST00000541292 CUX1P39880 1505 aa43.83■■■■■ 4.61
PEX7-203ENST00000541292 CUX2O14529 1486 aa43.8■■■■■ 4.6
PEX7-203ENST00000541292 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.73■■■■■ 4.59
PEX7-203ENST00000541292 SYNJ1O43426 1573 aa43.67■■■■■ 4.58
PEX7-203ENST00000541292 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.66■■■■■ 4.58
PEX7-203ENST00000541292 TOP2BQ02880 1626 aa43.64■■■■■ 4.58
PEX7-203ENST00000541292 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.54■■■■■ 4.56
PEX7-203ENST00000541292 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.52■■■■■ 4.56
PEX7-203ENST00000541292 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.4■■■■■ 4.54
PEX7-203ENST00000541292 IFT140Q96RY7 1462 aa43.38■■■■■ 4.53
PEX7-203ENST00000541292 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.34■■■■■ 4.53
PEX7-203ENST00000541292 SOGA1O94964 1423 aa43.34■■■■■ 4.53
PEX7-203ENST00000541292 WDR97A6NE52 1622 aa43.24■■■■■ 4.51
PEX7-203ENST00000541292 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.17■■■■■ 4.5
PEX7-203ENST00000541292 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.17■■■■■ 4.5
PEX7-203ENST00000541292 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.16■■■■■ 4.5
PEX7-203ENST00000541292 TRIM41Q8WV44 630 aa43.14■■■■■ 4.5
PEX7-203ENST00000541292 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.03■■■■■ 4.48
PEX7-203ENST00000541292 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.01■■■■■ 4.48
PEX7-203ENST00000541292 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43■■■■■ 4.47
PEX7-203ENST00000541292 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.97■■■■■ 4.47
PEX7-203ENST00000541292 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.87■■■■■ 4.45
PEX7-203ENST00000541292 PBRM1Q86U86 1689 aa42.82■■■■■ 4.44
PEX7-203ENST00000541292 KIF27Q86VH2 1401 aa42.75■■■■■ 4.43
PEX7-203ENST00000541292 GRIN2BQ13224 1484 aa42.74■■■■■ 4.43
PEX7-203ENST00000541292 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.69■■■■■ 4.42
PEX7-203ENST00000541292 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.65■■■■■ 4.42
PEX7-203ENST00000541292 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.6■■■■■ 4.41
PEX7-203ENST00000541292 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.56■■■■■ 4.4
PEX7-203ENST00000541292 IGF1RP08069 1367 aa42.55■■■■■ 4.4
PEX7-203ENST00000541292 ADAMTS12P58397 1594 aa42.47■■■■■ 4.39
PEX7-203ENST00000541292 CHD1O14646 1710 aa42.42■■■■■ 4.38
PEX7-203ENST00000541292 EEA1Q15075 1411 aa42.41■■■■■ 4.38
PEX7-203ENST00000541292 CUL7Q14999 1698 aa42.41■■■■■ 4.38
PEX7-203ENST00000541292 SYNJ2O15056 1496 aa42.39■■■■■ 4.38
PEX7-203ENST00000541292 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.38■■■■■ 4.38
PEX7-203ENST00000541292 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.28■■■■■ 4.36
PEX7-203ENST00000541292 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.26■■■■■ 4.36
PEX7-203ENST00000541292 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.25■■■■■ 4.35
PEX7-203ENST00000541292 FBLN2P98095 1184 aa42.23■■■■■ 4.35
PEX7-203ENST00000541292 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.23■■■■■ 4.35
PEX7-203ENST00000541292 GRIN2AQ12879 1464 aa42.22■■■■■ 4.35
PEX7-203ENST00000541292 PRXQ9BXM0 1461 aa42.17■■■■■ 4.34
PEX7-203ENST00000541292 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.11■■■■■ 4.33
PEX7-203ENST00000541292 OSCARQ8IYS5 282 aa42.07■■■■■ 4.33
PEX7-203ENST00000541292 NUP160Q12769 1436 aa42.03■■■■■ 4.32
PEX7-203ENST00000541292 CEP170Q5SW79 1584 aa42.02■■■■■ 4.32
PEX7-203ENST00000541292 KIF21BO75037 1637 aa41.99■■■■■ 4.31
PEX7-203ENST00000541292 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.94■■■■■ 4.3
PEX7-203ENST00000541292 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.78■■■■■ 4.28
PEX7-203ENST00000541292 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.77■■■■■ 4.28
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