RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621465.4

COPZ2-210, Transcript of coatomer protein complex subunit zeta 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COPZ2, Length 895 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ2-210ENST00000621465 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.84■■■■■ 7.33
COPZ2-210ENST00000621465 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.13■■■■■ 6.26
COPZ2-210ENST00000621465 ABCC9O60706 1549 aa52.95■■■■■ 6.07
COPZ2-210ENST00000621465 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.99■■■■■ 5.75
COPZ2-210ENST00000621465 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.96■■■■■ 5.75
COPZ2-210ENST00000621465 NACADO15069 1562 aa50.86■■■■■ 5.73
COPZ2-210ENST00000621465 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.68■■■■■ 5.7
COPZ2-210ENST00000621465 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.48■■■■■ 5.67
COPZ2-210ENST00000621465 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.31■■■■■ 5.64
COPZ2-210ENST00000621465 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.8■■■■■ 5.56
COPZ2-210ENST00000621465 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.47■■■■■ 5.51
COPZ2-210ENST00000621465 SCRIBQ14160 1630 aa49.44■■■■■ 5.5
COPZ2-210ENST00000621465 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.31■■■■■ 5.48
COPZ2-210ENST00000621465 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.81■■■■■ 5.4
COPZ2-210ENST00000621465 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.43■■■■■ 5.34
COPZ2-210ENST00000621465 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.07■■■■■ 5.29
COPZ2-210ENST00000621465 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.89■■■■■ 5.26
COPZ2-210ENST00000621465 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.55■■■■■ 5.2
COPZ2-210ENST00000621465 SMARCA4P51532 1647 aa47.24■■■■■ 5.15
COPZ2-210ENST00000621465 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.2■■■■■ 5.15
COPZ2-210ENST00000621465 SMARCA2P51531 1590 aa46.94■■■■■ 5.1
COPZ2-210ENST00000621465 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.93■■■■■ 5.1
COPZ2-210ENST00000621465 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.89■■■■■ 5.1
COPZ2-210ENST00000621465 NCAPD3P42695 1498 aa46.87■■■■■ 5.09
COPZ2-210ENST00000621465 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.71■■■■■ 5.07
COPZ2-210ENST00000621465 HMGXB3Q12766 1538 aa46.69■■■■■ 5.07
COPZ2-210ENST00000621465 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.63■■■■■ 5.05
COPZ2-210ENST00000621465 WIZO95785 1651 aa46.44■■■■■ 5.02
COPZ2-210ENST00000621465 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.35■■■■■ 5.01
COPZ2-210ENST00000621465 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.93■■■■■ 4.94
COPZ2-210ENST00000621465 NESP48681 1621 aa45.79■■■■■ 4.92
COPZ2-210ENST00000621465 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.71■■■■■ 4.91
COPZ2-210ENST00000621465 ERCC6Q03468 1493 aa45.7■■■■■ 4.91
COPZ2-210ENST00000621465 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.55■■■■■ 4.88
COPZ2-210ENST00000621465 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.41■■■■■ 4.86
COPZ2-210ENST00000621465 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.37■■■■■ 4.85
COPZ2-210ENST00000621465 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.35■■■■■ 4.85
COPZ2-210ENST00000621465 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.31■■■■■ 4.84
COPZ2-210ENST00000621465 CFTRP13569 1480 aa45.26■■■■■ 4.84
COPZ2-210ENST00000621465 CUX2O14529 1486 aa45.1■■■■■ 4.81
COPZ2-210ENST00000621465 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.09■■■■■ 4.81
COPZ2-210ENST00000621465 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.07■■■■■ 4.81
COPZ2-210ENST00000621465 PRDM2Q13029 1718 aa45.05■■■■■ 4.8
COPZ2-210ENST00000621465 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.04■■■■■ 4.8
COPZ2-210ENST00000621465 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.93■■■■■ 4.78
COPZ2-210ENST00000621465 WDR62O43379 1518 aa44.75■■■■■ 4.76
COPZ2-210ENST00000621465 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.57■■■■■ 4.73
COPZ2-210ENST00000621465 ABCC8Q09428 1581 aa44.35■■■■■ 4.69
COPZ2-210ENST00000621465 TOPBP1Q92547 1522 aa44.34■■■■■ 4.69
COPZ2-210ENST00000621465 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.31■■■■■ 4.68
COPZ2-210ENST00000621465 IFT140Q96RY7 1462 aa44.06■■■■■ 4.64
COPZ2-210ENST00000621465 CUX1P39880 1505 aa44■■■■■ 4.63
COPZ2-210ENST00000621465 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.95■■■■■ 4.63
COPZ2-210ENST00000621465 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.88■■■■■ 4.61
COPZ2-210ENST00000621465 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.84■■■■■ 4.61
COPZ2-210ENST00000621465 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.83■■■■■ 4.61
COPZ2-210ENST00000621465 SOGA1O94964 1423 aa43.8■■■■■ 4.6
COPZ2-210ENST00000621465 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.77■■■■■ 4.6
COPZ2-210ENST00000621465 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.76■■■■■ 4.6
COPZ2-210ENST00000621465 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.71■■■■■ 4.59
COPZ2-210ENST00000621465 TOP2BQ02880 1626 aa43.66■■■■■ 4.58
COPZ2-210ENST00000621465 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.66■■■■■ 4.58
COPZ2-210ENST00000621465 SYNJ1O43426 1573 aa43.64■■■■■ 4.58
COPZ2-210ENST00000621465 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.64■■■■■ 4.58
COPZ2-210ENST00000621465 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.61■■■■■ 4.57
COPZ2-210ENST00000621465 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.54■■■■■ 4.56
COPZ2-210ENST00000621465 WDR97A6NE52 1622 aa43.51■■■■■ 4.56
COPZ2-210ENST00000621465 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.42■■■■■ 4.54
COPZ2-210ENST00000621465 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.3■■■■■ 4.52
COPZ2-210ENST00000621465 GRIN2BQ13224 1484 aa43.29■■■■■ 4.52
COPZ2-210ENST00000621465 OSCARQ8IYS5 282 aa43.27■■■■■ 4.52
COPZ2-210ENST00000621465 PBRM1Q86U86 1689 aa43.27■■■■■ 4.52
COPZ2-210ENST00000621465 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.26■■■■■ 4.52
COPZ2-210ENST00000621465 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.23■■■■■ 4.51
COPZ2-210ENST00000621465 FBLN2P98095 1184 aa43.19■■■■■ 4.5
COPZ2-210ENST00000621465 CHD1O14646 1710 aa43.19■■■■■ 4.5
COPZ2-210ENST00000621465 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.16■■■■■ 4.5
COPZ2-210ENST00000621465 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.03■■■■■ 4.48
COPZ2-210ENST00000621465 SYNJ2O15056 1496 aa42.99■■■■■ 4.47
COPZ2-210ENST00000621465 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.92■■■■■ 4.46
COPZ2-210ENST00000621465 ADAMTS12P58397 1594 aa42.87■■■■■ 4.45
COPZ2-210ENST00000621465 KIF27Q86VH2 1401 aa42.87■■■■■ 4.45
COPZ2-210ENST00000621465 TRIM41Q8WV44 630 aa42.82■■■■■ 4.45
COPZ2-210ENST00000621465 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.79■■■■■ 4.44
COPZ2-210ENST00000621465 GRIN2AQ12879 1464 aa42.73■■■■■ 4.43
COPZ2-210ENST00000621465 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.63■■■■■ 4.42
COPZ2-210ENST00000621465 IGF1RP08069 1367 aa42.6■■■■■ 4.41
COPZ2-210ENST00000621465 CUL7Q14999 1698 aa42.6■■■■■ 4.41
COPZ2-210ENST00000621465 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.59■■■■■ 4.41
COPZ2-210ENST00000621465 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.59■■■■■ 4.41
COPZ2-210ENST00000621465 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.59■■■■■ 4.41
COPZ2-210ENST00000621465 ARHGEF11O15085 1522 aa42.56■■■■■ 4.4
COPZ2-210ENST00000621465 CEP170Q5SW79 1584 aa42.5■■■■■ 4.39
COPZ2-210ENST00000621465 NUP160Q12769 1436 aa42.47■■■■■ 4.39
COPZ2-210ENST00000621465 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.43■■■■■ 4.38
COPZ2-210ENST00000621465 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.41■■■■■ 4.38
COPZ2-210ENST00000621465 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.23■■■■■ 4.35
COPZ2-210ENST00000621465 ARAP1Q96P48 1450 aa42.2■■■■■ 4.35
COPZ2-210ENST00000621465 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.2■■■■■ 4.35
COPZ2-210ENST00000621465 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.18■■■■■ 4.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.2 ms