RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470744.5

CLTA-207, Transcript of clathrin light chain A, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CLTA, Length 1,102 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTA-207ENST00000470744 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.88■■■■■ 7.5
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CLTA-207ENST00000470744 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52■■■■■ 5.91
CLTA-207ENST00000470744 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.9■■■■■ 5.9
CLTA-207ENST00000470744 NACADO15069 1562 aa51.87■■■■■ 5.89
CLTA-207ENST00000470744 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.48■■■■■ 5.83
CLTA-207ENST00000470744 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.46■■■■■ 5.83
CLTA-207ENST00000470744 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.14■■■■■ 5.78
CLTA-207ENST00000470744 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.74■■■■■ 5.71
CLTA-207ENST00000470744 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.68■■■■■ 5.7
CLTA-207ENST00000470744 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.44■■■■■ 5.67
CLTA-207ENST00000470744 SCRIBQ14160 1630 aa50.29■■■■■ 5.64
CLTA-207ENST00000470744 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.06■■■■■ 5.6
CLTA-207ENST00000470744 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.86■■■■■ 5.57
CLTA-207ENST00000470744 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.15■■■■■ 5.46
CLTA-207ENST00000470744 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.01■■■■■ 5.44
CLTA-207ENST00000470744 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.76■■■■■ 5.4
CLTA-207ENST00000470744 SMARCA4P51532 1647 aa48.05■■■■■ 5.28
CLTA-207ENST00000470744 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.96■■■■■ 5.27
CLTA-207ENST00000470744 NCAPD3P42695 1498 aa47.9■■■■■ 5.26
CLTA-207ENST00000470744 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.9■■■■■ 5.26
CLTA-207ENST00000470744 SMARCA2P51531 1590 aa47.79■■■■■ 5.24
CLTA-207ENST00000470744 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.7■■■■■ 5.23
CLTA-207ENST00000470744 HMGXB3Q12766 1538 aa47.61■■■■■ 5.21
CLTA-207ENST00000470744 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.57■■■■■ 5.21
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CLTA-207ENST00000470744 WIZO95785 1651 aa47.14■■■■■ 5.14
CLTA-207ENST00000470744 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.06■■■■■ 5.12
CLTA-207ENST00000470744 NESP48681 1621 aa46.85■■■■■ 5.09
CLTA-207ENST00000470744 ERCC6Q03468 1493 aa46.77■■■■■ 5.08
CLTA-207ENST00000470744 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.64■■■■■ 5.06
CLTA-207ENST00000470744 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.64■■■■■ 5.06
CLTA-207ENST00000470744 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.5■■■■■ 5.03
CLTA-207ENST00000470744 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.38■■■■■ 5.02
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CLTA-207ENST00000470744 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.22■■■■■ 4.99
CLTA-207ENST00000470744 CFTRP13569 1480 aa46.16■■■■■ 4.98
CLTA-207ENST00000470744 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.15■■■■■ 4.98
CLTA-207ENST00000470744 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.12■■■■■ 4.97
CLTA-207ENST00000470744 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.97■■■■■ 4.95
CLTA-207ENST00000470744 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.93■■■■■ 4.94
CLTA-207ENST00000470744 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.92■■■■■ 4.94
CLTA-207ENST00000470744 WDR62O43379 1518 aa45.76■■■■■ 4.92
CLTA-207ENST00000470744 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.73■■■■■ 4.91
CLTA-207ENST00000470744 PRDM2Q13029 1718 aa45.66■■■■■ 4.9
CLTA-207ENST00000470744 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.52■■■■■ 4.88
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CLTA-207ENST00000470744 TOPBP1Q92547 1522 aa45.2■■■■■ 4.83
CLTA-207ENST00000470744 ABCC8Q09428 1581 aa45.15■■■■■ 4.82
CLTA-207ENST00000470744 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.1■■■■■ 4.81
CLTA-207ENST00000470744 IFT140Q96RY7 1462 aa44.98■■■■■ 4.79
CLTA-207ENST00000470744 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.82■■■■■ 4.77
CLTA-207ENST00000470744 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.8■■■■■ 4.76
CLTA-207ENST00000470744 CUX1P39880 1505 aa44.76■■■■■ 4.76
CLTA-207ENST00000470744 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.68■■■■■ 4.74
CLTA-207ENST00000470744 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.66■■■■■ 4.74
CLTA-207ENST00000470744 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.64■■■■■ 4.74
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CLTA-207ENST00000470744 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.39■■■■■ 4.7
CLTA-207ENST00000470744 WDR97A6NE52 1622 aa44.29■■■■■ 4.68
CLTA-207ENST00000470744 SYNJ1O43426 1573 aa44.27■■■■■ 4.68
CLTA-207ENST00000470744 TOP2BQ02880 1626 aa44.27■■■■■ 4.68
CLTA-207ENST00000470744 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.24■■■■■ 4.67
CLTA-207ENST00000470744 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.19■■■■■ 4.67
CLTA-207ENST00000470744 GRIN2BQ13224 1484 aa44.12■■■■■ 4.65
CLTA-207ENST00000470744 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.12■■■■■ 4.65
CLTA-207ENST00000470744 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.09■■■■■ 4.65
CLTA-207ENST00000470744 FBLN2P98095 1184 aa44.09■■■■■ 4.65
CLTA-207ENST00000470744 CHD1O14646 1710 aa44.04■■■■■ 4.64
CLTA-207ENST00000470744 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.02■■■■■ 4.64
CLTA-207ENST00000470744 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.02■■■■■ 4.64
CLTA-207ENST00000470744 PBRM1Q86U86 1689 aa43.95■■■■■ 4.63
CLTA-207ENST00000470744 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.91■■■■■ 4.62
CLTA-207ENST00000470744 SYNJ2O15056 1496 aa43.86■■■■■ 4.61
CLTA-207ENST00000470744 TRIM41Q8WV44 630 aa43.72■■■■■ 4.59
CLTA-207ENST00000470744 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.68■■■■■ 4.58
CLTA-207ENST00000470744 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.68■■■■■ 4.58
CLTA-207ENST00000470744 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.68■■■■■ 4.58
CLTA-207ENST00000470744 ARHGEF11O15085 1522 aa43.67■■■■■ 4.58
CLTA-207ENST00000470744 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.65■■■■■ 4.58
CLTA-207ENST00000470744 ADAMTS12P58397 1594 aa43.63■■■■■ 4.58
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CLTA-207ENST00000470744 KIF27Q86VH2 1401 aa43.48■■■■■ 4.55
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CLTA-207ENST00000470744 IGF1RP08069 1367 aa43.35■■■■■ 4.53
CLTA-207ENST00000470744 CEP170Q5SW79 1584 aa43.33■■■■■ 4.53
CLTA-207ENST00000470744 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.33■■■■■ 4.53
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CLTA-207ENST00000470744 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.01■■■■■ 4.48
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