Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYK2

CCDC105, Coiled-coil domain-containing protein 105, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC105Q8IYK2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC105Q8IYK2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC105Q8IYK2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC105Q8IYK2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC105Q8IYK2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC105Q8IYK2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC105Q8IYK2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC105Q8IYK2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC105Q8IYK2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC105Q8IYK2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC105Q8IYK2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC105Q8IYK2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC105Q8IYK2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC105Q8IYK2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC105Q8IYK2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC105Q8IYK2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC105Q8IYK2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC105Q8IYK2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC105Q8IYK2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC105Q8IYK2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC105Q8IYK2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC105Q8IYK2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC105Q8IYK2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC105Q8IYK2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC105Q8IYK2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC105Q8IYK2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC105Q8IYK2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC105Q8IYK2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC105Q8IYK2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC105Q8IYK2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC105Q8IYK2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC105Q8IYK2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC105Q8IYK2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC105Q8IYK2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC105Q8IYK2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC105Q8IYK2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC105Q8IYK2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC105Q8IYK2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC105Q8IYK2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC105Q8IYK2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC105Q8IYK2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC105Q8IYK2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC105Q8IYK2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC105Q8IYK2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC105Q8IYK2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC105Q8IYK2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC105Q8IYK2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC105Q8IYK2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC105Q8IYK2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC105Q8IYK2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC105Q8IYK2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC105Q8IYK2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC105Q8IYK2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC105Q8IYK2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC105Q8IYK2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC105Q8IYK2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC105Q8IYK2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC105Q8IYK2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC105Q8IYK2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC105Q8IYK2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC105Q8IYK2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC105Q8IYK2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC105Q8IYK2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC105Q8IYK2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC105Q8IYK2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC105Q8IYK2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC105Q8IYK2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC105Q8IYK2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC105Q8IYK2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC105Q8IYK2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC105Q8IYK2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC105Q8IYK2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC105Q8IYK2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC105Q8IYK2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC105Q8IYK2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC105Q8IYK2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC105Q8IYK2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC105Q8IYK2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC105Q8IYK2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC105Q8IYK2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC105Q8IYK2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC105Q8IYK2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC105Q8IYK2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC105Q8IYK2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC105Q8IYK2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC105Q8IYK2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC105Q8IYK2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC105Q8IYK2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC105Q8IYK2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC105Q8IYK2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC105Q8IYK2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC105Q8IYK2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC105Q8IYK2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC105Q8IYK2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC105Q8IYK2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC105Q8IYK2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC105Q8IYK2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC105Q8IYK2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC105Q8IYK2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC105Q8IYK2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms