Protein–RNA interactions for Protein: P04049

RAF1, RAF proto-oncogene serine/threonine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAF1P04049 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAF1P04049 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAF1P04049 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAF1P04049 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAF1P04049 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAF1P04049 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAF1P04049 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAF1P04049 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAF1P04049 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAF1P04049 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAF1P04049 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAF1P04049 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAF1P04049 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAF1P04049 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RAF1P04049 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAF1P04049 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAF1P04049 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAF1P04049 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAF1P04049 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAF1P04049 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAF1P04049 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAF1P04049 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAF1P04049 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAF1P04049 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAF1P04049 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAF1P04049 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAF1P04049 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAF1P04049 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAF1P04049 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAF1P04049 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAF1P04049 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAF1P04049 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RAF1P04049 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAF1P04049 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAF1P04049 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAF1P04049 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAF1P04049 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAF1P04049 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAF1P04049 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAF1P04049 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAF1P04049 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAF1P04049 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAF1P04049 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAF1P04049 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAF1P04049 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAF1P04049 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAF1P04049 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAF1P04049 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAF1P04049 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAF1P04049 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAF1P04049 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAF1P04049 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAF1P04049 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAF1P04049 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAF1P04049 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAF1P04049 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAF1P04049 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAF1P04049 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAF1P04049 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAF1P04049 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAF1P04049 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAF1P04049 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAF1P04049 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAF1P04049 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAF1P04049 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAF1P04049 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAF1P04049 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAF1P04049 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RAF1P04049 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAF1P04049 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAF1P04049 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAF1P04049 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAF1P04049 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAF1P04049 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RAF1P04049 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAF1P04049 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAF1P04049 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAF1P04049 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAF1P04049 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAF1P04049 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAF1P04049 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAF1P04049 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAF1P04049 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAF1P04049 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAF1P04049 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAF1P04049 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAF1P04049 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAF1P04049 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAF1P04049 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAF1P04049 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAF1P04049 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAF1P04049 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAF1P04049 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAF1P04049 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAF1P04049 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAF1P04049 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAF1P04049 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAF1P04049 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAF1P04049 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAF1P04049 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms