RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508870.5

NREP-216, Transcript of neuronal regeneration related protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 4 BASIC

Gene NREP, Length 540 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NREP-216ENST00000508870 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.93■■■■■ 7.82
NREP-216ENST00000508870 ABCC9O60706 1549 aa58.03■■■■■ 6.88
NREP-216ENST00000508870 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa57.43■■■■■ 6.78
NREP-216ENST00000508870 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.93■■■■■ 6.38
NREP-216ENST00000508870 DNAJC5BQ9UF47 199 aa54.79■■■■■ 6.36
NREP-216ENST00000508870 NACADO15069 1562 aa54.43■■■■■ 6.3
NREP-216ENST00000508870 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.41■■■■■ 6.3
NREP-216ENST00000508870 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP54.05■■■■■ 6.24
NREP-216ENST00000508870 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.68■■■■■ 6.18
NREP-216ENST00000508870 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.47■■■■■ 6.15
NREP-216ENST00000508870 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.35■■■■■ 6.13
NREP-216ENST00000508870 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.88■■■■■ 6.06
NREP-216ENST00000508870 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.66■■■■■ 6.02
NREP-216ENST00000508870 SCRIBQ14160 1630 aa52.49■■■■■ 5.99
NREP-216ENST00000508870 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.46■■■■■ 5.99
NREP-216ENST00000508870 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa52.33■■■■■ 5.97
NREP-216ENST00000508870 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.27■■■■■ 5.96
NREP-216ENST00000508870 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP52.1■■■■■ 5.93
NREP-216ENST00000508870 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa50.52■■■■■ 5.68
NREP-216ENST00000508870 NCAPD3P42695 1498 aa50.27■■■■■ 5.64
NREP-216ENST00000508870 ERCC6Q03468 1493 aa50.13■■■■■ 5.62
NREP-216ENST00000508870 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.12■■■■■ 5.61
NREP-216ENST00000508870 CUX2O14529 1486 aa50.04■■■■■ 5.6
NREP-216ENST00000508870 SMARCA4P51532 1647 aa49.95■■■■■ 5.59
NREP-216ENST00000508870 SMARCA2P51531 1590 aa49.92■■■■■ 5.58
NREP-216ENST00000508870 HMGXB3Q12766 1538 aa49.84■■■■■ 5.57
NREP-216ENST00000508870 NESP48681 1621 aa49.73■■■■■ 5.55
NREP-216ENST00000508870 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.64■■■■■ 5.54
NREP-216ENST00000508870 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.63■■■■■ 5.54
NREP-216ENST00000508870 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.38■■■■■ 5.5
NREP-216ENST00000508870 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.3■■■■■ 5.48
NREP-216ENST00000508870 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP49.2■■■■■ 5.47
NREP-216ENST00000508870 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.19■■■■■ 5.47
NREP-216ENST00000508870 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.01■■■■■ 5.44
NREP-216ENST00000508870 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.99■■■■■ 5.43
NREP-216ENST00000508870 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.79■■■■■ 5.4
NREP-216ENST00000508870 WIZO95785 1651 aa48.7■■■■■ 5.39
NREP-216ENST00000508870 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.59■■■■■ 5.37
NREP-216ENST00000508870 WDR62O43379 1518 aa48.44■■■■■ 5.35
NREP-216ENST00000508870 TRIM41Q8WV44 630 aa48.34■■■■■ 5.33
NREP-216ENST00000508870 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.33■■■■■ 5.33
NREP-216ENST00000508870 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.26■■■■■ 5.32
NREP-216ENST00000508870 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.14■■■■■ 5.3
NREP-216ENST00000508870 CFTRP13569 1480 aa48.11■■■■■ 5.29
NREP-216ENST00000508870 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.01■■■■■ 5.28
NREP-216ENST00000508870 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.87■■■■■ 5.25
NREP-216ENST00000508870 OSCARQ8IYS5 282 aa47.79■■■■■ 5.24
NREP-216ENST00000508870 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.53■■■■■ 5.2
NREP-216ENST00000508870 PRDM2Q13029 1718 aa47.53■■■■■ 5.2
NREP-216ENST00000508870 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.39■■■■■ 5.18
NREP-216ENST00000508870 IFT140Q96RY7 1462 aa47.35■■■■■ 5.17
NREP-216ENST00000508870 TOPBP1Q92547 1522 aa47.29■■■■■ 5.16
NREP-216ENST00000508870 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa47.17■■■■■ 5.14
NREP-216ENST00000508870 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa47.17■■■■■ 5.14
NREP-216ENST00000508870 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa47.17■■■■■ 5.14
NREP-216ENST00000508870 ABCC8Q09428 1581 aa47.08■■■■■ 5.13
NREP-216ENST00000508870 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.05■■■■■ 5.12
NREP-216ENST00000508870 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.05■■■■■ 5.12
NREP-216ENST00000508870 ARHGEF11O15085 1522 aa46.99■■■■■ 5.11
NREP-216ENST00000508870 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.94■■■■■ 5.11e-6■■■■□ 26.3
NREP-216ENST00000508870 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.84■■■■■ 5.09
NREP-216ENST00000508870 FBLN2P98095 1184 aa46.82■■■■■ 5.09
NREP-216ENST00000508870 CYB5RLQ6IPT4 315 aa46.79■■■■■ 5.08
NREP-216ENST00000508870 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.78■■■■■ 5.08
NREP-216ENST00000508870 CHD1O14646 1710 aa46.77■■■■■ 5.08
NREP-216ENST00000508870 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.7■■■■■ 5.07
NREP-216ENST00000508870 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.6■■■■■ 5.05
NREP-216ENST00000508870 SOGA1O94964 1423 aa46.6■■■■■ 5.05
NREP-216ENST00000508870 ARAP1Q96P48 1450 aa46.51■■■■■ 5.04
NREP-216ENST00000508870 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.46■■■■■ 5.03
NREP-216ENST00000508870 TRHP20396 242 aaPredicted RBP46.44■■■■■ 5.02
NREP-216ENST00000508870 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.42■■■■■ 5.02
NREP-216ENST00000508870 CUX1P39880 1505 aa46.34■■■■■ 5.01
NREP-216ENST00000508870 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.33■■■■■ 5.01
NREP-216ENST00000508870 WDR97A6NE52 1622 aa46.25■■■■■ 4.99
NREP-216ENST00000508870 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.2■■■■■ 4.99
NREP-216ENST00000508870 GRIN2BQ13224 1484 aa46.19■■■■■ 4.99
NREP-216ENST00000508870 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.19■■■■■ 4.99
NREP-216ENST00000508870 SYNJ1O43426 1573 aa46.16■■■■■ 4.98
NREP-216ENST00000508870 SYNJ2O15056 1496 aa46.07■■■■■ 4.97
NREP-216ENST00000508870 GAPVD1Q14C86 1478 aa46■■■■■ 4.95
NREP-216ENST00000508870 PBRM1Q86U86 1689 aa45.96■■■■■ 4.95
NREP-216ENST00000508870 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.93■■■■■ 4.94
NREP-216ENST00000508870 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.85■■■■■ 4.93
NREP-216ENST00000508870 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.8■■■■■ 4.92
NREP-216ENST00000508870 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.63■■■■■ 4.9
NREP-216ENST00000508870 GRIN2AQ12879 1464 aa45.61■■■■■ 4.89
NREP-216ENST00000508870 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.54■■■■■ 4.88
NREP-216ENST00000508870 ADAMTS12P58397 1594 aa45.51■■■■■ 4.88
NREP-216ENST00000508870 CEP170Q5SW79 1584 aa45.46■■■■■ 4.87
NREP-216ENST00000508870 TOP2BQ02880 1626 aa45.44■■■■■ 4.86
NREP-216ENST00000508870 NUP160Q12769 1436 aa45.43■■■■■ 4.86
NREP-216ENST00000508870 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.42■■■■■ 4.86
NREP-216ENST00000508870 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.38■■■■■ 4.86
NREP-216ENST00000508870 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP45.35■■■■■ 4.85
NREP-216ENST00000508870 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.25■■■■■ 4.83
NREP-216ENST00000508870 SHROOM2Q13796 1616 aa45.23■■■■■ 4.83
NREP-216ENST00000508870 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP45.11■■■■■ 4.81
NREP-216ENST00000508870 JPH4Q96JJ6 628 aa45.06■■■■■ 4.8
NREP-216ENST00000508870 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.87■■■■■ 4.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.6 ms