RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508870.5

NREP-216, Transcript of neuronal regeneration related protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 4 BASIC

Gene NREP, Length 540 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NREP-216ENST00000508870 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.93■■■■■ 7.82
NREP-216ENST00000508870 ABCC9O60706 1549 aa58.03■■■■■ 6.88
NREP-216ENST00000508870 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa57.43■■■■■ 6.78
NREP-216ENST00000508870 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.93■■■■■ 6.38
NREP-216ENST00000508870 DNAJC5BQ9UF47 199 aa54.79■■■■■ 6.36
NREP-216ENST00000508870 NACADO15069 1562 aa54.43■■■■■ 6.3
NREP-216ENST00000508870 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.41■■■■■ 6.3
NREP-216ENST00000508870 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP54.05■■■■■ 6.24
NREP-216ENST00000508870 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.68■■■■■ 6.18
NREP-216ENST00000508870 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.47■■■■■ 6.15
NREP-216ENST00000508870 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.35■■■■■ 6.13
NREP-216ENST00000508870 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.88■■■■■ 6.06
NREP-216ENST00000508870 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.66■■■■■ 6.02
NREP-216ENST00000508870 SCRIBQ14160 1630 aa52.49■■■■■ 5.99
NREP-216ENST00000508870 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.46■■■■■ 5.99
NREP-216ENST00000508870 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa52.33■■■■■ 5.97
NREP-216ENST00000508870 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.27■■■■■ 5.96
NREP-216ENST00000508870 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP52.1■■■■■ 5.93
NREP-216ENST00000508870 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa50.52■■■■■ 5.68
NREP-216ENST00000508870 NCAPD3P42695 1498 aa50.27■■■■■ 5.64
NREP-216ENST00000508870 ERCC6Q03468 1493 aa50.13■■■■■ 5.62
NREP-216ENST00000508870 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.12■■■■■ 5.61
NREP-216ENST00000508870 CUX2O14529 1486 aa50.04■■■■■ 5.6
NREP-216ENST00000508870 SMARCA4P51532 1647 aa49.95■■■■■ 5.59
NREP-216ENST00000508870 SMARCA2P51531 1590 aa49.92■■■■■ 5.58
NREP-216ENST00000508870 HMGXB3Q12766 1538 aa49.84■■■■■ 5.57
NREP-216ENST00000508870 NESP48681 1621 aa49.73■■■■■ 5.55
NREP-216ENST00000508870 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.64■■■■■ 5.54
NREP-216ENST00000508870 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.63■■■■■ 5.54
NREP-216ENST00000508870 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.38■■■■■ 5.5
NREP-216ENST00000508870 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.3■■■■■ 5.48
NREP-216ENST00000508870 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP49.2■■■■■ 5.47
NREP-216ENST00000508870 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.19■■■■■ 5.47
NREP-216ENST00000508870 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.01■■■■■ 5.44
NREP-216ENST00000508870 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.99■■■■■ 5.43
NREP-216ENST00000508870 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.79■■■■■ 5.4
NREP-216ENST00000508870 WIZO95785 1651 aa48.7■■■■■ 5.39
NREP-216ENST00000508870 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.59■■■■■ 5.37
NREP-216ENST00000508870 WDR62O43379 1518 aa48.44■■■■■ 5.35
NREP-216ENST00000508870 TRIM41Q8WV44 630 aa48.34■■■■■ 5.33
NREP-216ENST00000508870 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.33■■■■■ 5.33
NREP-216ENST00000508870 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.26■■■■■ 5.32
NREP-216ENST00000508870 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.14■■■■■ 5.3
NREP-216ENST00000508870 CFTRP13569 1480 aa48.11■■■■■ 5.29
NREP-216ENST00000508870 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.01■■■■■ 5.28
NREP-216ENST00000508870 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.87■■■■■ 5.25
NREP-216ENST00000508870 OSCARQ8IYS5 282 aa47.79■■■■■ 5.24
NREP-216ENST00000508870 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.53■■■■■ 5.2
NREP-216ENST00000508870 PRDM2Q13029 1718 aa47.53■■■■■ 5.2
NREP-216ENST00000508870 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.39■■■■■ 5.18
NREP-216ENST00000508870 IFT140Q96RY7 1462 aa47.35■■■■■ 5.17
NREP-216ENST00000508870 TOPBP1Q92547 1522 aa47.29■■■■■ 5.16
NREP-216ENST00000508870 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa47.17■■■■■ 5.14
NREP-216ENST00000508870 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa47.17■■■■■ 5.14
NREP-216ENST00000508870 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa47.17■■■■■ 5.14
NREP-216ENST00000508870 ABCC8Q09428 1581 aa47.08■■■■■ 5.13
NREP-216ENST00000508870 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.05■■■■■ 5.12
NREP-216ENST00000508870 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.05■■■■■ 5.12
NREP-216ENST00000508870 ARHGEF11O15085 1522 aa46.99■■■■■ 5.11
NREP-216ENST00000508870 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.94■■■■■ 5.11e-6■■■■□ 26.3
NREP-216ENST00000508870 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.84■■■■■ 5.09
NREP-216ENST00000508870 FBLN2P98095 1184 aa46.82■■■■■ 5.09
NREP-216ENST00000508870 CYB5RLQ6IPT4 315 aa46.79■■■■■ 5.08
NREP-216ENST00000508870 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.78■■■■■ 5.08
NREP-216ENST00000508870 CHD1O14646 1710 aa46.77■■■■■ 5.08
NREP-216ENST00000508870 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.7■■■■■ 5.07
NREP-216ENST00000508870 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.6■■■■■ 5.05
NREP-216ENST00000508870 SOGA1O94964 1423 aa46.6■■■■■ 5.05
NREP-216ENST00000508870 ARAP1Q96P48 1450 aa46.51■■■■■ 5.04
NREP-216ENST00000508870 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.46■■■■■ 5.03
NREP-216ENST00000508870 TRHP20396 242 aaPredicted RBP46.44■■■■■ 5.02
NREP-216ENST00000508870 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.42■■■■■ 5.02
NREP-216ENST00000508870 CUX1P39880 1505 aa46.34■■■■■ 5.01
NREP-216ENST00000508870 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.33■■■■■ 5.01
NREP-216ENST00000508870 WDR97A6NE52 1622 aa46.25■■■■■ 4.99
NREP-216ENST00000508870 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.2■■■■■ 4.99
NREP-216ENST00000508870 GRIN2BQ13224 1484 aa46.19■■■■■ 4.99
NREP-216ENST00000508870 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.19■■■■■ 4.99
NREP-216ENST00000508870 SYNJ1O43426 1573 aa46.16■■■■■ 4.98
NREP-216ENST00000508870 SYNJ2O15056 1496 aa46.07■■■■■ 4.97
NREP-216ENST00000508870 GAPVD1Q14C86 1478 aa46■■■■■ 4.95
NREP-216ENST00000508870 PBRM1Q86U86 1689 aa45.96■■■■■ 4.95
NREP-216ENST00000508870 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.93■■■■■ 4.94
NREP-216ENST00000508870 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.85■■■■■ 4.93
NREP-216ENST00000508870 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.8■■■■■ 4.92
NREP-216ENST00000508870 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.63■■■■■ 4.9
NREP-216ENST00000508870 GRIN2AQ12879 1464 aa45.61■■■■■ 4.89
NREP-216ENST00000508870 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.54■■■■■ 4.88
NREP-216ENST00000508870 ADAMTS12P58397 1594 aa45.51■■■■■ 4.88
NREP-216ENST00000508870 CEP170Q5SW79 1584 aa45.46■■■■■ 4.87
NREP-216ENST00000508870 TOP2BQ02880 1626 aa45.44■■■■■ 4.86
NREP-216ENST00000508870 NUP160Q12769 1436 aa45.43■■■■■ 4.86
NREP-216ENST00000508870 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.42■■■■■ 4.86
NREP-216ENST00000508870 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.38■■■■■ 4.86
NREP-216ENST00000508870 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP45.35■■■■■ 4.85
NREP-216ENST00000508870 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.25■■■■■ 4.83
NREP-216ENST00000508870 SHROOM2Q13796 1616 aa45.23■■■■■ 4.83
NREP-216ENST00000508870 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP45.11■■■■■ 4.81
NREP-216ENST00000508870 JPH4Q96JJ6 628 aa45.06■■■■■ 4.8
NREP-216ENST00000508870 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.87■■■■■ 4.77
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