Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y535

POLR3H, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3HQ9Y535 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR3HQ9Y535 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR3HQ9Y535 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR3HQ9Y535 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR3HQ9Y535 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR3HQ9Y535 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR3HQ9Y535 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR3HQ9Y535 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR3HQ9Y535 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR3HQ9Y535 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR3HQ9Y535 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR3HQ9Y535 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR3HQ9Y535 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR3HQ9Y535 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR3HQ9Y535 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR3HQ9Y535 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR3HQ9Y535 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR3HQ9Y535 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR3HQ9Y535 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR3HQ9Y535 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR3HQ9Y535 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR3HQ9Y535 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR3HQ9Y535 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR3HQ9Y535 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR3HQ9Y535 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR3HQ9Y535 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR3HQ9Y535 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR3HQ9Y535 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR3HQ9Y535 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR3HQ9Y535 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR3HQ9Y535 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR3HQ9Y535 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR3HQ9Y535 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR3HQ9Y535 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR3HQ9Y535 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR3HQ9Y535 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR3HQ9Y535 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR3HQ9Y535 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR3HQ9Y535 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR3HQ9Y535 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR3HQ9Y535 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR3HQ9Y535 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR3HQ9Y535 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR3HQ9Y535 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR3HQ9Y535 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR3HQ9Y535 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR3HQ9Y535 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR3HQ9Y535 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR3HQ9Y535 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR3HQ9Y535 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR3HQ9Y535 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR3HQ9Y535 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
POLR3HQ9Y535 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
POLR3HQ9Y535 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3HQ9Y535 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3HQ9Y535 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3HQ9Y535 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3HQ9Y535 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POLR3HQ9Y535 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR3HQ9Y535 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR3HQ9Y535 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR3HQ9Y535 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR3HQ9Y535 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POLR3HQ9Y535 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POLR3HQ9Y535 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3HQ9Y535 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3HQ9Y535 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
POLR3HQ9Y535 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POLR3HQ9Y535 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLR3HQ9Y535 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR3HQ9Y535 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR3HQ9Y535 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR3HQ9Y535 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3HQ9Y535 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3HQ9Y535 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3HQ9Y535 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3HQ9Y535 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3HQ9Y535 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3HQ9Y535 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3HQ9Y535 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3HQ9Y535 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3HQ9Y535 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3HQ9Y535 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3HQ9Y535 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3HQ9Y535 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3HQ9Y535 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3HQ9Y535 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3HQ9Y535 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3HQ9Y535 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3HQ9Y535 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3HQ9Y535 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3HQ9Y535 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3HQ9Y535 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3HQ9Y535 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3HQ9Y535 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3HQ9Y535 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3HQ9Y535 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3HQ9Y535 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR3HQ9Y535 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR3HQ9Y535 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms