Protein–RNA interactions for Protein: Q99705

MCHR1, Melanin-concentrating hormone receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCHR1Q99705 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCHR1Q99705 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCHR1Q99705 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MCHR1Q99705 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCHR1Q99705 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCHR1Q99705 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCHR1Q99705 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCHR1Q99705 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCHR1Q99705 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MCHR1Q99705 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCHR1Q99705 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MCHR1Q99705 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MCHR1Q99705 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCHR1Q99705 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MCHR1Q99705 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MCHR1Q99705 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCHR1Q99705 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCHR1Q99705 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCHR1Q99705 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCHR1Q99705 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCHR1Q99705 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCHR1Q99705 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCHR1Q99705 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCHR1Q99705 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCHR1Q99705 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MCHR1Q99705 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MCHR1Q99705 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCHR1Q99705 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCHR1Q99705 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCHR1Q99705 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCHR1Q99705 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCHR1Q99705 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCHR1Q99705 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCHR1Q99705 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCHR1Q99705 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCHR1Q99705 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCHR1Q99705 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCHR1Q99705 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCHR1Q99705 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCHR1Q99705 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCHR1Q99705 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCHR1Q99705 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MCHR1Q99705 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCHR1Q99705 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCHR1Q99705 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCHR1Q99705 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCHR1Q99705 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCHR1Q99705 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCHR1Q99705 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCHR1Q99705 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCHR1Q99705 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCHR1Q99705 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCHR1Q99705 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCHR1Q99705 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCHR1Q99705 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCHR1Q99705 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCHR1Q99705 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCHR1Q99705 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCHR1Q99705 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCHR1Q99705 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCHR1Q99705 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MCHR1Q99705 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCHR1Q99705 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCHR1Q99705 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCHR1Q99705 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCHR1Q99705 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCHR1Q99705 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCHR1Q99705 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCHR1Q99705 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCHR1Q99705 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCHR1Q99705 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCHR1Q99705 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCHR1Q99705 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCHR1Q99705 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCHR1Q99705 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCHR1Q99705 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCHR1Q99705 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCHR1Q99705 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCHR1Q99705 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCHR1Q99705 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCHR1Q99705 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCHR1Q99705 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCHR1Q99705 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCHR1Q99705 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCHR1Q99705 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCHR1Q99705 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCHR1Q99705 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCHR1Q99705 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCHR1Q99705 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCHR1Q99705 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCHR1Q99705 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCHR1Q99705 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCHR1Q99705 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCHR1Q99705 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCHR1Q99705 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCHR1Q99705 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCHR1Q99705 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCHR1Q99705 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCHR1Q99705 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCHR1Q99705 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 211.2 ms